中國科學院大學重慶醫院·重慶市人民醫院胸外科於1961年由重慶市知名外科專家王安定，張宏謀創建，是我市乃至全國較早開設的胸外科專科之一。在西部地區率先開展食管疾病，肺結核及肺腫瘤的外科治療，並為西南地區培養了一大批胸外科專業骨幹。
中國科學院大學重慶醫院·重慶市人民醫院是中國科學院大學直屬附屬醫院、重慶市心肺血管疾病醫療研究中心。獲評復旦大學醫院管理研究所發布的「2017年度七大區域醫院專科聲譽排行榜」西南區胸外科專科提名醫院。現有醫師12人，其中高級職稱6人，博士2人，碩士2人。護理系列共22人，77.3%的胸外科專科護士擁有本科學歷。是國家級住院醫師規範化培訓基地。通過了國家醫療器械臨床試驗機構資格備案，獲得GCP資格認證醫務人員4名。
目前胸外科熟練開展全胸腔鏡肺癌根治術、全胸腔鏡食管癌根治術、全胸腔鏡縱隔腫瘤根治術、氣管袖式切除和隆突切除重建術、侵犯下咽及喉部的頸段食管癌切除術、體外循環下（氣管腫瘤、局部晚期肺癌、侵犯大血管巨大縱隔腫瘤）切除術、惡性胸膜間皮瘤全胸膜剝脫術、肺結核及慢性膿胸根治性手術、以胸部外傷為主的嚴重複合外傷及多發傷的綜合治療、胸外科重點疾病的多學科綜合治療等，目前我科手術中微創手術佔比不斷提高。近三年來在國內外期刊發表論文二十餘篇，SCI文章5篇。在研與結題的省部級及廳局級課題2項。
兩江新院胸外科病房床位50張，醫療環境優越。科室將堅持踐行醫院人才培養及專科建設的「六條路徑」規劃，進一步加強人才梯隊建設，推進肺部疾病及食管疾病亞專科建設，培養科室急切需要的人才及亞專業帶頭人。積極更新、完善配套設備，達到重慶市一流水平。結合成為中國科學院大學直屬附屬醫院及中國科學院大學臨床醫學院契機，充分利用中國科學院大學學術研究平臺及人才優勢，在臨床、科研、教學、提升醫療質量與安全、提升患者滿意度、提升科室管理質量及效率等方面持續發力，創建市內一流、國內領先的胸外科專科。充分體現「人民醫院為人民」的辦院宗旨和「以病人為中心」的服務理念。