11月13日至11月22日,第十六屆國際遺傳工程機器大賽(International Genetically Engineered Machine Competition,iGEM)決賽在線上舉行。
由中國海洋大學海洋生命學院科技協會7名本科生組成的iGEM團隊OUC-China榮獲國際金獎。團隊已連續五年斬獲國際金獎,並首次獲得Best Part Collection單項提名獎。
線上舉辦國際遺傳工程機器大賽(iGEM)
2020年iGEM團隊OUC-China由海洋生命學院2018級生物技術1班陳潮昕、2018級生態學1班吳琪、2018級生物科學1班柯清瀅、2018級生物科學1班牛悅,食品科學與工程學院2018級食品科學與工程2班王婷,水產學院2018級水產養殖學2班張伊凡,化學化工學院2018級化學2班魏費雯組成。
團隊以海洋生命學院實驗教學示範中心科研創新實驗室為依託,在老師的指導下採取自我組織、自主管理、自由選題的方式來運行,充分發揮同學們的專業優勢,實現多學科交叉融合。
團隊成員合影
生物計算機具有巨大的應用潛力,而邏輯門是生物計算機的核心組成部分。團隊選擇了具有低代謝壓力和廣泛的動態調節範圍的toehold switch和3WJ repressor以構建不同類型的邏輯門,致力於收集和補充邏輯門的類型,優化RNA開關的動態範圍,實現可組合性和多輸入性。
為了實現目標,團隊收集了OR、AND、NOT、NOR、NAND和NIMPLY,並設計了IMPLY和XOR來補充現在仍缺乏的邏輯門類型。團隊創造性地將3WJ repressor和toehold開關結合起來,實現了IMPLY。XOR則是由一個toehold開關和兩個trigger組成。
此外,該團隊還在trigger的5'端增加髮夾結構,以提高trigger穩定性;設計閾值計算軟體,以提高通用性;利用sigma因子等反式作用因子,以提高兼容性。團隊還設計了更複雜的多輸入邏輯門和交換邏輯門來展示更多的邏輯門的可能性。為了展現這些邏輯門廣闊的應用前景,將其用於運算器的構建和病毒的檢測。
研究演示
團隊延續去年傳統,繼續豐富合成生物學科普漫畫冊章節,讓科普變得更加生動有趣。除此之外,今年還致力於開展貧困地區的科普活動,通過學校和學院團學組織積極對接雲南省綠春縣助力教育扶貧,以直播授課、視頻錄製及漫畫科普等多種形式,向更多的人科普合成生物學。
科普線上講座
據了解,今年共有來自世界各地242支隊伍,超過3000人通過線上參與這項賽事。OUC-China作為學校第十支iGEM團隊,克服新冠肺炎疫情困難,認真籌備賽事。團隊繼2011年參賽以來,先後獲得亞洲銅獎、亞洲金獎、亞洲Best model單項獎、全球銅獎、全球銀獎、全球金獎,全球Foundational Advance單項大獎以及2014年度「小平科技創新團隊」稱號。
來源 / 中國海洋大學
作者 / 陳潮昕 賈希望
編輯 / 劉蒞