剛接觸養魚的朋友都知道，開缸養水就是培養有益菌群，而魚缸裡一個最重要的系統就是硝化系統，硝化系統的主要功能是將氨（NH3）氧化為亞硝酸鹽（NO2－），或將亞硝酸鹽氧化為硝酸鹽（NO3－），那麼這兩個過程是有誰來完成的呢？這就是今天我們要討論的亞硝酸菌和硝酸菌了，這兩種菌也就是我們常說的硝化菌。其實很多人都認為，硝化系統就是硝化菌組成的，其實不然，個人認為在魚缸裡，硝化系統是由有機物、魚、異養菌、硝化菌所組成的。那我們就先說說硝化菌，首先硝化菌是好氧菌，它需要有氧的環境才能生長，但絕不是說魚缸裡一定要打氧，有些魚友覺得如果氧氣泵停了，硝化菌就會死亡，其實硝化菌沒那麼脆弱，一般水體與空氣接觸本身就是有溶氧的，所以不必那麼擔心，但是封閉的環境就要注意了，比如濾桶。當然，硝化菌一定要在水裡才能存活，乾燥的環境是沒有硝化菌的。
其次，魚友們經常在糾結一個問題，那就是硝化菌到底要不要添加。個人認為，你可以不加，因為當魚缸裡的氨化系統分解有機物產生氨到一定程度後，硝化菌會自動生成，但因為硝化菌是自產自銷的細菌，繁殖較慢，所以自然建立硝化系統時間會比較長，一般要一個月左右。而新開缸的魚友都比較心急 ，想快點建立起硝化系統，給小魚舒適的環境，那我認為你可以添加成品硝化菌，以加快硝化系統的建立。不過現在市面上硝化菌品種繁多，良莠不齊，特別是有一些硝化菌產品是那種黃色帶有腥臭味的液體，那裡面根本就沒有或者很少有硝化菌活菌，其實那些液體就是培養基液，不好用還壞水，我建議新開缸可以購買科迪或者百因美的針劑硝化菌，畢竟是大品牌，口碑也非常好，活菌數量也多，也不要買多，3-5支就足夠了，新缸入水爆氧一天後加1支，然後每10-15天換水後加一支，一個月後就不需要加這個了，至於以後，可以在每次換水後加些膠囊乾粉或者便宜點的硝化菌維持一下，但是一定要記住哦，硝化菌是無色無味的！！！
科迪硝化細菌
百因美硝化細菌
最後，我們來說說如何培養硝化菌吧。眾所周知，硝化菌是厭光菌，不喜歡有光的環境（但不是見光死），硝化作用一般也都是晚上的時候進行，而且硝化菌需要附著在粗糙的固體上才能繁殖，所以我們需要一些可以讓硝化菌附著的東西，一般有以下這些：細菌屋、陶瓷環
生化棉
石英球，火山石等。
這些東西一般都是放在過濾盒裡，添加成品硝化菌也是加到過濾盒裡，有些魚友說直接倒缸裡，也可以，不過建議晚上關燈之後倒進去。最最後，說幾個魚友對硝化系統的誤區吧！ 1、硝化菌可以分解魚便----不可能的，分解魚便是氨化系統幹的活兒，這事兒不歸硝化系統管，它也管不了。硝化菌不僅不能分解魚便，魚便這些有機物還是硝化菌的天敵，被有機物侵佔的濾材硝化菌就無法在上面生長繁殖。
2、硝化菌可以使渾水變清----這也是不可能的，有很多魚友說我的水渾了，加了硝化菌之後一兩天就變清了，這不是硝化菌的功勞嗎？其實這跟硝化菌也沒什麼關係，水體渾濁有物理渾濁和生物渾濁，物理渾濁只要加強物理過濾就OK，而生物渾濁加硝化菌是沒有用的，曾經遇到一個魚友說他徹底清洗了濾材，導致硝化系統崩潰，從而使得水變渾了，那為什麼會變渾呢？是因為硝化菌都死了？個人認為是異營菌大量繁殖從而使水變得渾濁，因為細菌很小我們肉眼是看不到的，但是當它大量繁殖的時候，就會產生乳光，改變水的折光率，使光發生散射，造成水的澄明度下降，我們看到水的白濁就是細菌大量繁殖後改變了光的反射造成的結果。那為什麼加了硝化菌後就變清了呢？？硝化菌的作用是分解水中的毒素，但是這也是需要時間的，從你加硝化菌到硝化菌在濾材上附著，然後再工作，這本身就需要一段時間，不是一兩天就能完成的，畢竟硝化菌還有活化的過程不是嗎？水變清了，個人認為是異營菌在大量繁殖之後耗盡了魚缸裡的養分出現大量死亡，從而使水變清了。 3、硝化菌能殺菌----這更是不可能的，雖然硝化作用會產生亞硝酸鹽，但亞硝酸鹽很快就會被轉換成硝酸鹽，這中間亞硝酸鹽的濃度達不到殺菌的作用。