法老號貨船的代理船長愛德蒙·唐泰斯，被船上狼狽為奸的會計員丹格拉爾和同樣愛慕他女友梅色苔絲的弗爾南兩人，設計陷害。負責審理此案的代理檢察官維爾福發現此事與自己父親有牽連，將唐泰斯關進孤島上的死牢。
唐泰斯在牢裡度過了14年暗無天日的歲月，一天，隔壁牢房的老神甫挖地道時計算錯誤，到了他牢中。老神甫教會唐泰斯各種知識，使唐泰斯明白自己的敵人。老神甫告訴他，某個叫基督山的荒島上埋藏著無與倫比的財富。
老神甫病死後，唐泰斯為了達成他的遺願，將他的屍體搬入自己牢裡，自己躲進老神甫的裹屍袋，被獄卒當成屍體扔出了監獄。唐泰斯四處遊蕩，找到基督山，發現了寶藏，重回社會，先報恩，後復仇。
唐泰斯證實了唐格拉斯、弗爾南和維爾福陷害自己的事實，並得知未婚妻已經嫁給弗爾南，父親則病餓而死，他開始做復仇的準備工作。8年後，唐泰斯已經變身為基督山伯爵，以大銀行家的身份回到巴黎。這時，維爾福是巴黎法院檢察官，唐格拉斯成了銀行家，弗爾南成了莫瑟夫伯爵及議員。
基督山伯爵藉助媒體的力量在報上披露了弗爾南19世紀20年代在希臘出賣和殺害了阿里總督的事實，引起質詢。聽證會上，基督山伯爵收養的阿里總督的女兒海蒂出席作證。弗爾南名聲掃地，狼狽不堪，妻子認出了唐泰斯，與兒子一起離開了這個骯髒的家。失魂落魄、走投無路的弗爾南開槍自殺了。
基督山伯爵設計讓唐格拉斯出售債券，損失慘重。走投無路的唐格拉爾竊取濟貧機構的505萬法郎逃往義大利，被基督山伯爵的強盜朋友抓住。基督山伯爵後來以真實身份出現在唐格拉爾面前，唐格拉斯飽受驚嚇與折磨，嚇得肝膽俱裂，鬚髮皆白。
基督山伯爵現在全心對付維爾福，揭開舊事，讓他受精神折磨。然後，基督山伯爵巧妙利用維爾福的後妻。借用她手，毒死了維爾福的一些家人，讓維爾福與後妻相互殘殺。維爾福被各種各樣的事情糾纏、被各色人等揭發。他知道自己落入復仇之神的手裡，任人魚肉。失敗落魄的維爾福回到家中，發現妻子因為罪行敗露服毒身亡，並且毒死了自己心愛的兒子。處於巨大打擊之下的維爾福又看到基督山伯爵出現，並且表明身份，他崩潰了。
基督山伯爵完成了一切復仇，並且幫助了想要幫助的人，他認為，上帝想要他所做的一切都已經完成了。最後，他帶著收養的阿里總督的女兒海蒂遠走天涯。