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針對大規模全基因組測序數據尋找與常見疾病有關的罕見遺傳變異的...
針對大規模全基因組測序數據尋找與常見疾病有關的罕見遺傳變異的檢驗方法 該方法有效地引入並整合了多組學功能注釋數據,有助於快速,有效,高通量地分析全基因組測序數據來發現疾病與罕見變異之間的關聯性,並可以廣泛地應用於分析多種類型的表型數據,加快精準預防,精準醫療和尋找新的藥物標靶的研究。 文章分析了3萬人的全基因組測序數據,發現了可能和膽固醇和脂醯甘油的有關聯的新的罕見遺傳變異位點。
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大規模全基因組測序揭示了反芻動物演化背後的遺傳機制|Science述評
繼而,團隊研究人員利用全基因組比對獲取的373Mbp基因組直系同源共線序列,以虎鯨為外群構建了51個反芻動物的基因組系統發育樹(nDNAtree)(圖1A)。基於不同數據(中性位點(4D sites),CNEs, 完整線粒體(mtDNA))構建的系統發育樹則進一步驗證了基因組系統發育樹拓撲結構的可靠性。
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金魚草全基因組精細圖譜公布
近日,中科院遺傳與發育生物學研究所研究員薛勇彪領銜的團隊聯合英國等科學家共同發布了「金魚草全基因組精細圖譜」,「講述」了金魚草的進化故事,或為揭開謎底提供線索。 「我不只代表金魚草」 「顏值」迷人,質感如娟,成為園藝植物中的「明星」,金魚草當之無愧。
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研究揭示家犬和人強迫症之間的遺傳趨同
強迫症是一種異質性較高的精神疾病,其表型、遺傳和病因均有明顯的多樣性,所以在人類群體中探索強迫症的潛在遺傳和生物學機制面臨困難。家犬是最早馴化的家養動物之一,在自然條件下亦受到強迫症的折磨,且與人類強迫症具有多種相似表型。因此,開展家犬強迫症的遺傳和細胞學研究有助於闡明二者強迫症共享的生物學機制。
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新研究首次揭秘中國人群基因遺傳特徵—新聞...
新研究首次揭秘中國人群基因遺傳特徵這是由中國科學家主導,歷時兩年,對14餘萬中國人的無創產前基因檢測數據進行深入研究後,首次揭秘中國人群基因遺傳特徵的科研成果,也是由華大主導的「百萬人群基因大數據研究」項目的首秀。
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人類和家犬的強迫症之間顯著的遺傳趨同
來源:王國棟團隊強迫症是一種異質性極高的精神疾病,其表型、遺傳和病因均具有明顯的多樣性,使得在人類群體中探索強迫症的潛在遺傳和生物學機制異常困難。家犬作為最早馴化的一種家養動物,在自然條件下亦受到強迫症的折磨,且與人類強迫症具有多種相似表型。因此,開展家犬強迫症的遺傳和細胞學研究將有助於闡明兩者強迫症共享的生物學機制。
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金魚從鯽魚演化而來?「國粹」金魚的前世今生—論文—科學網
論文共同第一作者、閩江學院唐唯其博士說,此次構建的金魚基因組在學術上的貢獻非常大,不僅為異源多倍體脊椎動物的基因組演化提供新見解,還可以促進整個金魚行業的發展。「原來沒有基因組時,大家『摸著黑』走路,現在有了基因組這張『地圖』,很多研究工作都可以相繼開展。」他告訴《中國科學報》。
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昆明動物所揭示家雞體型的遺傳機制
雖然全基因組關聯分析(GWAS)已成為研究人類疾病和動物複雜性狀的新手段,但是該技術需要收集大量的表型數據,工作繁瑣,研究周期長,成本高。因此,GWAS未能在家雞複雜性狀研究中得到廣泛的應用。隨著二代測序技術和比較群體基因組學分析方法的飛速發展,通過對不同品種群體的基因組進行比較分析成為研究複雜性狀進化的遺傳機制的有力手段。
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「國粹」金魚的前世今生
論文共同第一作者、閩江學院唐唯其博士說,此次構建的金魚基因組在學術上的貢獻非常大,不僅為異源多倍體脊椎動物的基因組演化提供新見解,還可以促進整個金魚行業的發展。「原來沒有基因組時,大家『摸著黑』走路,現在有了基因組這張『地圖』,很多研究工作都可以相繼開展。」他告訴《中國科學報》。
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C位勢不可擋:安諾三代測序助力蜱蟲基因組喜登Cell
該研究基於組裝獲得的高質量參考基因組,首次闡明了蜱蟲基因組與群體遺傳結構多樣性,解析了蜱蟲吸血的遺傳機制,揭示了蜱媒病原體的分布特徵,為深入開展蜱蟲及蜱媒病的機制研究奠定了基礎。 圖1 蜱蟲基因組特徵及進化分析 蜱蟲吸血的遺傳基礎及表型
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斑馬魚1號染色體全基因敲除取得進展
