明朝四大特務機構分別是：錦衣衛、東廠、西廠、內行廠。可以說當這四個機構並存的時候，也是中央集權最甚之時。政治高度緊張，人人自危。
錦衣衛
錦衣衛，是明代專有軍政特務機構，其前身為朱元璋設立的「拱衛司」，後改稱「親軍都尉府」。錦衣衛主要職能為「掌直駕侍衛、巡查緝捕」，其首領稱為錦衣衛指揮使，一般由皇帝的親信武將擔任，直接向皇帝負責。洪武二十年（1387年），朱元璋下令焚毀錦衣衛刑具，所押囚犯轉交刑部審理；同時下令內外獄全部歸三法司審理，將錦衣衛廢除。明成祖時，錦衣衛又得以恢復，並由北鎮撫司專門處理詔獄。有明一代，錦衣衛一直存在。
他們直接聽命於皇帝，可以逮捕任何人，包括皇親國戚，並進行不公開的審訊。也有參與收集軍情、策反敵將的工作，如在萬曆朝鮮戰爭中收集了大量的日軍軍情。延續至1661年南明永曆帝的錦衣衛指揮使馬吉翔與掌衛事任子信於咒水之難被殺才可說是正式結束長達290年的歷史。
清朝入關以後，仿效明朝制度，仍然設立錦衣衛。順治二年（1645年），改稱鑾儀衛。清朝的錦衣衛僅存在一年。
東廠
永樂十八年（1420年）十二月，明成祖朱棣為了鎮壓政治上的反對力量，決定設立一個稱為「東緝事廠」，簡稱「東廠」的新官署，命所寵信宦官擔任首領。建立東廠還有監視錦衣衛的意圖。東廠建立更深的背景是明代加強中央集權。
東廠的職能是「訪謀逆妖言大奸惡等，與錦衣衛均權勢」。一人掌理，委以緝訪刺探的大權。東廠的偵緝範圍非常廣：一、朝廷會審大案、錦衣衛北鎮撫司拷問重犯，東廠都要派人聽審。二、朝廷的各個衙門都有東廠人員坐班，監視官員們的一舉一動。
東廠的首領稱為東廠掌印太監也稱廠公或督主，是宦官中僅次於司禮監掌印太監的第二號人物。通常以司禮監秉筆太監中位居第二、第三者擔任，其官銜全稱為「欽差總督東廠官校辦事太監」，簡稱「提督東廠」。
除此以外，設掌班、領班、司房四十多人，由錦衣衛撥給，分為子醜寅卯十二顆，顆管事戴圓帽，著皂靴，穿褐衫。其餘的人靴帽相同，但穿直身。
具體負責偵緝工作的是役長和番役，役長相當於小隊長，又叫「檔頭」，共有一百多人，也分子醜寅卯十二顆，一律戴尖帽，著白皮靴，穿褐色衣服，系小絛。役長各統帥番役數名，番役又叫「番子」，又叫「幹事」，這些人也是由錦衣衛中挑選的精幹分子組成。
東廠不僅在機構及人員配置上更加精幹合理，而且在偵緝行動上制訂了相當嚴密的制度。如每月初一東廠都要集中布置當月的偵緝工作，廠役在東廠內抽籤決定所負責的地盤。在文獻記載中可以發現，東廠廠役的工作種類都有特殊的名稱。例如監視朝中各部官員會審大獄及錦衣衛拷訊罪犯者名為「聽記」，在各處地方官府訪緝者名為「坐記」，還有某位官員有何舉措，或某城門捕得要犯，胥吏記錄上報東廠者名為「打事件」。
西廠
西廠是明朝特有的官署名稱，全稱"西緝事廠"。明憲宗時為加強特務統治，於成化十三年（1477年）於東廠之外增設西廠，與東廠及錦衣衛合稱廠衛，用太監汪直為提督，其權力超過東廠，活動範圍自京師遍及各地。後因遭反對，被迫撤銷。正德元年短暫復開五年後又被撤銷。
西廠直接聽命於皇帝，不受其他任何機構和個人的節制。西廠作為一個短命的特務機構，前後只有兩任提督，分別是汪直和劉瑾。
到了憲宗的孫子武宗繼位後，大太監劉瑾掌權，宦官勢力再度興起，正德元年（1506年），西廠復開，由太監谷大用領導。好笑的是，西廠與東廠雖然都受劉瑾的指揮，但兩者之間不是互相合作，而是爭權奪利，互相拆臺。為了改變這種情況，劉瑾又自建了一個內行廠，由本人直接統領，其職能與東、西兩廠一樣，但偵緝範圍更大，甚至包括東西廠和錦衣衛。一時間，錦衣衛、東西廠、內行廠四大特務機構平存，緹騎四出，天下騷動。
正德五年，劉瑾倒臺，明武宗下令撤銷西廠和內行廠。西廠作為一個臨時產品，就這樣在歷史上永遠地消失了。
內行廠
廠衛是明代特務政治的工具，是皇帝的耳目和爪牙。東廠、西廠和內行廠的頭目，多由司禮監太監充任。明武宗正德初年，以當時八虎之一的馬永成掌管東廠，以八虎的另一成員谷大用掌管西廠。當時司禮監太監劉瑾因與他們有矛盾，又在京師榮府舊倉地（即四司之一的惜薪司）另設內行廠，自成系統，偵緝範圍比錦衣衛、東廠和西廠三個特務機構還要大，除監察臣民外，錦衣衛、東廠和西廠也在監察之例，權勢居東、西廠之上，用刑尤為酷烈。錦衣衛偵伺一切官民，廠則偵察官民和錦衣衛；西廠有時還監視東廠，內行廠則監視官民和廠衛，而皇帝直接領導與監督所有偵察機關，構成一套偵察特務體系。
正德五年劉瑾倒臺後，內行廠與西廠亦一同被裁撤。雖然內行廠僅存在五年，但亦殘害了不少忠良。