東北神學院
東北神學院是東北地區唯一的基督教神學院。起源於1894年愛爾蘭長老會牧師傅多瑪（Thomas.C.Fulton）成立的，1953年學校並於北京燕京協和神學院（今燕京神學院），1982年10月在瀋陽重新修建。學校主要招考高中畢業生以及26歲以下的男女信徒，學制4年。
學院現有專職教師23位，外聘教師10位。學院以「靈、德、智、體、群」為辦學方針，開設50多門課，其中神學課、文化課與政治課的比例為7:2:1。目前有神學本科班四個，神學本科插班一個，聖樂專科班一個，聖經中專班三個，研究生班兩個，另有在讀函授班兩期，在校生共計400多人。
華東神學院
華東神學院坐落於上海市青浦區。華東神學院先後在上海懷恩堂、沐恩堂以及五原路71號辦學，2000年遷入青浦新址。
學校佔地面積18470平方米，建築面積8800平方米。學院開設三種學制：四年制神學本科，兩年制聖經科，三年制業餘神學科。現有教師45名。其中專職為10名；學生為168名；圖書館藏書6.3萬冊。
河南神學院
學校位於河南省鄭州市轄區航海東路開發區南商英街。學生來這裡主要是打下紮實的聖經基礎，為以後的侍奉和進入更高神學院打下牢固基礎。入學要經過考試，很簡單的一些卷子，但是得認真做。因為越簡單越拉不開層次。
河南神學院有二年制專科班兩個，全日制短期培訓班一個，開設課程40門，除一定比例政治文化課程外，宗教課程設置28門。
中南神學院
中南神學院，位於武漢市，本為基督教武昌堂，是中國基督教在中南地區的最高宗教學府。
學校主要培養和造就有思想覺悟、熱愛祖國、擁護社會主義制度、接受共產黨的領導、品行端正、信仰純正、具有高等文化知識和基督教學識，堅持中國基督教獨立自主、自辦原則，走三自愛國道路，並能勝任基督教事工的專職教牧人員。
山東神學院
山東神學院是由山東省基督教兩會創辦的本科高等宗教院校。1998年11月新校址順利遷移至濟南市美裡湖開發區粟山路356號；2011年12月23日經國家宗教事務局批准升格為本科宗教院校。
山東神學院組織健全、制度嚴明，實行省基督教兩會領導下的院長負責制。目前，擁有專職教師31位（博士/在讀5人、碩士20人、本科6人），兼職教師13位（博士/在讀6位、碩士4位、本科3位）、行政辦公人員6位（本科）。此外，又聘請了濟南高校10位教師教授通識課程。
自辦學至今，山東神學院已為全省教會培養了1692名專業人才，其中包括本科生138人、專科生480人、一年制教牧班學生1074人。
四川神學院
四川神學院地址設在有著3000餘年的建城史，故有「錦官城」之稱的成都，地址位於四川成都四聖祠北街19號，主要經營主要為雲南省、貴州省、四川省培養基督教教會傳道人員。
2002年7月，學院由三年制專科升為四年制本科。學院開辦33年來，為雲、貴、川、渝基督教會培養了神學畢業生700餘人，其中部分畢業生已成為西南基督教會的主要負責同工，對於引導西南各地教會堅持愛國愛教、堅持三自原則、堅持基督教中國化方向，抵禦境外滲透，對外宣傳黨的宗教信仰自由政策等發揮了積極的作用。
福建神學院
福建神學院（簡稱「福神」）創立於1983年，是我國改革開放後第一所全省性基督教神學院校，2015年升格為本科高等基督教神學院校，學制四年。
學院實行董事會領導下的院長負責制，院務會議為行政機構，下設辦公室、教務處、學工處等職能部門。目前，學院設有神學系、和延伸部，專職教師20人，兼職教師共28人，在校生148人，延伸部學員292人。開設基督教專業、文史哲等80餘門課程，其中設有《基督教與中國文化》、《福建教會史》和《社關服侍》等特色課程。
此外，我國還有雲南神學院、燕京神學院、金陵協和神學院、浙江神學院、廣東協和神學院等十幾所本、專科院校。