土壤微生物和土壤中的各種酶在土壤中的能量轉化、物質轉化具有非常重要的意義。酶的作用是的土壤內的生化反應得以順利進行，酶在土壤中的活性也影響了土壤中進行的各種生化反應過程的強度，是土壤本質屬性之一。
酶的活性越強，代表酶所主導的生化反應越強，所產生的反應代謝物質越多，土壤的養分和植物生長所需的能源越多。酶的活性越強，土壤固定有機物質的能力也就越強，生物化學反應中的反應物也就越多，土壤中微生物種群的數量也就越多。細胞外酶的促進或者抑制功能，能控制土壤內的某些化學物質的含量。酶活性的強弱，決定著土壤中化學物質數量的多少，對植物的生長發育狀態，起著重要作用
另外，酶對土壤的酸鹼度、最大容納量、置換性陽離子的組成和佔比、土壤中含複合的鹽基飽和度、腐殖質的特性以及土壤中有機物質和無機物質複合體的組成起重要作用。
土壤中的酶是影響土壤肥力標誌之一，其活性對作物的產量、質量。土壤酶參與土壤的整個生活史，對自然界腐殖質的產生與降解起重要作用。
參考文獻：【1】楊尚霖.施加生物有機肥對土壤微生物多樣性的影響:[D].黑龍江:黑龍江大學，2018.來源 老燕說農
現在「生物酶」技術日益成熟，應用的領域逐漸的擴大，在農業上也有了長足的進展。其中無毒無害，用量少，並且功效顯著的特點最引人注目，目前已經在應用。生物酶類肥料施入土壤之後，改良土壤作用表現在促進土壤團粒結構的形成，增加土壤的代換容量，提高土壤緩衝性能，加強土壤微生物活性等方面。
利用生物酶可以有效的降低農藥殘留和快速的分解農藥殘留，提高農作物的品質。同時抗根病、提高農作物免疫力，使農作物更能適應旱澇等極端的天氣，對於抗病蟲害也有不錯的效果。同樣條件下種植的農作物，經過對比，平均成熟期提前7天以上，果蔬的糖度提高2-5度，果肉的纖維密度更加飽滿，口感更好，自然也更耐運輸，同時也延長了果蔬的儲存時間。