臺灣島河川眾多，水網密集，但受地形、地質結構與氣候等因素的影響，河流流程短，水勢湍急，險灘瀑布多，水力資源較為豐富。
臺灣共有大小河流約150條，總長度42000公裡，平均每平方公裡擁有1.17米長的河流，是我國水網最密集地區之一。高聳入雲的中央山脈成為臺灣島水系與河流的重要分水嶺，其東部和河流注入太平洋或東海，西部河流則注入臺灣海峽。較長的河流主要分布在西部，東部河流均不超過100公裡。
臺灣本島主要河流有19條，長度在100公裡以上的有6條，分別為濁水溪、高屏溪、淡水河、大甲溪、曾文溪與大肚溪。濁水溪為臺灣第一大河流，全長186.4公裡，發源於中央山脈的合歡山主峰與東峰之間的武嶺，流域面積為4324平方公裡。高屏溪又名下淡水河，全長170.9公裡，是臺灣第二大河流，發源於玉山山脈東麓和中央山脈的秀姑巒山西麓，流域面積3256平方公裡。淡水河全長158.7公裡，是臺灣第三大河流，主要支流有基隆河、新店溪與大漢溪，流域面積為2705平方公裡。大甲溪發源於中央山脈西麓，全長140.2公裡，流域面積1272平方公裡。曾文溪全長138.5公裡，流域面積為1212平方公裡。大肚溪又名烏溪，全長116.8公裡，是臺灣第六大河，流域面積2072平方公裡。
臺灣湖泊相對較少，並多進行了人工改造，成為人工湖，即水庫，兼有蓄水、防洪、灌溉、發電、公共用水與觀光旅遊等多種功能。臺灣的湖泊和水庫的分布，受水系影響明顯，也呈西多東少的特點。臺灣較大的湖泊和水庫約90個，分布在東部的只有花蓮縣境內的鯉魚潭、光復湖，臺東縣的大埤池，宜蘭縣的龍潭湖、梅花湖等9個，其餘均分布在西部。
臺灣最大的天然湖泊是日月潭。日月潭位於南投縣魚池鄉水社 村，湖面海拔750米，面積900多公頃，水位最深46米。湖中有一小島，此島北半部形如日輪，南半部狀似上弦月，故名日月潭。這裡是臺灣最負盛名的風景旅遊區，翠山碧湖，風光旖旎，早在清代就被稱為臺灣「八景」之一。
除日月潭外，全省天然湖湖面積超過100公頃的還有龍鑾潭和鯉魚潭。龍鑾潭位於臺灣島最南端的恆春半島平原上，面積約137公頃，蓄水量為342萬立方米，是當地最主要的水利灌溉水源。鯉魚潭位於花蓮縣臺東縱谷的壽豐鄉池南村，因鯉魚山而得名，面積104公頃，是臺灣東部最大的湖泊，也是知名的風景區。
另外，在中央山脈和雪山山脈的山脊兩側還有10多個高山湖泊。其中面積最大的是七彩湖，又名七星湖，湖面海拔高2900米，面積約2公頃。海拔最高的高山湖泊是翠池，位於雪山主峰的西側，是由冰川作用產生的冰河圈谷河，海拔高3520米，面積約100—130平方米。
臺灣水庫興建較早，目前計有40個左右的水庫，主要有曾文水庫、石門水庫、澄清湖、德基水庫與青草湖等。臺灣興建最早的水庫為臺南縣新化鎮的虎頭埤水庫，也是一著名的風景區。目前臺灣規模最大的水庫是曾文溪，又稱大禹潭，位於曾文溪上遊，嘉義縣大埔鄉境內，蓄水量為7億多立方米，滿水時水域面積為1700公頃，灌溉面積7.6萬平方公裡，是臺南地區最主要的灌溉水源。