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解讀基因的 「生命密碼」---深圳特區報
深圳特區報訊 （記者 韓文嘉 實習生 蔡敏鈴）昨日，華大基因CEO尹燁做客「深圳市民文化大講堂」，他以《四大夢想——基因帶來的福祉》為題，暢談基因，解讀關於基因的「生命密碼」。 「不管是懷孕前、產前、新生兒階段，都可以通過基因檢測的方式來確保這個孩子的健康」，尹燁在演講中介紹，通過基因測試可以檢測胎兒是否健康，通過這一方式，可以為孩子傳遞一份「與生俱來的基因健康」，許他們一個沒有罕見病的未來。 在講座中，針對嘉賓對轉基因的疑惑，尹燁說希望人們不要一提轉基因就害怕。
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腸道菌群重磅裡程碑：20.5萬基因組+1.7億基因被鎖定
因此，建立微生物參考基因組和基因的整合資料庫，是準確表徵腸道微生物物種分類和功能的重要步驟。本文生成了代表人類腸道微生物組的20萬個基因組和1.71億個蛋白質序列的基因集，其中的4,644個物種中，有71％缺乏培養的菌株，表明大多數微生物仍有待實驗表徵。本研究獲得的高質量參考基因組集可極大提高宏基因組研究的解析度和準確性，對人類腸道微生物組與表型的關聯分析提供了數據基礎。
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解密|腸道菌群與健康長壽|腸道菌群|微生物|益生菌|解密|長壽|疾病...
動物遺傳育種研究所李英團隊在《Current Biology》發表的一項關於壽老人和年輕人群腸道菌群研究發現長壽老人腸道菌群多樣性和菌群豐度顯著高於年輕組，這一結論在義大利相應人群中也得到了證實，提示更多有益菌群以及更豐富的菌群多樣性可能是人類健康長壽的重要原因之一。
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腸道菌群——被遺忘的器官
健康成人腸道內的微生物總量大約1-1.5kg，有1000多種，數量高達1014個，相比於正常人體自身細胞數量1013個，腸道微生物的數量是人類細胞數的10倍，而且編碼基因數目超過人體自身基因數目的100倍，是控制人類健康的「第二基因組」。人體每天排出糞便乾重的1/3由細菌組成，大多數為腸道細菌。
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揭秘懷雙胞胎基因是怎麼回事?懷雙胞胎的關鍵是什麼?
深圳特區報2018年10月11日報導，華大正式發布一項迄今為止最大規模的中國人基因組學大數據研究成果。研究人員發現一個和雙胞胎妊娠顯著相關的基因突變位點，意味著懷上雙胞胎的「關鍵」被找到，後代的真實身高也可能通過基因測算。
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腸道菌群與潰瘍性結腸炎
儘管IBD發病機制目前仍不清楚 ,早有研究發現在目前應用較多的小鼠DSS模型存在腸道菌群的變化，主要為擬桿菌和梭狀芽胞桿菌的增多，提示腸道菌群很可能參與小鼠DSS結腸炎的發病[ 2 ] ;用轉基因或敲除基因方法造成免疫缺陷的 IBD動物模型 [ 3, 4 ] ,在腸道無菌環境下不會發生腸道炎症，但如重新恢復腸道正常菌叢狀態，則出現腸道炎症。
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腸道菌群失調,仔細了解後才知道原因
當人體內外景象產生轉變時，腸道各菌群之間的平衡被攻破，導致有益菌、有害菌和條件致病菌的質與量產生轉變，這類景象稱為腸道菌群失調，由腸道菌群失調所激發的響應臨床症狀稱為腸道菌群失調症，重要的臨床默示為腹瀉、便秘、噁心、吐逆、消化不良等。
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Microbiome:腸道菌群ClpB基因功能與減肥和特徵性微生物群有關
背景：陪伴蛋白ClpB(一種細菌蛋白)是α-黑素細胞刺激素（α-MSH）的構象抗原模擬物，參與小鼠體重調節，在此我們研究了腸道菌群ClpB基因功能與人類肥胖狀況和腸道微生物群的潛在關聯。結果：腸道菌群ClpB基因的KEGG功能與體重指數、腰圍、總脂肪質量（DEXA）呈負相關。
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腸道菌群 | Science專刊:決定你健康狀況的"第二基因組"
不可否認的是，益生菌已經在重建和恢復一些人的健康腸道微生物方面，顯示出了巨大的潛力。然而，益生菌產業也面臨著巨大的挑戰，一些企業肆無忌憚地誇大益生菌的健康作用，在現有的監管框架下，制定嚴格的測試標準仍存在困難。宿主基因可調控特定種類的腸道菌群 為什麼不同人的腸道微生物有差異？
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深圳特區融潮商基因 立足大灣區擁抱創新
深圳特區融潮商基因 立足大灣區擁抱創新金羊網 作者：王漫琪、陳澤雲 2020-11-17 自深圳蛇口打響「改革開放第一炮」以來，400
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基因測序「黑科技」 給生命來完整「數位化解讀」
