配育員新手，必須學習貓的顏色是如何遺傳。首先需必須清楚不同顏色和圖案是長成什麼樣子。最少需要知道計劃中選育的品種的顏色。不同的顏色都可以從貓展中學習-如果您不肯定貓的顏色、或想知道您是否猜對，可以詢問貓主。可能您的貓會可以安排一些顏色分類的研討會？
當您已經知道有哪些不同的顏色後，是時候了解顏色遺傳學。
原本馴養家貓是棕色深淺環紋短毛貓。所有其他的顏色和品種都是後來基因突變而成。
紅色或黑色色素
您所認識的貓有許多不同的顏色，但實際上只有兩種不同的色素：黑色素 eumelanin、和紅褐色的紅/黃色色素 phaeomelanin。雄貓只可以擁有一種色素，而雌貓可以同時擁有兩種（玳瑁 tortoiseshell和龜甲色tortie）。這是由於色素種類的基因是位於x-染色體上。這是性聯遺傳的原因。雄性只有一條 x-染色體和一條 y-染色體，因此只可以擁有黑色色素的等位基因、或紅/黃色色素的等位基因的任何其中一個而已。另一方面雌性擁有兩條 x-染色體，可以同時擁有黑色的等位基因和紅/黃色色素的等位基因。沒有任何的等位基因隱藏其他等位基因，因此貓咪會擁有紅褐色和黑色-龜甲色。雌性當然可以在兩條x-染色體上都擁有黑色的等位基因。她將會是黑色。她也可以在兩條染色體上同時擁有紅褐色色素的基因，而她將會是紅褐色。
名稱: Xr = x-染色體帶有嗜鉻黑色素的等位基因，紅褐色色素
Xb = x-染色體帶有黑色素，黑色色素
Y = y-染色體，不帶有色素的基因
非此即彼: O =紅色（橙色）
o =黑色
請緊記，雄性一定是從他的父親承襲 y-染色體，因此他的 x-染色體將會來自他的母親。一隻雄貓的色素將會來自他的母親，而他將不會遺傳得到父親的色素。另一方面一隻雌貓會從他的父親得到一條 x-染色體。因此她承襲了父親的色素。同時她也從母親得到一條 x-染色體。因此她承襲了父親和母親的染色體。請注意，這只是在 x-染色體上的基因才會出現的情況，因此只有貓的顏色是紅色或黑色才有影響。其他如：銀影色、深淺環紋/非深淺環紋、稀釋等都跟性聯遺傳無關。
例如：一隻玳瑁色的雌貓與一隻黑色的雄貓交配。雌貓可以給幼貓 Xb 或 Xr。而雄性可以給 Xb 或 Y。
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| | Xb | Y |
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| Xb | XbXb | XbY |
| | 黑色，雌性 | 黑色，雄性 |
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| Xr | XbXr | XrY |
| | 玳瑁色，雌性 | 紅色，雄性 |
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得出黑色雌性的機會是四分一，25%、得出黑色雄性的機會是四分一，25%，得出玳瑁色雌性、和紅色雄性的機會率也是一樣。
深淺環紋或非深淺環紋
深淺環紋的貓，一部分的毛髮有條紋，而其他部分則是全條毛髮都是統一的顏色。以棕色深淺環紋貓/斑紋貓為例，黑色的部分的毛髮顏色是全黑，而棕色的部分大部分都是黑色和棕色環紋的毛髮。
非深淺環紋相對棕色深淺環紋而言是黑色。非深淺環紋的等位基因是隱性的。父母雙方都必須帶有非深淺環紋等位基因而出現非深淺環紋的後代。
非深淺環紋基因在紅色的貓身上所起的作用不大。非深淺環紋紅色的貓都會出現斑紋，有如他們是擁有深淺環紋等位基因。判斷一隻紅色的貓是深淺環紋或非深淺環紋，一般是觀察在鼻子和口之間的地區。一隻深淺環紋紅色的貓在這一個部位都會是白色或非常淺的顏色；而非深淺環紋紅色的貓在這一個部位的顏色跟面部其他的顏色差不多是一樣的。這一種區別方法同樣可以應用在奶油色的貓。如果貓是紅-白或奶油-白，而有白斑在鼻子上，當然不能利用這一個方法判斷貓是或非深淺環紋。可以觀察耳朵的周邊-深淺環紋貓在這一個部分是比非深淺環紋的貓淺色。
