一個低調奢華有內涵的單基因分析思路

許久沒有推出單基因分析思路了，很多粉絲常常會問到特定的單基因可以做什麼思路，根據小編的經驗來看單基因的思路是比較少的，很多都是發現調控軸然後做實驗驗證就完活了。因為研究的單一，能做的生信分析真的是很少很少，是真的不好分析，許多時候小編也是對此黔驢技窮，但是單基因分析接收率是真的高，因為專一嘛。今天的思路還挺別出心裁的，根據研究單個基因的互作基因來展開分析，小凳子搬好，開講了。

「免疫檢測位點相關的4-gene signature 預測低級別膠質瘤預後」，乍一看這題目真的跟單基因沒什麼關係哈，沒事慢慢來

流程圖：

有點長哈說明做的分析還是不少的，邏輯清楚易懂，看完應該都知道做了點啥東西了

具體內容：

1、選擇你感興趣的基因，多數據集給審稿人分析我為啥要做這個基因，秘訣是數據集越多越好。秉承優良的傳統：分析不夠數據來湊（這不是討巧的方式哦，概率越大越靠譜嘛）

2、重點來了，篩選你要做的基因的互作基因（小編認為你還可以根據相關性、調控關係等方式篩；篩什麼呢，你感興趣的比如：TF、miRNA、lncRNA、自噬基因等等，天馬行空的放飛你的腦洞就行（一定要有理有據哈））

做個功能、通路分析

嗯，缺個預後分析

對，我很無趣，那再做個預後signature，低級別膠質瘤數據集多，任性再做個驗證（就是這麼樸實無華有內涵）

3、前面的分析還是遠遠不夠的，不行我要升華一下讓審稿人看見我的低調奢華有內涵。研究基因的嘛，LGG呀肯定離不開IDH突變，表達結合臨床特徵來一波

要讓審稿人發現我的美，1p/19q聯合缺失也不能少

4、腫瘤分析怎麼能少得了免疫check位點呢，雖然我沒有免疫治療數據集可用，我也得分析一下，探索探索呀，讓審稿人看到我難能可貴的探索精神，分析和驗證集都整上！

5、GSEA加把驗證的小火苗點亮審稿人的小心心

6、分析總得應用於臨床，構建列線圖走起

看到這，審稿人已經給綠色通道了。小編覺得能加的東西還有很多很多比如浸潤、突變等，就不一一列舉了。明天見！