當前，學術期刊普遍採取網絡化投稿方式，編輯也採取多種新媒介與作者進行交流互動，因此，傳統的書信、電話等退稿方式讓位於新媒體退稿方式。新媒體下編輯退稿時普遍存在以下幾種問題：
（1）退稿過於迅速。在線投稿系統的採用，使得作者投稿和編輯稿件處理可即時完成。作者在線投稿後，由於編輯處理速度快，稿件當天被期刊編輯退稿。而編輯僅以「不適合本刊選題」幾個字回復作者，容易給讀者造成「編輯不認真審稿」的印象。
（2）退稿超過限期。在線投稿系統中能透明顯示各個階段的審稿期限，讓作者監督；不同學術期刊審稿周期也會在期刊官方網的投稿須知裡公布。一些期刊編輯對作者來稿處理較慢，甚至超過編輯部所規定的審稿周期，超期後才給作者退稿通知，並在退稿通知中也沒作任何解釋，或只是簡單一句「稿件選題不適合本刊，建議另投他刊」。這種對作者不負責的退稿方式，容易導致作者對期刊忠誠度的降低。
（3）退稿言語過於簡單。在線投稿系統中有退稿模板，只需在相應的選框中選取退稿類型，即可回復；電子郵件投稿中，其退稿通知也可事先備好退稿模板，直接複製、粘貼模板文字。這些情況實際上是模板化的退稿方式，即事先已經定好回復格式，一經複製或選中就完成退稿流程，不少期刊退稿時僅套用一句模板化的退稿句子：「您的稿件經審閱，不符合我刊要求，建議改投他刊」。這類退稿通知中沒有說明任何退稿理由，讓作者失望。
（4）約定式退稿。約定式退稿或默認退稿採取約定自然淘汰方式，作者在線投稿後，投稿系統自動回復作者一封電子郵件，在電子郵件中「敬告作者: 您的論文已收到。若3 個月之內未收到錄用通知, 請自行處置」；這是一種非人性化、消極的退稿方式，不利於期刊發展，不值得提倡。
（5）石沉大海式退稿。作者投稿後，論文猶如石沉大海，作者既不知道審稿狀態，也不知道審稿期限，無法決定是該改投還是繼續等待結果。
原因分析：退稿中存在的問題，暴露了學術期刊的服務理念、編輯素養等方面有待改進。
學術期刊服務理念不到位：期刊核心競爭力來自於優質稿件，作者是期刊的生命線，沒有作者來稿，期刊如無米之炊。然而，當前學術期刊由於在稿件供求關係中處於主動地位，很多期刊的服務理念沒跟上；作者處於被動地位，面對簡單粗暴的退稿方式只能一聲嘆息。
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