如果將一個人的基因組比喻成一座奇峰險峻的高山，可以理解為，有些測序只是拍攝了「一線天」「巨石陣」「黑龍潭」這些有代表性的景點；更完整地是，有些測序是把所有的景點拍下來，被稱為「功能基因集」；而完整的基因組測序才是把高山全部拍下來，包括像荒草一樣叢生的「沙漠基因」或者「無功能基因」等。
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腸道正常菌群與腸道免疫
同時，免疫系統對腸道菌群又有制約和調控作用，如對正常菌表現為免疫耐受，對病原菌表現為免疫排斥，一旦二者間的平衡被破壞，就會導致疾病。本文分4 部分，就腸道正常菌群與腸道免疫系統間的關係，結合國內外最新進展進行綜述。
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基因測序「黑科技」:給生命來個完整的「數位化解讀」
如果將一個人的基因組比喻成一座奇峰險峻的高山，可以理解為，有些測序只是拍攝了「一線天」「巨石陣」「黑龍潭」這些有代表性的景點；更完整地是，有些測序是把所有的景點拍下來，被稱為「功能基因集」；而完整的基因組測序才是把高山全部拍下來，包括像荒草一樣叢生的「沙漠基因」或者「無功能基因」等。 無疑，要實現生命數位化，需要的是把高山全部拍下來的完整的基因組測序。
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來自人類腸道微生物組的204,938個參考基因組集
腸道菌群可能包含許多具有重要代謝活性的物種，尚待在實驗室條件下進行培養和功能鑑定。各大洲之間有很高的菌株變異性，並且仍有相當程度的多樣性有待發現。雖然 HMP 和 宏基因組的技術發展，創建了 IGC 人腸道基因集，但是 IGC 缺乏高解析度的分類學分類，在基因組基礎上建立遺傳關聯和完整功能途徑的推測。雖然培養組學也在持續更新人體微生物的認知，但宏基因組的組裝和 binning 使得無需培養即可獲得大量難易培養的微生物多樣性，但這一策略面臨的挑戰是錯誤的 binning 會嚴重影響分類學和功能推斷。因此 MAG 需要更加細緻的條件。
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Nature綜述:腸道菌群如何劃分腸型
腸道微生物群落組成模式的穩定性通過研究上面提到的3個大數據集，我們發現在腸道菌群中，屬水平的群落組成可以將樣品很好的分組(附圖2)，這一結果與腸型研究的原始文獻的結果一致。也就是說，某些相對豐富的微生物出現頻率要高於其他物種。
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Science|腸道菌群調節的CART+腸道神經元可調節血糖
結腸和迴腸中，菌群依賴性轉錄本包括神經-免疫互作相關的神經肽，如Nmu；EAN生理功能基因，如Sst和Cartpt（編碼蛋白CART）；腸道外功能基因，如Agrp。同時，GF結腸和迴腸中SST+和CART+神經元數目減少，回補SPF腸道菌群可增加SST+和CART+神經元數量及神經纖維的密度；GF小鼠迴腸和十二指腸中iEAN的數目顯著減少，而結腸維持不變，回補SPF腸道菌群可恢復迴腸iEAN數量，而對結腸沒有影響。
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一對基因相同的同卵雙胞胎姐妹 一個得了抑鬱症 一個健康活潑...
浙大一院有兩個研究團隊，近年來陸續發表論文，證實某些抑鬱症確實和人們腸道裡的菌群是否失衡關係密切。 一對同卵雙胞胎帶來的思考 蔣海寅博士，就職於浙大一院傳染病診治國家重點實驗室，從2015年11月開始，堅持跟蹤隨訪一對同卵雙胞胎姐妹。 姐姐是雙相抑鬱症患者，而妹妹正常健康。
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菌群:腸道裡的健康密碼
本文轉自【人民政協報】；仲夏來了，天氣愈加炎熱，很多人選擇喝點兒冷飲來降暑，沒想到腸道菌群平衡被破壞，拉起了肚子。人和細菌是共生體。腸道菌群就是腸道裡的各種細菌，數量有10萬億個，約為人類體細胞的10倍。人體腸道菌大致可以分為三個大類：有益菌、有害菌和中性菌。
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健康的人類微生物組|微生物群|腸道菌群|人類|健康|細菌|植物|...
隨著資料庫的完善和技術的進步，目前16s尤其是在腸道菌群方面解析度也已經達到很高了，種方面能達到70%以上，40%左右能分到菌株。而且腸道菌群檢測遠不是檢出了每種菌的含量，還需要大規模人群隊列和疾病樣本的訓練以及模型構建，因此16s有其標準化和相對適合的成本，在腸道菌群中還是首選的方案。
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陽春砂仁等8種中藥材入選---深圳特區報
深圳特區報廣州5月31日電（記者 嚴俊偉）為了更好保護中草藥材這一我國特有物質，廣東省人大常委會於2016年4月28日至5月20日通過網絡投票、問卷投票等方式向全社會公開徵求從我省道地中藥材20個品種中遴選出8種作為第一批立法保護中藥材。5於31日下午，省人大常委會公布立法保護廣東嶺南中藥材第一批品種遴選結果。