科級幹部與處級幹部雖然只是上下級差距，但從職級來看，正科級幹部要比正處級幹部低2個級別，所以兩者退休後的待遇差距還是非常大的，再加上地區、財政收入等因素的影響，這種差距甚至是成倍的。
以正科級、正處級幹部為例，正科級是市級以下鄉鎮地區一把手，比如鄉鎮長、縣各局局長、鄉鎮書記等都是正科級幹部，對應的公務員級別是16～23級； 正處級是縣級機關單位一把手，比如縣長、縣委書記、縣各局局長等都是正處級幹部，對應的公務員級別是12～18級。
正科級幹部與正處級幹部的退休待遇主要體現在兩個方面。
從目前來看，無論什麼類型的公務員，其退休金是在職期間的80%以上，也存在退休工資比在職工資高的現象，具體有多少受職務、工齡、任職年限等因素的影響。
根據2020年公務員工資套改等級標準來看，正科級與正處級的基本工資也有不小的差距。正科級幹部是16級5檔，其中級別工資是969元職務工資是1145元，每個月的基本工資加起來就是2111元；正處級幹部是12級5檔，其中級別工資是1354元職務工資是1835元嗎，每個月的基本工資加起來就是3189元。正科比正處每個月少拿1075元的基本工資。
但是公務員的工資由基本工資+補貼+獎金+津貼四個部分組成。要知道，基本工資只佔總收入10%到50%不等，越發達的地區比例也就越低。以30%為例，也就是說正科級幹部的工資在7000元左右，按50%比例計算只有4200塊錢左右，正處級的工資在10600元左右，按50%的比例計算只有6300塊錢左右。
退休金按在職期間的90%計算，那么正科級幹部的退休金每個月是6300元左右， 而正處級幹部的退休金每個月是9500元左右，正科級幹部足足比正處級幹部少3200元。當然，中西部地區的退休金差距相對較低，可能也就1000元左右，經濟越發達這種差距也就越大。
除了退休金方面的差距，待遇方面也有不小的差距。根據退休規定，正科級幹部在退休後只能享受普通職工的待遇，而正處級幹部在退休後卻能享受領導幹部的待遇，比如醫療補貼、節假日福利等，這些只有正處級幹部在退休後才能享受，正科級幹部是無法享受的。