反滲透膜的清洗周期根據現場實際汙染情況而定。正常的反滲透（ro）清洗周期是每 3-12 個月一次。如果在1個月內清洗一次以上，需要改善預處理例如追加投資或重新設計膜系統；如果反滲透膜（ro）清洗周期在1-3個月一次，應側重於調整和優化現有系統的運行參數。
反滲透膜即使系統長期沒有發生汙染，投加反滲透阻垢劑後膜還會受到其他汙染物汙染，為了能夠更好地保證系統正常運行常規清洗是必要的，一般可考慮每6個月以上進行1次維護性化學清洗。
反滲透（ro）膜清洗注意事項：
1) 正常反滲透清洗時，清洗系統壓力採用使系統基本不能產出純水時的壓力為最好，清洗液溫度基本保持在20-40℃。必須用反滲透產品水或去離子水配製清洗藥液，藥液混合要均勻。
2) 反滲透清洗時要將反滲透壓力容器和管道內的存水排掉，再把清洗過程衝產生的濃縮液向清洗藥箱循環。如果回流清洗液明顯變色或渾濁應重新準備清洗藥液。若回流清洗液PH變化超過0.5，應重新調整PH或更換清洗液。
3) 按規定時間清洗完成後，應立即用反滲透產品水或去離子水進行衝洗。衝洗時間一般為30-60分鐘，並將反滲透出口水放掉（開產水不和格自動門、衝洗濃水測排放自動門）。
4) 確認衝洗完成後，最好立即投入正常運行，化學清洗後至投入運行時間不得超過24小時。