回答這個問題，必須要解釋清政府組建新軍（包括北洋新軍）的背景，離開北洋軍成立的背景去談這個問題，都無法剖析其真正原因。
清政府並非一個新成立的政權，它已經存在了兩個多世紀，原來有自己一套自己的軍隊系統。那它為什麼要放著自己原有的軍隊不用，非要另起爐灶，再搞一支新軍——北洋軍呢？
表面上看，是因為大清自從鴉片戰爭後，國門被列強的艦船利炮洞開，一次次挨打，割地賠款。昔日的輝煌成為過眼雲煙，昔日的威嚴蕩然無存。清廷統治者意識到中國跟西方存在的差距，明白挨打的原因是因為軍隊落後，所以才不惜代價，重金組建一支現代化的部隊，向西方學習，希望能扭轉被動挨打的局面。
這是清廷組建北洋軍的初衷。
但在滿清的精英，尤其是漢族精英們看來，滿清政府的亡羊補牢已經為時太晚。
如果說中英鴉片戰爭、第二次鴉片戰爭和中國跟俄國的一系列衝突，中國政府割地賠款是因為國力落後於西方國家，被洋人痛打還有情可原的話；而中國在朝鮮的失敗，在甲午戰爭中被鄰國日本狠揍，就無法用中西對抗，我們贏不了人家這個理由來解釋了。
說真的，世界上哪個民族都有崇拜強者的心理，漢民族也不例外。
滿清作為少數民族，當年能夠統治一個人口比自己多幾十倍幾百倍的中原地區，最主要的原因是戰力強大。
大家什麼都不服，就服拳頭。
在中原人看來，清朝軍隊就是勇猛，就是彪悍，就是不可戰勝，我們不聽他的聽誰的。
但不可一世的清廷軍隊，不但被太平軍打得落花流水，被英法和俄國打得滿地找牙，還被東方小國日本打得找不著北。
甲午戰爭後，清廷在漢人心裡的高大形象一下子垮塌了，滿清的政權合法性也出現了問題。
以前，漢人都會覺得，被清廷統治是天經地義的，毋庸置疑的。因為人家威猛、強大，就該是中國的合法代表。
可是，現在你不但被洋人欺負，也被日本人擠兌，你的偉大呢 ，你的正確呢？你還有資格當中國的老大嗎？
老百姓提出這個質疑倒不是那麼可怕，就怕清廷的鷹犬和走狗，也覺得清廷沒有了當老大的資格，統治者不再神聖，不再英明，不再可怕，他們甚至為有這樣的老大感到羞恥。一旦這樣，清廷的軍隊、清廷的將領還會對清朝政府死心塌地嗎？
論威望、論韜略、論人品，袁世凱不過是個二流角色，到曾國藩、左宗棠和李鴻章跟前一比差遠了，但為什麼為滿清掘墓的不是他們三位而是袁世凱？
哪個時期都有權力鬥爭，都有派系鬥爭，都有控制和反控制的鬥爭，為什麼北洋軍幾乎成為袁世凱私兵，跟清廷的關係演變為敵我矛盾，不可調和，原因就是清廷的執政合法性出現危機，清廷的漢臣們對主子出現了信任危機。
打個比方，就是一幫小弟跟著一個老大，老大出手狠大家都怕他，別人也怕他，所以大家心悅誠服跟他幹。可是後來漸漸發現別人不再怕他，反而他常被別人打得磕頭求饒，你還會贊成他當老大嗎？你一定會說，瞧他這份德性，有什麼資格當老大，我當老大肯定比他好。
尤其庚子國難中，清廷的鷹犬們親眼看到自己的主子在列強到來後，驚恐萬狀、哭爹喊娘、狼狽逃竄的熊樣，誰還對他有絲毫敬畏之心？
最要命的是，清朝統治者希望新建的軍隊注入新鮮血液，任用留日歸來的學生，讓他們擔負起軍隊重任，擔任管帶和標統，企圖削弱袁世凱的影響。
但北洋軍中的骨幹，在日本不但學到了先進的軍事知識，還學到了先進思想。
那些曾經留日的學生，很多都接受了孫中山同盟會的民主思想，腦袋裡的忠君思想被連根拔起，一個個都變成了無君無父的「亂臣賊子」。
這時候的北洋軍不好控制，原因就不是一個人的問題了，是軍人的立場動搖了，思想亂了。
這樣一來，就是把清朝統治者累死，把袁世凱宰了，也無法控制北洋軍隊。
當滿清統治者感覺這支軍隊被袁世凱操控的時候，他們的去袁化動作不可謂不大，一出手就解除了北洋軍中袁世凱的臂膀、第六鎮統制趙國賢的職務，繼任第六鎮統制的段祺瑞又因為受到舉報被明升暗降，調任蘇北提督。
連換兩位統制後，清廷讓忠心耿耿的吳祿貞擔負軍中重任，但軍中各級軍官均對吳的到來非常排斥，直到最後把吳祿貞刺殺。
其餘各鎮的統制王士珍、馮國璋雖然不停向清廷表忠心，但也是吃裡爬外，身在曹營心在漢。
因此清政府嘔心瀝血打造的北洋新軍，把自己送進了墳墓。不是清朝統治者的手腕不行，而是時代變了，軍人的思想變了，腦子裡不再有君王就是爹的觀念；時代潮流浩浩蕩蕩， 不能順應，註定被掃進歷史的垃圾堆。