1．用黑藻觀察細胞多樣性（P25）
黑藻還可以用作觀察細胞多樣性的材料。黑藻名不副實，其實它不是藻類，是被子植物，可用作觀察高等植物細胞的典型材料。製作臨時裝片，與根尖細胞、血細胞、骨骼肌細胞等比較。最好選取嫩葉，葉薄，有利於觀察。
2．用黑藻觀察葉綠體（P39）
黑藻也非常適合用來觀察葉綠體，在黑藻葉中，葉綠體非常豐富，但在嫩葉，葉綠體數目不多，這對於觀察葉綠體和細胞質流動是很有好處的。判斷細胞質流動是以葉綠體流動為標誌的，因此，也可以順便觀察細胞質流動（浙科版教材要求觀察細胞質流動，指導意見不作要求）。
製片非常簡便，只要用鑷子取一片黑藻嫩葉，放在載玻片上的水滴中，攤平，蓋上蓋玻片即可做後續實驗。要改變環境條件來影響細胞質流動，也不用分組處理。
3．用黑藻觀察植物細胞的質壁分離及質壁分離復原（P55）
雖然黑藻葉細胞沒有紫色液泡，但並不影響觀察質壁分離及質壁分離復原現象，因為其細胞質充滿葉綠體，除了液泡外，幾乎整個細胞就是綠色的，因此，也能夠與外界無色溶液形成對比，分散的葉綠體被擠壓在一起，非常容易觀察到質壁分離及質壁分離復原現象，同時可以觀察到液泡體積的變化，只是無法觀察液泡顏色變化。
同行的建議：考慮到蔗糖溶液蒸發後有粘性，我們改用10%左右的氯化鈉溶液，萬一有液體灑在顯微鏡上擦拭更容易。
4．用黑藻提取和分離葉綠體色素（P87）
黑藻有大量葉綠體，可以用作提取和分離葉綠體色素實驗的材料。先把植株上的水吸乾或者將植株放入恆溫箱中40－50℃烘乾（提取液中水太多會影響後續實驗層析的進行）再將其剪成小段，按照教材的實驗步驟研磨、提取和分離。
5．用黑藻觀察DNA和RNA在細胞中的分布（P16，指導意見不作要求）
甲基綠和派洛寧為鹼性染料，它分別能與細胞內的DNA、RNA結合呈現不同顏色。當甲基綠與派洛寧作為混合染料時，甲基綠與染色質中DNA選擇性結合顯示綠色；派洛寧與核仁、細胞質中的RNA選擇性結合顯示紅色，因為甲基綠易與聚合程度高的DNA結合，而派洛寧則與聚合程度較低的RNA結合。
6．探究環境因素對光合作用強度的影響（P94）
高中階段在探究環境因素對光合作用強度的影響時，常運用「小圓葉片上浮法」等方法，需要多種材料用具，比較複雜，而且實驗耗時較長，一節課往往難以完成。而將黑藻葉片製成臨時裝片，在顯微鏡下計數其單位時間放出的氣泡數，可以簡便快速地完成實驗，也能夠半定量的研究環境因素對光合作用強弱的影響。
調節顯微鏡的遮光器，可以控制光照強弱，觀察光照強度對光合作用強度的影響。通常學生用內置光源的顯微鏡在光圈開到最大時，黑藻葉片每分鐘約放出3～4個氣泡，隨著光圈減小，放出氣泡的速率不斷減慢。