名稱：A =深淺環紋
a =非深淺環紋
斑紋
深淺環紋貓可以是：大斑點 blotched（或經典classic）虎斑、鯖魚虎斑 mackerel tabby、梅花 spotted、或多層色虎斑（阿比西尼亞貓 Abyssinian）。
鯖魚虎斑，顧名思義，貓的身上有垂直相對小的條紋。大斑點或經典虎班擁有較大面積斑點和出現更像大理石紋理的圖案。梅花虎班，意味著貓身上有梅花點；和多層色虎班貓在沿著背部一直到尾巴的端都有深色的條紋，而其他部分是純深淺環紋而沒有任何斑點。阿比西尼亞貓和索馬利貓Somali都是擁有多層色虎班的品種，這種圖案一般都稱為阿比西尼亞。
三種圖案：大斑點虎班、鯖魚虎斑、多層色虎班，都是在同一個基因座上的三種不同的等位基因。多層色虎班隱藏其他兩種、鯖魚虎斑隱藏大斑點虎班。
名稱: Ta = Aby圖案、多層色虎班
T =鯖魚虎斑
t (alt. tb ) =經典/大斑點虎班
沒有人知道是什麼基因令梅花點虎班貓出現。可能有一個或多個基因將鯖魚虎斑的紋理變成斑點。一般認為擁有虎班為基本的梅花點虎班貓擁會有更清晰的梅花點。貓同時擁有條紋和梅花點是司空見慣的事情，因此決定一隻貓是鯖魚虎斑或梅花點可以是挺困難的事情。
稀釋基因
稀釋基因將顏色淡化。由於色素顆粒變成塊狀。對視覺而言，皮毛的顏色看起來較淺，以同樣的方法混合黑白色素的顆粒出現沙狀的灰色。稀釋的等位基因是隱性的。令一隻黑色的貓變成藍色、紅褐色的貓變成奶油色。棕色虎班貓變成藍色虎班。
名稱：D=非稀釋，黑/紅褐
d=稀釋，藍/奶油
巧克力色和肉桂色/慄色基因
巧克力色的等位基因是另一個在稀釋等位基因以外，令毛髮的顏色更加淡化的原因。在巧克力色的貓，黑色色素的顆粒，一般是呈圓形，和略扁平。這樣使更多的光線節射-令皮毛看起來更淺色。這等位基因也是隱性的。如非受著這基因影響，貓本來是黑色，受基因影響的貓顧名思義，變成巧克力色。藍色的貓變成淡紫色。巧克力色等位基因在紅褐色色素上起不了大作用，因此紅褐色的貓還是紅褐色，和奶油色還是奶油色。巧克力色等位基因最先出現在暹羅貓身上，因此可以在所有承認容許擁有暹羅重點色的品種中看見。同時跟暹羅貓品種有密切關係的東方短毛貓 Oriental Shorthairs 中出現。
肉桂色/慄色等位基因比巧克力色基因更進一步地將色素顆粒壓得更扁平，令皮毛的顏色看起來更淡。這一種等位基因相對巧克力色等位基因和正常色素等位基因而言是隱性的。一隻擁有這種顏色的東方貓被稱為肉桂色，完美地描述了貓的顏色。阿比西尼貓的慄色與東方貓的肉桂色是完全相同，但是，由於阿比西尼貓是多層色虎班，而東方貓是非深淺環紋，他們看起來並不相似。前者阿比西尼貓的慄色稱為紅色，但配育員後來很快地就意識到，由於阿比西尼貓從來沒有出現任何玳瑁色的貓，他們絕不可能是遺傳得出紅色。
一隻稀釋顏色帶有肉桂色/慄色純合等位基因的貓稱為淡黃褐色 fawn。這一隻貓可以說是更像米色或象牙白色。這一種基因對紅色和奶油色起不了作用。
名稱B =正常色素，黑色
b =巧克力色（棕色）
bl =肉桂色/慄色（淡棕色）
白化系列
（喜馬拉雅/暹羅色、緬甸色、白化）
白化系列有五種等位基因。正常顏色，如：黑色，是顯性的，由C代表；cb 是令顏色如緬甸色的淺色；cs 是暹羅色； ca 讓白色的貓擁有藍色眼睛，白化藍眼睛，不要將這種貓跟一般顯性白色擁有藍眼睛的貓混淆；最後的基因稱為c，是真正的白化貓，貓擁有紅色眼睛。
cb等位基因可以完全隱藏cs的等位基因。擁有cbcs基因型的貓，擁有緬甸色和暹羅的重點色的貓。眼睛的顏色是綠寶石色。這種顏色是一個還沒有被 FIFe 承認的特別品種。稱為東奇尼貓（Tonkinese）並且不是純種貓。兩隻東奇尼貓交配，有25%機會出現暹羅貓重點色的幼貓，50%的機會出現東奇尼貓、25%的機會出現緬甸色的幼貓
