其實，科學家在復原恐龍時，一方面依靠的是恐龍的化石信息，但另一方面其實是靠腦洞。比如：上個世紀時，科學家認為斑龍長這樣。
後來隨著科學的發展，科學家認為斑龍長這樣應該更合理。
最早科學家認為稜齒龍是樹棲恐龍。
後來研究了稜齒龍的骨骼、肌肉以及體重之後，科學家認為它們更傾向於陸地行走，而非爬樹。
那麼，科學家們究竟是怎麼發現這些錯誤的呢？畢竟又沒有活生生的生物可以參考、糾正。
化石攜帶的信息
一般情況下，化石只有一小塊骨骼以及牙齒，很少有皮膚、皮毛等軟組織保存至今，甚至很多生物連完整的化石都沒有，但科學家們仍能將它們復原了出來，這究竟是怎麼做到的呢？
毫無疑問地是，科學家們可以從化石身上復原出該生物的骨骼，尤其是保存完整的恐龍化石，可以非常直觀地幫助科學家了解該生物的結構。
但是，很多情況下，科學家只能得到一兩個恐龍化石碎片，憑藉這些碎片來拼湊恐龍活著時候的樣子。比如：一兩顆牙齒。
儘管如此，科學家也能從有限的化石中拼湊出部分信息，以牙齒為例。
首先，食草恐龍和食肉恐龍的牙齒並不是相同的，食草動物由於需要研磨植物，所以牙齒大多粗而大；食肉恐龍由於需要撕咬，所以食肉恐龍的牙齒大多尖而銳利。
再者，從牙齒上還可以分析出該生物的年齡，大多數成年之後的牙齒，只有一副，我們可以通過牙齒的磨損程度來判斷該生物的年齡，甚至還能分析出它們吃了什麼。
我們知道，所有的動物都是通過直接或者間接的方式從植物中獲得能量，但是植物又分為幾種不同的種類，其中由於光合作用的不同，植物又分為：C3植物、C4植物等。
C3植物和C4植物的碳同位素並不相同，c3植物的碳同位素大約為22‰----30‰；而C4植物的碳同位素為9‰----19‰。
由於這兩者的不同，科學家們可以研究化石上的碳同位素，再根據它們是食肉動物還是食草動物，即可分析得出該恐龍以什麼為食，以及當時地球上主要是那些植物。
化石無法提供的信息
雖然化石可以提供很多信息，但有一些信息卻無法提供，比如：某件造型特殊的化石。
科學家們曾經發現了一種怪異的牙齒結構：旋齒。
由於這種結構的牙齒非常罕見，科學家甚至無法判斷該化石來自於生物的哪個部分，為此，他們畫了許多想像圖。
從圖中可以看出，這幅牙齒既可以是尾巴，也可以是魚鰭，甚至是上頜以及下頜，而且無論是哪種結構，看起來似乎都合理。
如果沒有別的化石證據出現，那麼科學家們永遠也無法判斷旋齒位於生物的哪個部分。後來，科學家在另外一具化石上發現旋齒與頜骨連接在一起，最終才確定了旋齒的具體位置，而這種鯊魚也被命名為旋齒鯊。
旋齒鯊屬於軟骨魚，除了牙齒之外身體的其他部分很難保存下化石，因此科學家對旋齒鯊的研究進度緩慢，只能通過其他生物的化石，大致來判斷它擁有什麼樣的特徵。儘管目前人類畫出了旋齒鯊的復原圖，但如果我們真的見到這種生物，可能會發現它們與人類的想像差別巨大。
像旋齒鯊這樣，只留下極個別信息的生物並不罕見，但是大多數生物的骨骼沒有像旋齒鯊那麼奇葩，科學家可以通過以往的經驗分析得出該化石屬於那塊結構。
當所有的結構都知道之後，科學家會為它們建立肌肉模型，因為肌肉一定是附著在骨骼上升生長的，所以一般區別不大。
但是，隨著科學在進步，以及一些關鍵化石被發掘，科學家之前建立的模型圖也有可能被推翻。比如：之前人們認為恐龍的皮膚擁有厚厚的盔甲，但後來發現也有一些恐龍長有羽毛。
正是憑藉著科學的一點點進步，以及發掘出的骨骼化石足夠多，科學家們才能系統地建立起對已經滅絕生物的研究，雖然在研究過程中不可避免地會出錯，但後人在發現新證據時，可以在原有基礎上糾錯。
總結
古生物學家面臨的比較尷尬的局面就是，古生物沒有活的參考物，以及化石信息有限。儘管如此，科學家們仍會通過現有的生物骨骼模型，以及生理機制來重建古生物，雖然在製作古生物時仍有誤差，但隨著科學研究的發展，科學家們會調整誤差。