在勇敢的上尉約翰·史密斯率領下，一批來自英國拓荒者到達了美洲大陸，敲響了美麗的印第安公主寶嘉康蒂和她族人們的警鐘，也開始了一個建立在歡笑愛和忠誠上的故事。可愛的浣熊米糕和小蜂鳥菲莉快樂地穿梭其間：寶嘉康蒂面臨改變一生的決定，又必須避免兩軍衝突，在充滿智慧的柳樹婆婆幫助下，她學會了傾聽自已心中的聲音，並且隨著風中的色彩去追尋人生的真諦。
In 1607, the Susan Constant sails to the "New World" from England, carrying British settlers of the Virginia Company. On board are Captain John Smith and the voyage's leader Governor Ratcliffe, who seeks large amounts of gold in the New World to assure a strong position at the British court. Along the way, the Susan Constant is caught in a North Atlantic storm, and Smith saves a young, inexperienced Thomas from drowning. In the Powhatan Tribe in the New World, Pocahontas, daughter of Chief Powhatan, dreads being possibly wed to Kocoum, a brave warrior whom she sees as too "serious" for her spirited personality. Chief Powhatan gives Pocahontas her deceased mother's necklace as a present. Pocahontas, along with her friends, the gluttonous raccoon Meeko and hummingbird Flit, visit Grandmother Willow, a spiritual talking willow tree, and speaks of a possibly prophetic dream involving a spinning arrow, and her confusion regarding what her "path" in life should be. Grandmother Willow then alerts Pocahontas to the arriving British.
Ratcliffe has the fortress Jamestown built in a wooded clearing and immediately has the crewmen dig for gold. John departs to explore the wilderness and encounters Pocahontas. They quickly bond, fascinated by each other's worlds and fall in love, flouting Chief Powhatan's orders to keep away from the British after Kocoum and other warriors engage them in a fight. Meanwhile, Meeko meets Percy, Ratcliffe's dog, and becomes the bane of his existence. Pocahontas introduces Smith to Grandmother Willow and avoids two other crewmen, but Pocahontas' friend Nakoma discovers her relationship with John and warns Kocoum. Later, John and Pocahontas meet with Grandmother Willow and plan to bring peace between the colonists and the tribe. John and Pocahontas kiss, while Kocoum and Thomas witness from afar. In a jealous rage, Kocoum attacks and tries to kill John but is himself shot by Thomas. Pocahontas watches in horror as Kocoum falls dead, reaching for Pocahontas one last time but instead breaking her mother's necklace. John commands Thomas to leave just before the tribesmen come and capture John. An enraged Chief Powhatan declares war on the crewmen, starting with executing John at sunrise.
Thomas warns the crewmen of John's capture, and Ratcliffe rallies the men to battle as an excuse to annihilate the tribe and find their non-existent gold. A guilt-ridden Pocahontas visits Grandmother Willow, where Meeko hands her Smith's compass. Pocahontas realizes John's compass was the spinning arrow from her prophetic dream, which leads her to her destiny. Just as Powhatan is to execute Smith, Pocahontas throws herself in the way, successfully stopping Smith's execution and convincing her father to cease the hostilities between the two groups. All parties accept gracefully, except Ratcliffe, who tries to shoot Chief Powhatan in anger with John taking the bullet. The governor is then captured and arrested by the crewmen. Meeko and Percy, now friends, give Pocahontas her mother's necklace completely fixed. In the end, John is forced to return home to receive medical treatment. He asks Pocahontas to come with him, but she chooses to stay with her tribe. John leaves with Pocahontas and Chief Powhatan's blessing to return in the future.