暹羅重點色的幼貓，出生的時候是完全白色的。重點色斑直至一周後才會出現。這是由於當氣溫太高的時候，暹羅重點色的細胞不能發育。當幼貓在母親溫暖和舒適的子宮中，不會有任何的色素在這段期間發育。當他們出生後，外部的環境比較涼快，氣溫適合讓色素髮育，如在耳朵、腿部和尾巴的地方。這一種依賴氣溫而產生的色素稱為端部黑化 acromelanism。端部黑化可以在其他的動物中出現，例如：兔子。
雪豹色 snow leopard，在豹貓 Bengals 中出現，基本上是擁有重點色的貓，而重點色的部分與身體其他部分的顏色反差較弱。全身都可以看見梅花點，但臉部、腿部和在尾巴上的重點色部分顏色較深。
外國白Foreign white是擁有顯性白，W（如下）的暹羅貓。外國白的結果是擁有深藍色眼睛全白的暹羅貓。普通白色擁有藍色眼睛的貓，眼睛顏色頗淡。
名稱： C =正常顏色
cb =緬甸
cs =暹羅
ca =白化藍眼睛
c =真白化（紅眼睛）
銀影色
銀影色的基因是顯性的，並且抑壓皮毛顏色的發展。毛髮底層的顏色將會是白色，而上端的毛髮將會維持其應有的顏色。在深淺環紋的貓，在深色斑紋之間顏色較淡的地方最明顯。受銀影色基因影響的非深淺環紋的貓，便成為煙影色。
名稱： I =銀影色（壓抑黑色素）
i =非銀影
顯性白
令一隻貓純白的基因是顯性的。這一個等位基因壓抑了所有顏色細胞的正常功能，因此沒有任何顏色產生。一隻全白的貓原本可以是紅褐/黑色、深淺環紋/非深淺環紋、稀釋/非稀釋等等。因此白色的基因是上位基因epistatic。
純白的貓往往在出生的時候，頭部有一塊色斑。當換了成貓的毛髮後，色斑會消失。這一塊色斑可暴露這白貓被壓抑的原來顏色。
白貓可以擁有黃色眼睛、藍色眼睛、或一藍一黃眼睛（鴛鴦眼）。暫時沒有人知道這種眼睛顏色是如何承襲。
白貓很多時候是失聰。這是由於內耳的耳蝸退化造成。藍色眼睛的白貓出現耳聾絕對比黃色眼睛的白貓普遍很多，但是也有黃色眼睛的白貓是耳聾，而藍色眼睛的白貓聽覺是正常的情況出現。貓也可以只是單邊耳聾。鴛鴦眼的貓，往往都會是藍色眼睛同一邊的耳朵是耳聾。
名稱： W =白色
w =非白色
斑白點
斑白點是如何承襲暫時還不太清楚。廣為接受的理論是一個不完全顯性的基因，S（斑點），令不同面積的白班出現。 ss將會表示沒有白色的貓。 Ss是雙色（白爪子和腿、在胸部的白班和在臉部有白色），和SS是貓出現非常大面積的白色，如：白花班 harlequin 和梵 van。毫無疑問，這並非事實的全部。一定有更多的基因涉及改變這些基因的表現，因為斑白點貓沒有很明顯的分界分為三組，反而變化好像正在持續增加。
伯曼貓 Birman 的配育員很難滿意上述的理論。伯曼貓擁有白色的爪子，和但兩隻伯曼貓交配，所有的幼貓都擁有白色的爪子。而從來沒有出現完全沒有白色，和出來沒有白花班或梵白班的貓。
因此出現了白色爪子的隱性基因理論。稱為g （手套glove）。根據這一個理論GG是沒有白色的貓。 Gg會令貓出現白色的大徽章或在肚子上白色的花斑，gg 會令貓擁有白色的爪子，和可能一些在肚子和在喉部的一點白色（皮毛淺色的伯曼貓可以隱藏這些班點）。
現在由於發現這些理論的例子集合在一起，都不能全面解釋斑白點的出現，然而，尚未有其他更能解釋得更佳的理論。我們需要考慮多基因涉及斑點白的出現。
金吉拉基因 Chinchilla
以前，相信金吉拉色和銀影色是銀色深淺環紋變化的極端。今日，許多人都相信有一個特別的基因負責這些顏色多樣化（多基因也涉及在其中）。假設是這一個基因會擴大深淺環紋毛髮淺色的環紋，成為佔據了整條毛髮，除了最頂端的毛尖都變得淺色。甚至在深淺環紋貓單色的毛髮都會變淡。這一個基因在非深淺環紋貓身上起不了作用。這一個基因稱為Wb（擴環 widening of band）並且是非完全顯性。 WbWb將會出現銀影色或金影色，和wbwb會出現正常的深淺環紋皮毛。擁有基因型A -WbWb 的貓都會說是尖點色 tipped。
在新生的尖點色和影色幼貓身上，大部分經常都會看見虎班/鯖魚虎斑/梅花點的痕跡。幼貓會在長時間內逐漸淡化顏色，直至出現最終的顏色。
