微生物存在於世界的各個角落，在醫療健康、環境治理、農業種植、工業生產等諸多領域發揮著舉足輕重的作用。近年來，隨著測序技術的發展，對於微生物組學的研究持續火熱，微生物存在於世界的各個角落，在醫療健康、環境治理、農業種植、工業生產等諸多領域發揮著舉足輕重的作用。成為了科研工作者必不可少的研究技術。然而，對技能的要求也是越來越高，尤其在資料庫建立、程式語言開發、繪圖工具使用技巧及算法模型選擇成為廣大科研工作者面臨的具體問題。
本次生信培訓班分為四個階段
1、掌握必備的基礎知識
如微生物組研究現狀與應用、分析流程、方案設計以及Linux的常用操作和軟體安裝等。
2、掌握16S以及宏基因組數據分析結果及應用
深度剖析16S與宏基因組建庫測序原理及分析結果解讀，深度詮釋各個分析結果。
3、手把手帶你進行微生物組學數據的分析
包括微生物多樣性測序數據處理和宏基因組數據分析，如原始數據的質控和拼接、OTU聚類、物種注釋、宏基因組數據的組裝、基因預測以及基於物種豐度、功能豐度表進行的有效信息的統計分析。
4、深度體驗微生物組大數據挖掘的奧秘
基於豐富的項目分析經驗，針對不同研究目的，提供專業性分析方案及數據深度挖掘思路，並通過不同軟體進行結果可視化。
主辦單位：北京市計算中心
協辦單位：北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心
雲計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室
北京市計算中心—工信部和信息化人才培養工程培訓基地
北京市計算中心—北京市大數據教學實踐基地
舉 辦 地：北京市海澱區豐賢中路7號北科產業3號樓
課程安排：2021年3月17-19日 上午9:30-11:30 下午13:30-17:00
日期
主題
內容
備註
第一天
微生物組學研究現狀及應用
1、微生物組學研究現狀及應用
2、微生物組數據分析流程設計
3、常用資料庫介紹
4、方案設計與案例分享
理論+
上機操作
微生物組學數據分析上機基礎
1、Linux常用命令使用和上機操作
2、Linux環境下軟體安裝
微生物多樣性數據分析
1、質控流程：雙端序列合併、提取barcode、質控、樣品拆分、切除引物
2、生成OTU：序列格式轉換、去冗餘、聚類生成OTU
3、OTU篩選：嵌合體生成原理及去除方法、篩選細菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表
4、物種注釋及進化樹構建
5、常用Alpha多樣性指數計算
6、常用Beta多樣性距離矩陣計算
7、統計分析
7.1、箱線圖展示Alpha多樣性及組間比較統計
7.2、散點圖展示樣品及組間主坐軸分析(PCA/PCoA/NMDS)
7.3、樣品與組間相關分析，並用熱圖可視化結果
演示+
上機操作
第二天
宏基因組數據分析與結果解讀
1、宏基因組分析基本策略
2、數據質量評估
3、數據質量過濾
4、宿主汙染過濾
5、數據組裝
6、基因預測
7、物種注釋（MEGAN、Krona）
8、功能注釋（KEGG、eggNOG）
9、統計分析
9.1、樣本聚類分析（物種、功能、基因）
9.2、差異分析（物種、功能、基因）
演示+
上機操作
第三天
數據挖掘與可視化實現
1、R繪圖功能在微生物組學信息分析中的應用
韋恩圖、花瓣圖、散點圖、熱圖、盒形圖（箱線圖）等
2、網絡分析（MENA、Igraph、Cytoscape）
3、物種與樣本關係Circos分析
4、差異物種分析LEfSe分析
5、KEGG和COG預測分析
PIRUSt預測及STAMP
6、進化分析ITOL
演示+
上機操作
註：課程以實際發生為準；若調，會提前通知。
【報名費用】
註冊費：4200元/人（含當期聽課費、資料費、證書費、考試費（如有））。培訓期間，免費提供工作午餐。
提供當期視頻回放以供複習使用（北京市計算中心羽林學院平臺）。
開具增值稅發票，提供蓋章通知、結業證書等相關材料。
【報名優惠政策】
1、3人以上團體報名每人可減少300元；
2、4+1團報，可免費贈送一個名額；
3、上面優惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；
老學員參加及推薦學員參加均可額外優惠200元。
培訓以收到學員培訓費為成功報名，培訓座位按收到費用先後順序安排。
【付費方式】
現金、支票、銀行轉帳、銀行匯款、現場刷卡
單位全稱：北京市計算中心
帳號：0200151819100023937
開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行
（匯款信息備註：「生物計算——您的姓名」,個人匯款請備註單位名稱）
註：款項支出後，請提供付款回執給工作人員，方便核實到帳、開具發票。
【掃碼報名】
【諮詢請聯繫】
QQ號：2814500767
郵箱：bcc-sxpx@bcc.ac.cn
徐老師 010-59341786，15801436028（微信同號）
員老師 010-59341773，18701529461（微信同號）
【注】開課前一周會發送郵件通知；若未接到郵件通知，請電話諮詢。
2021上半年"特色生信培訓"課程安排（課後提供視頻回放以供複習使用）：
2021.01.18-22實用生物信息學研討班
2021.01.25-28轉錄組學專題實戰班
2021.03.02-05生物醫學公共數據深度挖掘及應用培訓班
2021.03.10-12計算機輔助藥物設計（CADD）——蛋白質分子對接和網絡互作研討班
2021.03.17-19微生物組學數據分析與挖掘專題培訓班
2021.03.23-26Python人工智慧+生物醫藥高級研修班
2021.03.24-26 10X Genomics單細胞轉錄組測序及多組學數據挖掘技術培訓班
2021.03.31-02基因組關聯分析技術應用培訓班
2021.04.07-09生命科學的數據可視化與科研作圖—實用工具與技巧實戰班
2021.04.14-16多組學數據分析及挖掘培訓班
2021.04.21-23計算生物學——生物分子結構預測和動力學模擬研討班
2021.04.26-29R語言數據分析與可視化高級研修班
【統計學】實用醫學統計學系列培訓班——基礎統計學（3.16-19）
【統計學】實用醫學統計學系列培訓班——高級統計學（核心篇；4.19-23）
【統計學】實用醫學統計學系列培訓班——高級統計學（提高篇；5.10-14）
【新系列】遺傳流行病學系列培訓班——遺傳流行病學基礎知識板塊（基礎篇；4.28-29）
【新系列】遺傳流行病學系列培訓班——遺傳流行病學（核心篇；5.24-28）
【新系列】遺傳流行病學系列培訓班——遺傳流行病學（提高篇；6.21-25）
2021.05.05-07轉錄組學專題實戰班
2021.05.17-21實用生物信息學研討班
2021.06.01-04生物醫學公共數據深度挖掘及應用培訓班
2021.06.08-11實用醫學統計學系列培訓班——基礎統計學
2021.06.09-11計算機輔助藥物設計（CADD）——蛋白質分子對接和網絡互作研討班
2021.06.15-18Python人工智慧+生物醫藥高級研修班
2021.06.16-18微生物組學數據分析與挖掘專題培訓班
2021.06.30-02 10X Genomics單細胞轉錄組測序及多組學數據挖掘技術培訓班
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