室內空氣微生物的時空分布比大氣中微生物分布更加複雜，因為微小環境中，各種因素對空氣微生物的影響都會產生決定性的影響。此外，室內小環境的種類繁多，大小不一，其內人員活動也千差萬別。因此，室內空氣微生物與室外比有其特異性。
空氣中微生物質量的好壞往往以細菌總數指標來衡量，一般情況下空氣中的細菌總數越高，存在致病性微生物（細菌、真菌、病毒）的可能性越高，可使人感染而致病。
很多因素影響室內空氣中細菌數量，如房間大小、室內人員多少、通風換氣情況、採光、室內溫度、溼度、灰塵含量、周圍環境等。保空服務是一個系統性的工作，因此，室內細菌總數根據上述情況值變化較大。
蘇聯學者提出夏季室內空氣中細菌總數≥2500CFU/m3為汙染空氣。
香港室內空氣品質標準規定，空氣品質十分良好時空氣中細菌總數應小於500CFU/m3，室內空氣品質能保證大眾健康時，空氣中細菌總數應小於1000CFU/m3。
辦公樓實地採樣20%的樣品超過1000CFU/m3。
我國公共場所衛生標準中對旅店業室內空氣中細菌總數作出規定，採用撞擊法採樣時，普通旅店、招待所應小於2500CFU/m3。
第二軍醫大學等單位對我國人防工事空氣中微生物進行了深入研究並提出了細菌衛生標準。
採用撞擊法採樣時，作為醫院的人防工事空氣中細菌總數應小於1500CFU/m3，作為招待所、商場、俱樂部、影劇院、遊樂場、地鐵車站等應小於4000CFU/m3。
自然情況下，人類呼吸道傳染病絕大部分是在室內傳播感染的，致病菌在室內的空氣傳播感染是個最重要的研究內容。如果說室外空氣徽生物對動物和植物的作用比較常見，那麼室內空氣微生物對於人類衛生保健的影響就更為重要。
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人類呼吸道感染是人類最常見的疾病，其症狀可從隱性感染直到威脅生命。迄今已知，僅引起呼吸道病毒感染的病毒就有200種之多，這些感染的發生絕大部分是在室內通過空氣傳播的，保空服務是一個針對室內空氣保護系統性的工作一年四季均可發生，冬春季節更為多見。