連花清瘟是一個複方中藥，組方中有十三味中藥，即使是一種中藥含有的有效成分也非常之多，如大黃含有蒽醌類、蒽酮類、二苯乙烯類、多糖類及鞣質等，其中的蒽醌類物質又含有大黃酸、大黃酚、蘆薈大黃素等十幾種有效成分，可見一個十三味中藥的複方中藥有效成分之多。因此《中藥材》雜誌刊發的《連花清瘟治療新型冠狀病毒（2019-nCoV）肺炎網絡藥理學研究與初證》一文篩選出連花清瘟活性成分378個，應對新冠病毒的作用靶點達55個，因此連花清瘟防治新冠肺炎不僅體現在其組方特色上，藥理學研究也證實了該藥是通過多種有效成分作用於病毒的靶點，從而發揮治療作用。
連花清瘟複方組合選擇歷代治「疫」名方名藥
連花清瘟是運用中醫絡病理論探討外感溫病及瘟疫傳變的規律及治療，提出「積極幹預」治療對策，制定「清瘟解毒，宣肺洩熱」治法，研製出的一個複方中藥。其組方吸取了歷代醫家治療疫證的用藥精華，以漢代張仲景《傷寒論》中專治疫病的麻杏石甘湯與清代吳鞠通《溫病條辨》中專治疫病的銀翹散化裁，汲取明代吳又可《溫疫論》治疫證用大黃經驗。麻杏石甘湯，宣肺洩熱、止咳平喘；銀翹散，清瘟解毒、辛涼宣肺，兩個藥方針對疫病發熱咳嗽、喘促氣短用藥。現代藥理研究發現，兩個藥方都具有良好的退熱、止咳、抗炎、抗病毒作用。辛涼宣肺與洩熱，可以解決新冠肺炎患者體溫持續不降的問題；清肺止咳平喘，可以改善新冠肺炎患者的咳嗽不止，呼吸困難；抗炎抗病毒作用可以抑制新型冠狀病毒的複製，抑制病毒感染引起的系統性炎症反應。從中醫的角度認識，整個組方衛氣同治，表裡雙解；先證用藥，截斷病勢；整體調節，多靶治療。
除應用麻杏石甘湯與銀翹散之外，連花清瘟處方還具有三大用藥特點，首先採用大黃通腑洩肺，肺與大腸相表裡，讓「疫毒」從大便排出，使邪有出路；使用大黃另一價值是先證用藥，截斷病勢。明代吳又可曾指出：瘟疫治療宜在人體正氣未衰之時，及早攻逐邪氣，提前應用通便的大黃，可以截斷病情向危重傳變。本次新冠肺炎有些患者大便溏薄，這是瘟邪穢濁聚集在腸道，並不妨礙應用大黃逐邪外出，這也正是中醫通因通用之法。現代藥效研究證實大黃具有抑制肺部炎症，改善肺功能作用。
第二，藿香也是一味歷代選用的治「疫」名藥，芳香化溼、避穢化濁。本次新冠肺炎有一個突出特點，就是溼邪濁毒偏重，病人表現為食慾極差，大便粘滯不爽，藿香正可以避穢化濁，改善食欲不振、溼困脾胃的狀況。況且藿香一藥也是藿香正氣散中最主要的藥物。
第三，連花清瘟中還有關鍵的一味藥是紅景天，它生長在高寒、高海拔地區，具有補肺平喘活血作用，可以提高人體抗疲勞、耐缺氧能力，以應對新冠肺炎患者普遍表現的乏力、氣短、血氧含量低造成的多臟器損害。同時紅景天增強免疫的作用可以改善患者淋巴細胞及亞群偏低造成的機體抗病能力下降，提高機體的抗病康復能力。
連花清瘟多種成分發揮治療作用
《中藥連花清瘟抗新冠肺炎分子機制的理論研究》在化學領域論文平臺ChemRxiv在線發表。
