《魔法少女小圓》除了新房子和舊虛擬空間的完美配合之外，還有另一點非常重要。也就是說，故事很清楚。《魔法少女小圓》為什麼成為神，只有十二集動漫，卻有五條世界觀。
要知道，在十二集中，很難完全講述一個故事。更不用說了，添加各種情感線和預兆。魔法少女小圓不僅做到了這一點，而且還在這個緊湊的空間中添加了五條世界觀，每條線都清晰可見。
最初的在宇宙復位之前在這條線中講述了孵化者的故事，因為孵化者需要能量獲取，而最快的方法就是孵化魔女。因此，他們發現了可以產生能量和人類情感的東西。於是開始尋找籤名者。在這一方面，學姐是第一個籤約的人，而小圓是第二個籤約的魔術少女。為了拯救小圓，曉美焰希望拯救小圓，因此來到了第二世界觀。
在第二世界觀中，曉美焰和圓神一起戰鬥，但在女巫之夜的面前慘敗。小圓被汙染，小梅妍發現了女巫的真正秘密。由於這個願望，曉美焰以她的記憶來到了第三世界觀。在第三世界觀中，沙耶香以及杏子加入，曉美焰解釋了這一陰謀，但沒人相信。沙耶香化為女巫，在擊敗沙耶香後，學校姐姐殺死了杏子。於是小圓殺死了薛姐姐，在女巫的第二天晚上，她再次失敗了，來到了第四世界觀。
在第四世界線中，曉美焰被認為是成功的。因為她成功地阻止了圓神在女巫之夜之前籤署合同。但是在女巫的夜晚，袁慎發現，為了拯救曉美焰，圓神籤署了一份合同。但是正因為如此，圓神變成了巫婆，所以有了第五條世界觀。
在這最後的世界線中，由於因果糾纏，圓神已成為最強大的女巫。隨著學姐和其他人的去世，原深承諾要使女巫從所有時間表上消失，從而完全制止悲劇並重設宇宙。曉美焰也實現了她的願望，因此她不再越過世界界限。在這行的結尾，魔法女孩成為了升級怪物的一種方式，避免了最終成為女巫的悲劇。
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