太平天國是清朝後期的一次由農民起義創建的農民政權，也是清朝歷史上最大規模的農民戰爭。對於太平天國運動，清朝政府全力進行了剿殺。
在剿殺的過程中，一部分太平軍將士因為各種原因，被清軍俘虜。這就是我們通常所稱的戰俘。清軍如何對待這些被俘的太平軍將士呢？
應該說，在太平天國運動前期，處於瓦解敵人鬥志、籠絡人心的需要，清軍對被俘的太平軍將士還網開一面，放一條生路。但是，隨著太平天國發生內訌，太平軍又連吃敗仗，清軍已經掌握了戰場主動權後，就開始對被俘的太平軍痛下殺手了。
對於被俘的太平軍高級將領，清軍一般就是凌遲處死。凌遲又名「寸磔」，即俗話所說的「千刀萬剮」。這是一種慘無人道的死刑。反映了清廷對太平天國運動極端痛恨的心理。
1853年，洪秀全派林鳳祥、李開芳、吉文元等率2萬多人北伐。北伐軍在孤軍奮進、缺乏後援的情況下，最終全軍覆沒。太平軍首領林鳳祥、李開芳等先後被俘。他們都被押解到北京，凌遲示眾。
其後，太平天國翼王石達開、英王陳玉成，捻軍首領張洛行、賴文光，他們被俘後都受到了凌遲之刑。就連洪秀全16歲的兒子幼天王洪天貴福，被俘後即被凌遲處死於南昌。
對於被俘的一般將士，清軍則採取大規模集體屠殺的方法。
1863年，李鴻章率領淮軍和洋槍隊圍攻蘇州。蘇州「四王」、「四大天將」與主帥譚紹光一直不和，在李鴻章的誘降下，殺掉譚紹光，向清軍投降。李鴻章兵不血刃拿下江蘇重鎮蘇州。可是，李鴻章根本就沒有履行誘降時的承諾，而是設計殺害了「四王」、「四大天將」。與此同時，清軍在城內大開殺戒,城內數萬太平軍守軍在毫無戒備中被誅殺。
這事幹得太齷齪，連洋槍隊首領戈登都看不下去了。戈登勃然大怒，因為，是他信誓旦旦地為投降太平軍做擔保。他一怒之下，提槍要找李鴻章算帳。李鴻章不得不躲了起來。
在如何對待太平軍戰俘上，僧格林沁最殘忍。哪怕是太平軍主動投降，也不能得到他的寬恕。1855年2月18日，太平軍北伐失利，林鳳祥部兩軍帥、前清縣丞蕭鳳山和附生鐘有年等帶領水手91人出降。僧格林沁傳令，除年老和15歲以下孩子不殺外，蕭風山凌遲，其餘斬首。
隨後，太平軍又有200餘將士投降，均被僧格林沁誅殺。
值得一提的是，太平天國運動發起之初，太平軍中就有一支女兵部隊。她們大部分是廣西客家女子。由於不纏足，清軍稱她們為「大腳蠻婆」。幾年下來，太平軍的女兵部隊數量一度達到10多萬人。她們作戰頑強，讓清軍很是頭疼。
1864年，天京被清軍攻陷。清軍對天京進行屠城。太平軍女兵除少部分自焚而死外，大部分女兵為清軍所俘虜。她們的命運可想而知。她們往往被輪姦、遊街，然後凌遲處死。