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如今多數課題組老師是將樣品送去生物公司進行測序和分析,但是前期的如何送樣呢,一些研一小白還是不太明白!這裡給要做轉錄組測序同學們幾點送樣建議!
一、危險樣品需注意:
多數公司拒絕接收《人間傳染的病原微生物名錄》中危害程度為第一、 第 二類的高致病組織、血液、細菌等樣品,只接收提取得到的核酸樣品。危害程度為第三 、 第四類的致病性或傳染性的組織、血液、細菌等樣品,必須事先通過銷售、客服或運營經理與技術人員聯繫,確定無高致病性和傳染性後才能寄送樣品。樣品寄送時應採用 WHO 提出的三級包裝系統:第一層容器:裝樣品 ,要求防滲漏;第二層容器:要求耐受性好、防滲漏 ,容納並保護第一層容器;第三層容器:放在一個運輸用外層包裝內。在第二層包裝註明「致病性樣品, 接收時請注意」字樣,並在樣品信息單上註明其危害程度及接收注意事項。此類樣品寄送時銷售或運營經理務必郵件通知樣品組,告知樣品組相關寄送信息 (快遞單號、樣品類型、 樣品數量)以及接收時的防護措施和注意事項。
二、常規樣品需注意
1 建議選用新鮮採集的樣品送樣。採集樣品時應選取核酸含量較多的部位 (如:植物的幼嫩部位,動物的肝臟等組織)。
2 植物樣品採集時建議用 Rnase free 水擦拭或衝洗乾淨,再用吸水紙吸乾樣品表面;動物樣品 採集時建議活體取材後用 Rnase free 水進行漂洗,以去除血漬 和汙物,並剔除結締組織和毛髮等 非研究組織。
3 體積較大的組織樣品離開活體後需要快速分割成 50-100mg 的小塊,液氮 速凍後放入預冷 螺紋的 EP 管中,-80°C保存,乾冰寄 送 。
4 不建議使用 RNAlater 等RNA 保護試劑保存植物組織樣品,因為一般植物細胞含有細胞壁,RNA保護試劑很難滲透到細胞中 。動物組織樣品使用 RNAlater 等保護試劑保存時請嚴格按 照相關產品的說明書進行操作。
5 菌體樣品除去培養基收集菌體後,立即液氮速凍,-80°C保存,乾冰寄送 。不建議用 RNAlater 保 存,因為 RNAlater 密度較大,提取時不易分離菌體。
6 若是血液樣本,需加入抗凝劑,推薦使用 BCT 管(或者 EDTA 抗凝管)收集樣品(由於會影響實驗,不能使用肝素抗凝)。取血後,顛倒搖晃幾次,封口處用封口膜封好。血液樣品中的RNA含量低且極易降解,強烈建議分離血液樣品中的白細 胞,液氮速凍,乾冰寄送。
三、 RNA 組織送樣量
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