文獻搜索哪家強——谷歌?PubMed?

2021-01-11 唯問生物

摘要

背景:關於文獻檢索,一直心裡都有一種感覺,那就是谷歌學術和谷歌的檢索能力要遠強於其他的一些常用搜尋引擎,包括大家常用的PubMed等。但是一直僅限於在自己的總體感覺,似乎不太能睡服用PubMed的朋友們。

目的:通過幾個典型案例來驗證哪種學術搜尋引擎更強大。

方法:以隨機的一些學術類關鍵詞來搜索若干文獻,然後再以文獻中的一些關鍵詞或語句對該文獻進行反向檢索,查看是否能在相應的搜尋引擎找到該文獻。結果:OA類和非OA類的文獻中的詞彙或句子,在谷歌學術中可以很容易檢索到,而在PubMed中檢索不到。結論:查閱文獻時,如果想要全面查找,強烈建議用谷歌學術,強烈反對用PubMed!

引言

本來想寫點東西的,但是又想偷點懶。所以,就這樣吧!大家理解我大概想講什麼就行了......

方法

三個隨機關鍵詞:1. Synuclein;2. miRNA;3. Parkinson's Disease。

以兩種限制條件來選擇文獻:1. OA類文獻(註:OA,Open Access,讀者可以不需要付費即可查閱到文獻全文);2. 非OA類文獻。

結果與討論

1. 谷歌學術中OA類文獻

以Synuclein,miRNA,parkinson'sdisease這三個關鍵詞在谷歌學術中進行檢索,得到以下結果(

圖1

):

圖1

谷歌學術中Synuclein,miRNA,parkinson'sdisease的檢索結果

打開第一個文獻(Variation in the miRNA-433 Binding Site of FGF20 Confers Risk for Parkinson Disease by Overexpression of α-Synuclein)連結,剛好就是一個OA期刊。選擇文獻中一些帶有特徵性關鍵性(即一些特定的基因名稱和術語之類的)的語句,例如:miR-433 Inhibits FGF20 Translation at SNP rs12720208,返回到谷歌學術中進行檢索,第一條搜索結果就是該文獻(圖2)。

圖2 以文獻中特徵性語句在谷歌學術中的檢索結果

那我們再選擇一個不帶有那麼有明顯特徵的一般性描述語句試試,如:In addition, the larger complete deletion demonstrates more translation than the smaller deletion, as would be expected (data not shown). 雖然檢索對象沒有以紅色字體顯示在搜索結果中,但是依然在第一條顯示了這篇文獻(圖3)。

圖3

以一般性語句在谷歌學術中的檢索結果

2. PubMed中的OA類文獻PubMed中以同樣的關鍵詞搜索,結果如圖4所示:圖4在PubMed中Synuclein,miRNA,parkinson's disease的檢索結果我們可以看到,第一篇文獻發表在IJMS這個期刊上,是OA類的。點擊進去找到一個特徵性語句:LRRK2 is an unusually large protein (2527 amino acids) that in humans is encoded by the PARK8 gene。輸入進PubMed反過來找這篇文獻,結果顯示沒有結果(data not shown)。這個可能是這個PubMed搜索文獻時候的一個局限性。於是我把這句話中的關鍵詞——LRRK2,2527 amino acids和PARK8提了出來,再次輸入進去搜索,結果還是沒有。於是我又以LRRK2和PARK8進行搜索,顯示有5頁。我慢慢翻,在第一頁沒有找到這篇文獻,第二頁沒有找到,...最後,終於在最後一頁也沒找到(data not shown)!3. 谷歌學術中的非OA類文獻在第一頁的檢索結果裡面我們選擇最後一篇文獻:Profile of microRNAs in the plasma of Parkinson’s disease patients and healthy controls,期刊名是Journal of Neurology(圖5)圖5在谷歌中Synuclein,miRNA,parkinson's disease檢索結果中的一篇非OA文獻

再通過sci-hub.tw下載到這篇文獻,查找裡面的正文我們可以發現,谷歌學術顯示的紅字部分的語句有一些是這個文章的正文中的(data 懶得 shown)。這說明,雖然文獻不對讀者開放,無法直接下載,但是谷歌學術的檢索是可以深入到文獻正文中的,而不僅僅是摘要。4. PubMed中的非OA類文獻OA類文獻正文部分都開放了還搜不到,非OA類的還用說嗎?不相信的自己去試試吧!反正我懶得再查了。

結論

文獻檢索是一門技術活,不是你隨隨便便搜一下就可以搜到你想要的文獻的。習慣使用PubMed或者其衍生類的檢索網站的朋友,PubMed似乎只能搜到題目和摘要中的關鍵詞。建議不要在搜不到某個結果時,就輕易說沒有此類的研究報導。請嘗試一下檢索範圍賊廣的谷歌學術或這谷歌(BTW,谷歌有時候能找到谷歌學術找不到一些資料)。

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