前面我們說過，大雄寶殿中分別供奉了什麼佛？那麼他們結印坐於蓮臺之上，細心的人可能觀察到了，他們的所結的印都是不一樣，每一尊佛所結的手印也不一樣。譬如萬佛樓，一萬尊佛，所塑形象也不一樣。那麼他們所結的手印是什麼意思呢？下面小禪就給大家介紹一下，大雄寶殿中藥師佛、釋迦摩尼佛、阿彌陀佛、他們所結的「手印」代表著什麼意思。
藥師佛：常見的都是盤腿於蓮臺之上，一手持寶塔或缽，一手持印！
藥師如來—法界定印：以左膝託左手，掌心向上，右手同左手一般，重疊於左手之上，兩拇指指端相拄。或有說定印上觀藥壺，藥壺中納十二大願之妙藥，來度脫眾生。藥師法界定印就是法界定印,與釋迦牟尼佛、阿彌陀佛法界定印一樣，是一個印。此定印屬於體印。右手四指置左手四指上，表佛的四大加持眾生的四大，兩手拇指相抵，均歸入空性――法界。如來定印是體，定印是不能動的，不要在結定印時手晃動。
其意為：藥師如來不僅醫治我們身體上的病痛，也醫治我們智慧、悲心不圓滿的心靈。因為眾生一開始，無法感受其深刻的願力，所以他先醫治好眾生的病痛，再醫治眾生的心。
釋迦摩尼佛：在大雄寶殿之中，釋迦摩尼佛放中間，兩邊有舍利弗和目犍連尊者。常見的為兩個印，一個是右手的放光印，一個左手的無畏印。
無畏印：而除了外部的幹擾，更加嚴峻的挑戰實際上來自人的內心，因此，佛 陀還通過他的智慧為信眾消除內心的恐懼，引領他們走上正道，這也就是施無畏印的作用。施無畏印具體手勢為右手上舉至胸前，掌心向外，五指自然伸展。
放光印：劇《地藏經》第一品雲「 是時。如來含笑。放百千萬億大光明雲。所謂大圓滿光明雲。大慈悲光明雲。大智慧光明雲。大般若光明雲。大三昧光明雲。大吉祥光明雲。大福德光明雲。大功德光明雲。大皈依光明雲。大讚嘆光明雲。」光明印就是
阿彌陀佛所結手印分別為「上品上生、上品中生、上品下生、中品上升、中品中生、中品下生、下品上升、下品中生、下品下生。」此九種手印，九品印，即自上品上生至下品下生的九種印相。又稱為往生九品印。
那一般供奉在大雄寶殿之中的阿彌陀佛，一般常見的是「彌陀定印」：即二手相叉，右手置於左手上，兩手屈食指，拇指按在食指上。表示六道眾生顯得四智菩提之義。然則打開此印，則是化他門說法之印，支掌風和空的端頂，為開敷之勢，風有開花的功能，空中的風具有自在自得的意義，又禪進的二度喻有禪定的養育之義，為了要勇猛增長佛性的心蓮，而使禪進相合即做此印。
不管是哪個手印，我們在祈請佛、菩薩加持之時，都應需，誠心，誠意。如需打手印之時，配合各位佛、菩薩的心咒，一起結印。方能起最大作用。