1969年4月，宮崎駿迎來了人生中第二個兒子。同年在電視系列《神秘阿寇》中負責第四十一集和六十一集的原畫創作。
早先宮崎駿，曾在東映動畫工會的機關志上發表過漫畫《卡通團夥戰爭》獲得了不錯的成績。後來受到《周刊少年少女新聞》委託，在9月到1970年3月，開始以秋津三朗為筆名在期刊上連載，第一次的原創漫畫《沙漠之民》（風之谷的早期原型）。沙漠之民的出現一改宮崎駿想要為孩子們製作動畫的初衷，漫畫結局，主人公的戀人、親人、恩師依次悲慘的死去，連最後的希望也最終消散，絕望程度令人吃驚。按照宮崎駿的解釋：漫畫和電影電視不一樣，電影的現實感比較強，對於簡單的流血畫面也要慎重考慮，孩子們會認為畫面中的描繪是真實的故事。而漫畫不喜歡的話就可以翻過去甚至扔掉。
宮崎駿《穿長靴的貓》、《動物寶島》大約在同時期以漫畫形式在《中日新聞》、《東京新聞》晨報上連載。為同時期長片劇場動畫做宣傳，當然與沙漠之民不同是純真的冒險故事。
1971年，宮崎駿與高田勳、小田部羊一起從跳槽到大冢康生所在的蟲Production動畫（後來的「蟲製作股份有限公司」）。宮崎駿在高田勳導演的電視動畫《皮皮的長襪》負責故事板創作，但是後來原作者不同意改編作品，最終不得已放棄製作。隨後，宮崎駿與高田勳合作導演了電視系列長片《魯邦三世》第一部，23集中後17集，藉助魯邦三世這位風流人物，宮崎駿與高田勳迅速躥紅家喻戶曉。此後，宮崎駿又得到執導了《魯邦三世》第二部和同類型動畫片的機會。
1972年，中國送給日本一對熊貓，日本當時所有人都對這種可愛的動物充滿好奇。宮崎駿和高田勳藉此機會創作導演了《熊貓小熊貓》（熊貓家族），為了彌補之前《皮皮的長襪》的遺憾，並把《皮皮的長襪》的女主角安排到了熊貓小熊貓中，而熊貓的造型就是以後龍貓的原型。次年《熊貓小熊貓》的續集《雨中的馬戲團》中，宮崎駿首次一人身兼四職：原案、腳本、場景設計、原畫，都是宮崎駿一個人完成的，這也是宮崎駿個人風格的首次表現。
1974年，宮崎駿與高田勳、小田部羊又一起跳槽到Zuiyou映像（即後來的日本Animation的母公司）。為了下一步作品《阿爾卑斯山的少女》尋找靈感，宮崎駿到瑞士拍攝外景負責場景設計。高田勳導演，小田部羊負責角色設計作畫監督。
1975年，《三千裡尋母記》的製作，宮崎駿繼續擔任場景設計，高田勳擔任導演。為了尋找靈感宮崎駿遠赴義大利和阿根廷取景，這幾次的旅行使宮崎駿對歐洲寧靜美麗的田園風光留下了深刻印象，也從此奠定了宮崎駿日後作品中的異域風格。
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