德國MB的試劑盒採用0.4μm濾膜截獲微生物,然後微生物被加入到濾膜上的離子活性劑和促溶劑裂解。隨後進行DNA抽提。本文締一生物為您分析水中微生物DNA提取試劑盒,樣本製備步驟。
水中微生物DNA提取試劑盒,樣本製備步驟
步驟1. 樣本過濾
1.1 從試劑盒中小心取出濾膜。用水樣潤溼濾膜。
1.2 將濾膜放置在濾器中,並過濾必要體積的水樣。
步驟2. 菌體裂解
* 提前準備:預先將恆溫儀設置到70℃,將恆溫箱設置到37℃。
2.1將樣本過濾後的濾膜翻轉放置到試劑盒提供的IncubationDish(平皿)中。
2.2 吸取2mllysis buffer(裂解液),並加到濾膜上。
2.3 將濾膜浸泡在裂解液中,小心搖勻平皿並在37°C孵育30分鐘。
2.4 用平皿中的裂解液衝洗濾膜,並搖晃平皿10秒鐘。
2.5 將平皿中的400μl裂解液轉移至IncubationTube(孵育管),70°C孵育10分鐘。
2.5a可選項:剩餘裂解液可再取400μl用於DNA抽提,以獲得更多的DNA樣本。
2.6 樣本短暫離心,並加入400μl Binding Buffer(結合液),立即渦旋充分混勻,以防止DNA沉澱。請勿離心樣本,並立即進行下一步。
步驟3. DNA提取
* 提前準備:
(1)WashBuffer 1(洗液1)和WashBuffer 2(洗液2)第一次使用前,用無水乙醇復溶(請參見瓶上標籤)
(2)將恆溫儀設置到70℃,並將ElutionBuffer(洗脫液)放在上面預熱。
3.1 將步驟2.6中的混合液(~800μl)轉移到CollectionTube(收集管)內的SpinColumn(離心柱)中,小心液體不要沾到離心柱的邊緣。
3.2 離心柱離心≥10000× g,1分鐘。棄掉收集管中的液體。重新將離心柱插到原有的收集管中。
3.2a 可選擇:在步驟2.5a中,多取的一份樣本重複以上操作,不用換離心柱。
3.3 離心柱中加入500μl洗液1。離心≥10000×g,1分鐘。棄掉收集管中的液體。重新將離心柱插到原有的收集管中。
3.4 離心柱中加入500μl洗液2。離心≥10000×g,1分鐘。棄掉收集管中的液體。將離心柱插到一個新的收集管中。
3.5 最大速度離心3分鐘,以去除殘留的洗液2。
3.6 棄掉收集管。將離心柱插入到試劑盒提供的SampleStorage Tube(樣本保存管)中。
3.7 吸取60μl已70℃預熱的洗脫液,直接加到離心柱的矽膠膜上。矽膠膜表面應全部覆蓋洗脫液。
3.8 室溫靜置2分鐘,然後離心8000×g,2分鐘,以洗脫DNA。
3.9 樣本保存管中的洗脫液即包含DNA,可直接用於PCR,或儲存在2~8℃,可存放1周。長期儲存是在≤-18℃。