日前，廣東汕頭大學化學系、南京中醫藥大學、中科院上海藥物研究所新藥研究國家重點實驗室、香港中文大學（深圳）生命與健康科學學院的研究團隊在線發表了《中藥連花清瘟抗新冠肺炎分子機制的理論研究》論文。研究者將連花清瘟中21種化合物和新冠病毒的作用主要蛋白酶對接，結果顯示蘆丁、連翹脂苷E、金絲桃苷的作用分數均優於洛匹那韋。其中，金絲桃苷是新冠病毒主要蛋白酶最可能的抑制劑，而金絲桃苷恰恰是連花清瘟中連翹的主要成分之一。
研究團隊將連花清瘟中21種化合物和新冠病毒的主要蛋白酶對接打分，蘆丁、連翹脂苷E、金絲桃苷的分數都優於洛匹那韋。
研究團隊還構建了成分靶向通路，通過網絡藥理學分析顯示，連花清瘟中的成分和提高人體免疫力的重要通路相關，他們指出，病毒性肺炎涉及感染、炎症、免疫等多個過程，在10種炎症和免疫信號通路中，紅景天甙、苦杏仁甙、獐芽菜苷、大黃素-8-O-β-D-葡萄糖苷、芒柄花黃素、綠原酸、金絲桃苷和蘆丁發揮的作用更大。這表明連花清瘟中的活性成分具有明顯的抗炎作用，可以激活T細胞胞質增加T細胞表達，提高人體免疫力，減輕新冠肺炎症狀。
研究結果表明：連花清瘟可通過關鍵分子激活的抗病毒、抗炎等協同作用減輕新冠肺炎患者的症狀，還具有增強免疫的作用，這也符合中醫藥多成分、多靶點、多途徑綜合治療複雜疾病的特點。
網絡藥理學證實連花清瘟的多靶點作用
天津中醫藥大學第一附屬醫院王林等人在《中藥材》雜誌發表了《連花清瘟治療新型冠狀病毒（2019-nCoV）肺炎網絡藥理學研究與初證》一文。該研究利用TCMSP、TCMID資料庫和相關文獻篩選出連花清瘟的活性成分及靶標。研究結果顯示，篩選後共獲得連花清瘟活性成分378個，潛在作用靶點282個，與2019-nCoV共同靶點55個，說明連花清瘟可以確定地作用於新型冠狀病毒的靶點達55個，這也讓我們明確了為什麼連花清瘟對於新冠肺炎具有確切的治療作用，研究中還發現連花清瘟有關鍵化合物22個，前9名主要有槲皮素、木犀草素、山奈酚、谷固醇、柚皮素、刺槐素、蘆薈大黃素、漢黃芩素、芫花素，其中槲皮素度值最大，靶點數最多，說明其作用可能最顯著。據報導槲皮素具有抗炎、抗病毒和免疫調節等藥理學作用，它也是連花清瘟中連翹、金銀花的主要成分，同時槲皮素對甲流（H1N1）等均有一定的抗病毒作用。
鍾南山院士研究團隊最近在國際期刊《藥理學研究》發表了《連花清瘟對新型冠狀病毒具有抗病毒、抗炎作用》的論文，這是中成藥有效抗新型冠狀病毒SARS-Cov-2的首篇基礎性研究文章。該研究發現，連花清瘟能顯著抑制新型冠狀病毒在細胞中的複製，連花清瘟處理後細胞內病毒顆粒表達顯著減少。炎症風暴是機體對病毒、細菌等外界刺激產生的一種過度免疫反應，成為新冠肺炎由輕症向重症和危重症發展的重要節點。連花清瘟能顯著抑制新型冠狀病毒感染細胞所致的炎症因子TNF-a、IL-6、MCP-1和IP-10的基因過度表達。這項研究揭示了連花清瘟在新冠肺炎中確切療效的藥理學作用基礎，證實了連花清瘟通過抑制病毒複製、抑制宿主細胞炎症因子表達，從而發揮抗新冠病毒活性的作用，為連花清瘟治療COVID-2019的應用提供了可靠證據。