在斑馬魚研究歷史上,歐美學者發起過幾次大規模的隨機誘變突變體庫,開展基於「從表型到基因型」的正向遺傳學篩選,奠定了斑馬魚作為國際公認模式動物的重要基礎。隨著斑馬魚全基因組測序的完成和CRISPR/Cas9等基因組編輯技術的成熟,規模化靶向構建斑馬魚基因敲除突變體庫,系統開展「從基因型到表型」的斑馬魚反向遺傳學研究成為可能。
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色彩繽紛形態奇,頭上肉瘤水泡眼:「國粹」金魚的前世今生
論文共同第一作者、閩江學院唐唯其博士說,此次構建的金魚基因組在學術上的貢獻非常大,不僅為異源多倍體脊椎動物的基因組演化提供新見解,還可以促進整個金魚行業的發展。「原來沒有基因組時,大家『摸著黑』走路,現在有了基因組這張『地圖』,很多研究工作都可以相繼開展。」他告訴《中國科學報》。
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證實家犬和人強迫症存在遺傳趨同性
本報訊 近日,昆明醫科大學、中國科學院昆明動物研究所等機構研究人員利用全基因組分析,發現人類和狗之間的強迫症有顯著的趨同性。相關論文刊登於《科學通報》。強迫症是一種異質性較高的精神疾病,其表型、遺傳和病因均有明顯的多樣性,所以在人類群體中探索強迫症的潛在遺傳和生物學機制面臨困難。家犬是最早馴化的家養動物之一,在自然條件下亦受到強迫症的折磨,且與人類強迫症具有多種相似表型。因此,開展家犬強迫症的遺傳和細胞學研究有助於闡明二者強迫症共享的生物學機制。
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科學家利用全基因組測序發現多種罕見疾病
科學家利用全基因組測序發現多種罕見疾病 作者:小柯機器人 發布時間:2020/6/28 14:48:03 英國劍橋大學Willem H. Ouwehand、F.
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熱科院破譯香蕉枯萎病病菌基因組的遺傳密碼
熱科院破譯香蕉枯萎病病菌基因組的遺傳密碼 為該病害的致病機理研究提供重要基礎 本報訊(記者範南虹 通訊員田婉瑩)香蕉枯萎病是香蕉的一種毀滅性病害,全世界幾乎所有香蕉種植區都有分布。近日,中國熱帶農業科學院生物所宣布,該院已經完成香蕉枯萎病菌1、4號小種全基因組測序工作,在國際上率先破譯香蕉枯萎病菌基因組的遺傳密碼。 香蕉枯萎病,是一種通過土壤傳播的香蕉傳染病,病菌從香蕉受傷根莖侵入,向主莖和葉片蔓延,導致香蕉整株枯萎死亡,可使發病地區30年以上不能種植香蕉,是威脅全球香蕉種植業的最大殺手。
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我國科學家首次揭示獅子魚深淵適應遺傳基礎
中國科學院水生生物研究所和深海科學與工程研究所、西北工業大學等單位聯合攻關,對生活在馬裡亞納海溝7000米以下的獅子魚開展了多方面的深入研究,在分類學上釐清了其系統地位,首次在形態上發現了適應深淵的變化,在多組學大數據分析的基礎上揭示了獅子魚深淵適應的遺傳基礎。
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人類全基因組測序成本從300萬降至500美元
而隨著基因測序技術的不斷進步,全基因組測序成本從300萬美元降至500美元,在有生之年,我們或許可以一窺自己生命最本質的秘密。從300萬美元到500美元目前,市面上的大多數基因檢測產品覆蓋的基因位點非常少,根據項目不同,所檢測的基因位點也有差異,大概只佔人類全部基因的0.1%以下,難以完整揭示個體完整的基因組信息。全基因組測序則不同,可以獲取個體的全部基因序列差異和結構變異信息,與此相對應的是,價格大多也十分高昂,多用於科研院所進行相關研究,個人很少會選擇。
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金魚是鯽魚變的?哪些基因控制性狀?「親子鑑定」或給出答案
該成果由福建相關高校學者歷時3年協作完成,首次從基因組學上驗證並豐富了我國學者金魚研究先驅陳楨教授關於金魚演化的理論,深入探討了金魚的起源、演化、馴化和人工選擇。記者了解到,該研究中發布的高質量金魚基因組和多樣性數據,為金魚作為大量候選功能基因的模型,以及廣泛的家養物種進化案例研究提供了新的知識和資源。
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我國科學家首次揭示獅子魚深淵適應遺傳基礎—新聞—科學網
中國科學院水生生物研究所和深海科學與工程研究所、西北工業大學等單位聯合攻關,對生活在馬裡亞納海溝7000米以下的獅子魚開展了多方面的深入研究,在分類學上釐清了其系統地位,首次在形態上發現了適應深淵的變化,在多組學大數據分析的基礎上揭示了獅子魚深淵適應的遺傳基礎
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國內首個魚類全基因組精細圖譜破譯
國內首個魚類全基因組精細圖譜破譯2014-02-13 10:56:00 水產養殖網 出處:青島日報 瀏覽量: 1874 次 我要評論 國內首個完成的魚類全基因組精細圖譜,也是國際首個比目魚基因組——半滑舌鰨全基因組序列圖譜日前在國際著名學術雜誌《自然·遺傳》發表。這也是我國漁業領域在此雜誌上發表的首篇論文。