在神秘的埃及，因為考古專家發現了驚天的秘密，每隔五百年，地球就會大亂一次，因為會有邪惡的惡魔來摧毀地球，而解決的方法就是集齊五元素，啟動終極武器，幹掉惡魔，但有一夥兒善良的外星人覺得，繼續把第五元素放在地球上已經不安全了，所以開著飛船將第五元素帶走了，並跟看守這裡的神父說，等地球遇難，他們就會把第五元素送回來。
一晃，三百年過去了，惡魔侵佔地球的日期到了，結果連將軍帶總統都不知道，侵略者那是個什麼玩意，神父站出來說，這玩意是個十足的破壞者，你越攻擊，他就會越強大，但總統才不信呢，面對非法入侵，當然被暴力解決了，他只會手下開火，然後就傻眼了，侵略者的體積一下子增加了好幾倍，這時候神父又站出來解圍說，我們需要機器五元素度過難關，否則集體完蛋。
說曹操，曹操到， 300年前拿走第五元素的外星人送東西來了，但半路被另一夥外星人給幹掉了，美國政府只找到了唯一有生命特徵的殘骸，然後通過各種修復技術，他們看到了一個說鳥語的大美妞，其實大美妞就是第五元素，只是這群傻鳥，根本不知道，因為恐慌，大美妞逃了出去，剛好搭了男主型男哥的順風車。
因為型男哥是一個相當優秀的退役的軍人，所以載著大美妞各種穿行，躲過了政府的追捕，大美妞昏迷前艱難表達自己的意思，她要找一個叫omg的神父，然後型男哥不負眾望地將大美妞送到了神父那裡，神父得知大美妞是第五元素以後，直接興奮地暈倒了，他讓大美妞在電腦上了解人類的歷史，順便學習英語。
大美妞告訴神父，其他四大元素她知道在哪裡，不要擔心，而之前襲擊善良外星人的醜陋外星人，正拿著箱子，想去找陰險男做交易呢，陰險男給他們提供武器，他們幫陰險男拿到裝石頭的箱子，結果箱子裡啥都沒有，雙方鬧僵了。神父和政府兩波人都知道。石頭在一個外星歌劇家手裡。需要有人將石頭拿回來拯救世界。這個消息被陰險男的手下打聽到了。
所以三方都開始有所行動。神父想讓大美妞帶著他的徒弟小不點去拿石頭。而政府方面想讓型男哥帶著一個胖妞去完成任務。壞蛋這邊是陰險男親自出手。因為他是地球侵略者在地球的聯絡員，俗稱內奸。但最後神父和政府出任務的人直接合併到了一起。變成了大美妞和型男哥。兩人乘坐飛船來到了取石頭的地方，但走散了。型男哥被一個娘炮纏住。而大美妞就坐等歌劇家演出完畢取石頭了。結果醜陋外星人非得過來添亂。大美妞解決掉以後陰險男又無恥地過來撿漏。還安裝了定時炸彈然後大美妞被打成重傷不中了。陰險男打開箱子發現又被耍了。此時歌劇院一片混亂歌劇家中彈了。臨死前，她跟型男哥說，石頭在我身體裡一定要交給大美妞。
然後就掛了，型男哥帶著娘炮，娘炮帶著石頭。讓人穿越層層障礙，來到了武裝人員那裡。然後型男哥又快又準得把神父從外星人首領手裡救了下來。醜陋的外星人都老實了，因為一旦首領死了，他們也就相當於廢了最後型男哥帶著大美妞神父。小不點和娘炮來到了埃及的密室裡，將大美妞放在中間的石頭上。其他四塊石頭也分別放在了該放的地方。
然後世界安靜了，因為沒人知道開啟的方法，這個時候主角該體現睿智的頭腦了。型男哥發現了其中奧秘風元素就吹口氣，土元素就撒點土，水元素就整點水，火元素直接弄點火就行了。四元素準備完畢，就差最重要的第五元素。型男哥用愛喚醒了昏迷的大美妞。然後在千鈞一髮之際釋放了光束。輕鬆滅掉一直素未蒙面的侵略者。本劇最大的反派就這樣草率的掛了。是不是有人好奇陰險男怎麼樣了。當他發現箱子裡什麼都沒有的時候，又回到了歌劇院，終止了自己安裝的炸彈。卻被醜陋外星人的炸彈給炸死了。總之結局皆大歡喜。