2020年4月6日訊/生物谷BIOON/---根據最近發表在預印本學術平臺arXiv網站上的一篇文章，來自義大利博科尼大學，米蘭大學等機構的研究者們揭示了在首例病例確診之前，義大利境內倫巴第（Lombardy）早期的COVID19流行趨勢。
2020年2月20日晚，在義大利的倫巴第大區確認了首例新型冠狀病毒病（COVID-19）。 該患者是一名38歲的健康男性，患有輕度肺炎，沒有相關的旅行史，也沒有明顯接觸患病人群的經歷。在隨後的一周中，倫巴第地區的病例數量迅速增加。對此，研究者們對倫巴第地區報告的首批5830例實驗室確診病例進行了相關分析（統計症狀發生日期為2020年1月14日至2020年3月8日），包括對上述確診病例進行的流行病學分析，背景人口統計和暴露特徵分析，以及該區域內感染的傳播動態等等。此外，研究者們還基於報告病例的子樣本進行病毒學特徵分析，從而對有症狀和無症狀的病例的病毒載量水平進行了初步評估。該研究為西方國家早期的COVID19傳播提供了新的線索。
首先，作者通過對確診病例及其親密接觸者進行標準化訪談收集到了相關的流行病學數據。並且同時收集了人口統計背景，症狀發作的日期，臨床特徵，呼吸道標本檢查結果，住院以及相關接觸者的追蹤情況。
作者將所有患者根據症狀的發生日期進行了分類匯總（下圖）。如上所述， 截至2020年3月8日，倫巴第大區所有省份共報告了5830例陽性病例。 其中首例患者於2月20日確診，第二天同一地區發現了28例陽性病例。由於病例激增，2月23日當地政府出臺了包括紅色預警，區域封鎖在內的相關措施。
下圖展示了不同時期倫巴第地區COVID19的傳播情況。總之，在倫巴第地區COVID-19流行的早期階段，作者觀察到在科多諾（Codogno），貝加莫（Bergamo）和克雷莫納（Cremona）等城市周圍發現了三個主要感染群的形成。 後來，該流行病開始在整個地區開始廣泛傳播。 截至3月5日，在貝加莫，洛迪（科多諾所在的地方）和克雷莫納等省發現了大多數病例（72％）。
之後，作者按患者的症狀發生時間分成三個階段分別分析其特徵：第一個時期為從最早有患者出現症狀開始，直到2月19日，即官方宣布確診的首個病例的前一天為止。第二個階段是在2月20日至2月25日之間出現症狀，即出臺相關政策要求停止對COVID-19病患的無症狀接觸進行檢測的前一天為止；第三階段從2月26日開始出現症狀的病例到最後為止。為了與其餘分析保持一致，我們排除了明確報告為無症狀的病例（n = 204）。從剩餘的樣本庫（n = 5,626）中，作者發現陽性病例的中位年齡為69歲（範圍為1個月至101歲），其中一半以上的病例發生在65歲以上（75歲以上的病例為34%），陽性患者的62％為男性。幾乎有一半的病例住院（47％）。在三個組中，分別有63％，61％和56％的病例住院。在這些住院患者中，有18％需要重症監護。總體而言，倫巴第地區共有346人死亡，老年組的病死率（CFR）最高（75歲以上人群病死率為14％）。
通過對症狀發作時間進行進一步分析，作者估計病患從感染到症狀發生之間的時間間隔為6.6天，（從0.7天到19.0天，百分比分別為2.5％和97.5％）。 因此，作者認為95％的病例在感染後的16.1天內會出現症狀。
之後，作者分析了倫巴第地區及內部不同感染亞區的病毒蔓延速率。結果顯示，COVID從最初感染至今，其傳播速率呈「先上升後下降」的趨勢（Rt值表示在給定的時間內病毒在人群中的擴散程度）。作者認為，自2月20日以來，病毒的擴散速率已經出現下降的趨勢。
從2月21日至3月3日，倫巴第地區總共有7,925支鼻拭子樣品接受了檢測，其中SARS-Cov-2的陽性樣品為2,251份。 對來自Pavia參考實驗室的部分樣品數據進行了更深入的分析（6208名受試者），結果1529名為陽性。在2月21日當天檢測的380名陽性受試者中，有17名（4.5％）被確定為無症狀，有295名（77.6％）被分類為有症狀，此外還有68名患者（17.8％）沒有明確跡象表明存在症狀。 在2月27日至3月3日期間，僅對有症狀的原發病例及其有症狀的接觸者進行了檢測，檢出率提高到了33.4％（1,107 / 3,316）。
通過比較不同亞組患者樣品中的病毒RNA拷貝量，作者發現有症狀患者樣品中位SARS-CoV-2水平為5.0 X Log10 RNA copy/ ml（範圍1.7-10.1），無症狀患者為4.7 X Log10 RNA copy/ ml（範圍2.1-7.1） 有症狀患者和無症狀患者樣品中的病毒載量無統計學差異。
根據調查結果，研究者們認為：COVID19在義大利境內的流行實際上早在2020年2月20日之前就已經開始。在發現第一例COVID-19病例時，該疾病已在南部倫巴第的大部分城市中廣泛傳播。
根據估計，義大利倫巴第地區患者從感染到症狀出現平均間隔為6.6天，介於中國湖北省（平均7.5天）和其他中國省份（平均5.1天）之間。 作者認為我國其它省份的時間間隔比倫巴第地區少1.5天的原因是倫巴第的COVID-19病例沒有像在中國的那些省份那樣被迅速隔離，因此繼續傳播感染時間更長。 在流行的指數增長階段，作者估計其平均R0值在2.3-3.1質檢。 每天的繁殖數量隨時間波動很大，但在各個地理區域內卻相當一致。 2月20日之後Rt值會略有下降。但是仍遠高於流行閾值。