「本文作者蔡姝凝,36氪資深作者。VR怎麼能夠幫助研發新冠藥物呢?該公司對36氪表示,平臺的做法是,用虛擬實境幫助人們將蛋白質、化合物、核酸可視化,組成形象的「實時動畫」,幫助科學家在分子水平的微小世界中,理解化合物的互動方式,並且允許研發者修改、模擬化合物的作用過程。
以下為正文,Enjoy~」
我們知道,藥物研發需要漫長的過程,長達數年至十數年之久,為了加快進度,人工智慧或許能幫上忙。
通俗地解釋AI+新藥研發,就是運用人工智慧,對5000-10000個化合物進行「虛擬」篩選。即不做部分的實驗,而是利用資料庫做分析,大大加速研發進度。這儼然形成了一個賽道,聚集了國內外初創企業,頭部玩家已經進入B/C輪,累計融資數億元。
近日,36氪發現,繼人工智慧之後,虛擬實境也來幫助研發藥物了。在美國加州聖地牙哥的一家名為Nanome虛擬實境初創公司,正在幫助研發適用於新冠肺炎的藥物。
VR怎麼能夠幫助研發新冠藥物呢?該公司對36氪表示,平臺的做法是,用虛擬實境幫助人們將蛋白質、化合物、核酸可視化,組成形象的「實時動畫」,幫助科學家在分子水平的微小世界中,理解化合物的互動方式,並且允許研發者修改、模擬化合物的作用過程。
換句話說,這個VR平臺促進了數據的有效通信,並且具備了現有的計算化學工作流程需要的功能。Nanome是第一家推出這種沉浸式實時科學發現協作平臺的VR公司,目前全球已有多家製藥和生物技術公司採用了這項解決方案。
36氪觀察到,今天,Nanome與人工智慧新藥研發公司Insilico Medicine,合作發布了一篇研究論文,描述了10種針對SARS-CoV-2主要蛋白酶的、潛在的小分子抑制劑。可以理解成,發現了10種可能治療新冠肺炎的治療方案。
研究認為,三分之二的SARS-CoV-2基因組包含非結構蛋白,如病毒蛋白酶(病毒複製所必需的蛋白質),這是不可忽視的潛在治療靶點。
「SARS-CoV-2主要蛋白酶是一種比spike蛋白更具藥物可利用性的蛋白質」,這篇論文的主要作者、Insilico執行長Alex Zhavoronkov博士對36氪說道,「它含有一個非常適合小分子抑制劑的口袋。對新冠肺炎治療方法的初步研究主要依賴於藥物重組候選物的確定,但我們正在進行新的嘗試,以開發新的類藥物分子」。
以往,對SARS冠狀病毒和MERS冠狀病毒的研究主要集中在利用蛋白酶抑制劑(通過幹擾病毒的複製能力來抑制病毒)開發小分子療法上,但自從新冠肺炎爆發以來,對SARS-CoV-2蛋白酶抑制劑的研究尚不多見發布。
Insilico Medicine在去年完成了創新工場、啟明創投等投資的3700萬美元B輪融資,並與輝瑞、安斯泰來、勃林格殷格翰等國際大型藥企籤訂了合作協議。