隨著質譜技術的不斷發展，質譜已經逐漸成為代謝組學研究以及其他科學研究的一個主要工具。在代謝組學研究中，質譜作為前端數據的採集工具，其數據獲取的準確性將會直接影響後續流程的進行，足以見得質譜的重要性。那今天就來聊聊質譜使用過程中的那些事兒。
前一陣在社交媒體上看到這樣一句話，分享給大家「Without a goodscientist, your 500K mass spec will just be a bigexpensive brick」, 意思就是說，如果沒有一個很好的操作者，質譜就只是一個昂貴的擺設。雖然說的有些嚴重，但是仔細想想也不無道理。
雖然現在很多廠家都在試圖簡化儀器操作的步驟，使質譜儀可以實現傻瓜式操作，但是如果對質譜儀、對所要操作的儀器有充分了解的話，可以幫助我們更好使用這一工具來完成實驗，也會避免很多不必要的錯誤，正所謂磨刀不誤砍柴工。
我之前在不同的實驗室做過實驗，經常會看到以下情況：
測樣之前不對儀器進行調諧和校正。也就是不管儀器的狀態如何，到了預約時間就直接測樣。這會直接影響質譜採集數據的質量，例如由於未對質譜儀進行校正而造成的質量數偏差過大，會導致無法進行後續的化合物鑑定，或者影響化合物鑑定的準確性。再強調一次，質譜的調諧和校正，很重要！
不了解實驗目的。實驗的目的決定了如何選擇質譜類型（高分辨還是低分辨）、掃描模式（全掃、DDA、DIA、MRM等）、進樣的方式（LC-MS還是直接進樣）等等，了解實驗目的才可以使我們準確制定實驗方案，節省人力物力。
樣本運行過程中，不查看數據採集的情況。編輯完一個大序列後，點擊運行，聽到液相機械手臂在移動，完成進樣，人就離開了實驗室。雖然一個序列可能持續十幾個小時或者幾天的時間，但是運行中間還是要時常查看運行狀況，注意觀察流動相的液面（即使有液面設置參數）、觀察實時校正內標的剩餘量，遇到問題可以及時解決。
不清洗離子源。離子源是質譜的入口，質譜儀的一個重要組成部分，但是嘗嘗會被忽略。在使用儀器時，通常是一個序列接著一個序列做，像代謝組學這樣的實驗，大批量的檢測生物樣本，離子源很容易髒，離子源的汙染會直接影響檢測到信號，所以在實驗之前要觀察離子源的狀況，及時清洗。
不注意色譜柱的接口。色譜柱的管線在購買來時，各個小部件都是零散的，使用前需要將各部分組裝好後擰入目標色譜柱進行造模。由於各個廠家的色譜柱柱頭位置設計不同（下圖所示），所以在替換色譜柱時要多加留意。這種不鏽鋼的管線通常需要使用小扳手來擰，如果螺紋不匹配或者管線入口長度不匹配而連接色譜柱，很容易造成管線被卡死在色譜柱中，造成損失。
自己的實驗數據，自己還是要多多關注，不要讓這些小問題影響最後的實驗結果。當然，質譜使用過程中還有很多需要注意的問題，如流動相的選擇、流動相添加劑的選擇等等，這些問題相信都是儀器管理者著重強調的問題。
在一次報告中聽到這樣一句話，感覺挺有道理，分享給大家：
LC-MS中，80%以上的問題來自於LC；
MS中，80%的問題來自於離子源和離子光學；
所有問題中，有80%是應用問題或者汙染問題。
最後想說的是，質譜知識一個工具，它並不是問題的答案。只有對質譜數據進行分析，提取有用的信息，才能回答我們的科學問題。
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