新型離心萃取機工作原理主要包括兩個工作過程，即混合傳質與離心分離。
一、混合傳質：
水相和有機相進入離心萃取機後由高速旋轉的轉鼓或槳葉剪切分散成微小液滴，使兩相充分接觸，從而達到傳質的目的。
影響傳質效果的因素：
1、混合強度：在一定範圍內，混合強度越大，兩相分散的微粒越小，其接觸面積越大，越有利於傳質的進行，但液滴太小不利於分離。提高轉速或更換剪切力較強的槳葉可以增大混合強度。
2、接觸時間：兩相接觸時間的增加有利於傳質的進行，當傳質過程達到平衡時，接觸時間的增加不會提高傳質效果，通常減小流通量可以獲得較長的接觸時間。
3、溫度：溫度會影響傳質效果，有的體系的傳質效果隨著溫度的升高而提高，有的體系的傳質效果隨著溫度的升高會下降。
4、物質濃度差：物質濃度差越大越有利於傳質。
新型離心萃取機工作原理圖二、離心分離：
水相和有機相經過混合後形成的混合液進入轉鼓，在轉鼓及其輻板的帶動下，混合液與轉鼓同步高速旋轉而產生離心力。在離心力作用下，密度較大液體在向上流動過程中逐步遠離轉鼓中心而靠向鼓壁；密度較小的液體逐步遠離鼓壁靠向中心。最終兩相液體分別通過各自通道進入收集腔，兩相再從各自收集腔流出，從而完成兩相分離過程。
影響分離效果的因素：
1、表面張力：較大的表面張力有利於分離，其大小與溫度和界面兩相物質的性質有關。
2、粘度：低粘度有利於分離，通常提高溫度可以降低粘度。
3、密度差：兩種液體的密度差越大，越容易分離。
4、分離時間：增加分離時間可以提高分離效果，通常減小通量可以增加分離時間。
5、離心力：增大離心力可以提高分離效果，通常提高轉速或同轉速下增加轉鼓直徑可以提高離心力。
6、界面位置：界面位置的變化在某種程度上會影響分離效果，重相堰可以調節兩相的界面位置。