故事背景為17世紀的1607年，殖民主義快速發展的競爭時代。一艘船，載著來自維吉尼亞公司的bai英國探險家們，正前往北美洲，準備尋找金礦和其它值錢的資源。船上的領導者有上尉約翰·史密斯（John Smith）以及總督約翰·雷利夫（John Ratcliffe）兩人。途中，這艘船遭遇了一場暴風雨，就在一名菜鳥水手湯瑪斯（Thomas）意外地落水時，史密斯也跳入了水中，救了湯瑪斯一命，他們兩人也成為了好朋友。
此時，在「新大陸」上，印第安包華頓酋長（Chief Powhatan）的女兒寶嘉康蒂（Pocahontas）聽說了她父親希望她能夠嫁給部落中最強壯的戰士——高剛（Kocoum）的消息。不過寶嘉康蒂認為高剛太過於嚴肅而不想嫁給他，於是就去向森林中一棵會說話的樹靈——柳樹婆婆（Grandmother Willow）請求建議。而柳樹婆婆則告訴了寶嘉康蒂，要她聆聽自己的心。
那艘載滿了英國人的船在維吉尼亞州登陸後，總督雷利夫就下令所有的船員都開始挖掘金礦。史密斯則一個人走進了森林中探險，並遇到了寶嘉康蒂。寶嘉康蒂在她和史密斯相處的期間教導了他要以一種和之前完全不同的角度來觀看這個世界，萬物都充滿了靈性、處處是美、俯拾皆是，而不要將寶嘉康蒂的族人們當成「野蠻人」來看待。但此時，在挖掘金礦的地點，包華頓的戰士和英國人發生了一場衝突，其中一名印第安戰士中了槍。於是戰士們就決定撤退，此舉使得酋長認為白人們非常危險，不允許族人靠近他們，並決定召集附近的邦交部落聯合起來對抗白人。
幾天後，當寶嘉康蒂又遇見史密斯時，她就告訴史密斯這附近的土地並沒有金礦，兩人也相約好當天晚上要在柳樹婆婆下再見面。但是，當寶嘉康蒂回到了部落中，卻發現附近邦交部落的戰士已經抵達了，準備幫助包華頓部落一起對抗白人。另一方面，史密斯回到營地後，告訴了總督這附近沒有金礦，但總督卻不相信他，認為印第安人私底下藏著許多金礦。
那天晚上，寶嘉康蒂最好的朋友妮可曼（Nakoma）發現她又偷偷地離開部落，於是就去通知了高剛。同時，史密斯也悄悄地離開了營地，卻被湯瑪斯和總督發現了，於是總督就命令湯瑪斯去跟蹤史密斯。寶嘉康蒂和史密斯在相遇後，柳樹婆婆就說服史密斯去和包華頓酋長談一談，儘量避免戰爭的發生。當史密斯答應去見酋長後，寶嘉康蒂就感到非常高興，緊緊地抱住了史密斯。在湯瑪斯和高剛兩人暗地的監視下，他們兩人親吻了。高剛由於心生嫉妒，就跳了出來向史密斯撲了上去，打算用小刀殺死他，而湯瑪斯見到此狀後，就開槍射殺了高剛。槍聲引起了一些印第安人的注意，於是史密斯就叫湯瑪斯趕快逃離現場。但當印第安人抵達後，認為在場的史密斯就是射殺高剛的兇手，於是就將史密斯抓了起來，帶回部落，包華頓酋長就下令隔天一早在戰爭開始之前就將史密斯處決。湯瑪斯回到了營地，並告訴大家史密斯被抓走的消息。總督就趁著這個機會，打算隔天早上就出發攻擊印第安人，同時解救史密斯。
隔天早晨，就在史密斯要被處決時，總督的軍隊抵達了現場。就在包華頓酋長要殺死史密斯的那一刻，寶嘉康蒂撲了上去，抱住史密斯，並告訴她的父親，如果他非得要殺掉史密斯，他就必須先殺死自己的女兒。酋長命令她離開，但寶嘉康蒂拒絕了，並告訴了她的父親，她愛上了史密斯。寶嘉康蒂向她的父親說，戰爭帶來的後果將不堪設想，她選擇的路就是要和史密斯在一起，和平相處而非互相殺戮。寶嘉康蒂希望她的父親能夠再三思考自己所要選擇的路：戰爭或者和平。在思考過寶嘉康蒂說的話後，酋長決定選擇和平，並聲明他將不會再發起任何戰爭。於是，印第安人的戰士們以及英國的軍人們也都跟著放下了武器。不過，在酋長下令釋放史密斯時，不服氣的總督向酋長開了一槍，史密斯見狀後就立即朝酋長撲了上去，而使得自己中槍。英國人們看見後，就將總督抓了起來，要以背叛罪行將他送回英國接受處罰。
史密斯活了下來，但傷勢嚴重的他必須回到英國接受醫療手術，否則將會死亡。在史密斯要被送上船之前，他告訴其他人再等一會兒，因為寶嘉康蒂答應過他會再來看他一眼。就在那時，寶嘉康蒂和她的一些族人從樹林中走了出來，還帶了許多裝滿了食物的籃子要送給他們。寶嘉康蒂走向前，給了史密斯一袋柳樹婆婆的樹皮，告訴他那能夠減輕他的疼痛。酋長包華頓則是給了史密斯一個代表部落的頭巾，並告訴史密斯自己的族人將會永遠歡迎他們的到來。酋長也因為自己被史密斯救了一命而向史密斯道謝，還稱呼他「兄弟」。史密斯希望寶嘉康蒂能夠和他一起回去英國，但寶嘉康蒂卻流著眼淚，告訴史密斯自己必須留在部落中，而這也是她想要選擇的道路。最後，寶嘉康蒂跑到了懸崖旁，目送著英國人的大船駛離河道，航向大海，故事結束。
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