褐化 Rufism
褐化，這個詞是指貓棕褐色色素相當大的變色。褐化決定一隻棕色虎斑紋貓擁有暖暖的棕色或更加灰。它也可以決定一隻紅褐色的貓，將會是溫暖的深紅色或蒼白的橘色。在這兩極端之間持續變化。因此，這一個特質可能是由許多其他基因影響（多基因地承襲），由許多基因加入小小的正或負影響。
有人認為有時候在銀影貓上看到的棕色斑點，也是高度褐化的後果，而其他則想這是跟褐化沒有關係。
當針對顏色選育，褐化的量往往成為非常重要的一環，如選育波斯貓。在棕色深淺環紋的貓，希望儘量有更多的褐化。一隻野生顏色的阿比西尼亞，沒有高度的褐化，不會特別令人印象深刻。在紅褐色的貓，只有大量的褐化才會有深暖紅色：越多的褐化，顏色更暖。一隻出展的銀影深淺環紋波斯貓絕對不能有任何的棕色斑點。如果您選育銀影色的貓，並且支持在銀影色貓的棕色是由褐化做成，您將會想儘量少褐化出現。甚至其他顏色都受褐化影響，但沒有如上提及的變化。
關於玳瑁色/三色貓更多的信息
是什麼令一隻玳瑁色貓部分是紅褐色，和其他部分是黑色呢？在受孕之後的幾天，當在原細胞自行分裂成為許多相似的細胞，其中一條 x-染色體在每一個細胞中停止。其餘生就只有剩下一條 x-染色體繼續生效。隨機地它決定哪條 x-染色體需要停止。當細胞再次自行分裂，子細胞將會如母細胞一樣有同一條 x-染色體停止運作。這會令貓擁有混合紅褐色和黑色的斑紋。
玳瑁色雄性
由於雄性只有一條x-染色體，雄貓不可能出現玳瑁色。然而，有時候在一胎幼貓中會出現一隻玳瑁色雄貓。怎麼樣可能呢？他不是有兩條 x-染色體吧？是的，這恰好是解釋玳瑁色雄貓的一些情況。他們當中有部分是染色體出現錯誤，他們擁有兩條 x-染色體和一條 y-染色體。要不是母親在卵子有兩條 x-染色體，就是父親的精子中同時帶有 x-染色體和 y-染色體。同樣的染色體畸變都可以發生在許多其他的動物和人類身上。這稱為克氏症候群 Klinefelter's Syndrome。這種染色體畸變會導致不育 - 但是當玳瑁色雄貓是有生育能力，這樣，導致他是玳瑁色是由其他原因引起。
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| | X | Y |
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| XX | XXX | XXY |
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| 0* | X0 | Y0 |
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*) 沒有性聯的染色體
XXX -超雌 metafemale，人類：外觀正常，最少一部分，可能全部都是有生殖能力。
XXY -克氏症候群。
X0 - 特納氏綜合症 Turner's syndrome，人類：發育期短、幼稚、往往不育。透納氏症的老鼠的外觀與正常老鼠無異。
Y0 -在胎兒發育時期早段死亡。
三色雄貓可能是由於皮膚的色素錯誤而成。這通常都是出現在紅褐色的貓，有許多斑點的貓身上，有時候甚至是大塊的黑色。這些雄性原是選育成為紅色的雄貓。原則上，可以看見黑色擁有生殖能力的公貓有一點兒紅色。然而，這樣的貓，出來沒有人報告。
而其他不同的玳瑁雄性，可能是由於當兩個受精的卵子，或已經發育成為一組細胞，合併成為一個胚胎。這是跟一個受精卵分裂成為兩個胚胎成為一對同卵雙胞胎剛好相反。如果一個受精卵應該成為黑色雄貓，而另一個是會變成紅色的雄貓，這樣兩個胚胎結合便會變成三色雄性。在美國有例子，出生了一隻紅、藍和白的緬因貓，正好引證受精卵結合的後果。這一隻公貓是可以生育，他只給了他的幼貓紅色。
當然，這些不常規也可以在當兩條 x-染色體都帶有同樣的顏色時出現。而結果不是得出一隻三色公貓，而是淡色正常紅褐色（奶油色）或黑色（或差異）的雄貓。這些雄性將永遠不會被懷疑是什麼特別的東西。