很久很久以前，天地混沌，現在的日本還是一片汪洋，陸地尚未形成。
最高天神掐指一算，時機已到，於是召喚伊邪那岐和伊邪那美兄妹兩，授予他們天之瓊矛，命令他們下凡創造大地，鞏固國土。
伊邪那岐和伊邪那美領命來到連接天地的天浮橋，將天之瓊矛插入大海中來回攪動，當矛被提起時，順著矛頭滴落的海水，逐漸聚集凝固成了日本第一座島。
有了落腳的地，伊邪那岐和伊邪那美便天神下凡，在這座島上修建了宏偉壯麗的八尋殿，豎起高聳入雲的天之御柱。
土地有了，房子也有了，一切收拾妥當以後，伊邪那岐便問他的妹妹：「伊邪那美，你的身體發育得怎麼樣了？」
伊邪那美回答：「已經發育成熟了，只是還有一處缺口沒有長合。」
伊邪那岐接著說：「我的身體也已發育成熟，只是多了一處，看來是要我們結合在一起，才能創造出大地。」（天之瓊矛不就可以製造島嶼嗎？）
伊邪那美點了點頭表示同意，然後說：「既然要結為夫妻，那就應該舉行個結婚儀式。」
「那你走右邊，我走左邊，咱們繞著天之御柱走一圈，再次遇見的地方就是咱們結合的地方。」伊邪那岐想了想說。
於是，兩位大神分頭繞著柱子行走，當他們相遇時，伊邪那美率先開口：「好俊的男子啊！」伊邪那岐接著說：「好美的女子啊！」
結婚儀式就這麼完了，兩位大神就地洞房，很快生出了一個骨骼發育不全的水蛭子，隨後又生出了淡島。
兩位大神對自己生出來的東西很不滿意，於是上天詢問。
最高天神又是掐指一算，說：「你們在舉行結婚儀式的時候，是女子先說的話，這是不吉利的。」
於是，兩位大神領命下凡，再次舉行了結婚儀式，繞柱一圈，這次伊邪那岐先說話：「好美的女子啊！」隨後伊邪那美附和：「好俊的男子啊！」
接下來又是一些不可描述的事情，兩位大神接連生出了八個大島，構成了日本現在的國土板塊。
生完日本後，兩位大神再接再厲，又生出了船神、海神、山神等諸多神靈，直到生火神時，伊邪那美被燒傷致死才結束。
日本神話中整個世界分為上中下三層，天上是天神居住的高天原；中間就是伊邪那岐和伊邪那美兩位大神創造出來的人間，稱之為葦原中國；地下則是靈魂棲息的黃泉國。
伊邪那岐和伊邪那美也就成了日本神話中的「父神」和「母神」。