做RNA提取的老司機,看到這個標題,可能會一臉懵:這誰呀…,傻X,這個問題還用討論嗎?
①什麼是「總RNA」?「總RNA」的定義是什麼?
②總RNA提取試劑盒提出來的是「總RNA」嗎?為什麼是2條帶而不是3條帶?Trizol呢?
③為什麼不能用Trizol提取的RNA去做全轉錄組測序?
④全轉錄組測序該選「總RNA提取試劑盒」?還是該選microRNA提取試劑盒呢?普通轉錄組測序該怎麼選?
總RNA=mRNA+tRNA+rRNA,即:總RNA就是指mRNA、tRNA、rRNA的總和。這是在還沒有發現lncRNA等microRNA的時候的概念。但是卻被各大公司默認的概念,一直延續至今。所以各位可以去各大公司的網站,看一看總RNA提取試劑盒案例提供的RNA電泳圖,只有代表總RNA的2條帶——28s和18s;代表microRNA的5s帶,要不沒有,要不很弱。那麼mRNA在哪裡呢?從RNA電泳圖上能不能看到呢?
真正成熟的mRNA,主要集中在28s和18s之間和上下的螢光背景(一般每條基因mRNA量很少,所以,整體一般看不到明顯帶,只表現為28s和18s中間和上下的連續的塗抹帶)。例如下圖:28S:18S= 2:1,說明RNA沒有降解。連續的塗抹帶就是mRNA。不要認為膠圖不好看,這才是和下遊蛋白翻譯直接相關的,成熟的mRNA的表達量。相信有很多同學,看到這個論斷,下巴都快要驚掉了吧?!為什麼不能選Trziol?
請看下面這篇文章:用Trizol提取microRNA,因丟失很多microRNA,造成文章被質疑,撤回。Molecular Cell, Volume 43, Issue 6, 1005-1014, 16 September 2011 doi:10.1016/j.molcel.2011.07.031RETRACTED: Cell Adhesion-Dependent Control of MicroRNA Decay值金百特生物成立5周年之際,願意拿出5000元人民幣,用來獎勵願意為探索真理而較真兒的科研工作者。給付標準:第一位發表文章的第一作者。
金百特生物的microRNA提取試劑盒也可以一次性把microRNA和總RNA(mRNA、tRNA、rRNA)分別提出來,如下圖:
R015-50-通用型microRNA提取試劑盒,這款試劑盒的裂解液是Trizol,所以只要Trizol可以提取總RNA的樣本,都可以用這款,包括植物、動物、細胞、昆蟲等。如果Trizol無法提取總RNA的樣本,特別是多糖多酚的植物樣本,請選擇R410-50-植物microRNA提取試劑盒,功能同R015-50。全世界只有我們一家有這款試劑盒。
普通轉錄組測序主要是測mRNA。所以選總RNA提取試劑盒或者Trizol,均可。
口罩不用戴、研缽不滅菌、粗放操作,20分鐘,讓高質量RNA與你邂逅!想更好更快的提取總RNA,以及提RNA的注意事項,請參考:www.gene-better.cn官網首頁動態裡的文章「不帶口罩也能提RNA?!」
有同學問:金百特公司的基因組過濾器是不是能把gDNA過濾的一點不剩?
答案:金百特生物的gDNA過濾器能做到和DNase I膜上消化15分-30分鐘的效果完全一致。如果有疑問的話,可以做下平行比較,用這兩種方法分別提取同一樣本RNA,把RNA當模板,用gDNA的引物擴增,PCR,跑電泳,條帶是否出來?條帶的深淺?是判斷兩種方法優劣的直接表現。
爆款:
R015-50-通用型microRNA快速提取試劑盒(帶gDNA過濾器)——植物、動物組織、細胞、昆蟲
R410-50-植物microRNA快速提取試劑盒(帶gDNA過濾器,免氯仿,免β-巰基乙醇)——簡單植物、多糖多酚植物
R318-50-多糖多酚植物總RNA提取試劑盒(帶gDNA過濾器,免氯仿,免β-巰基乙醇)——根、莖、葉、花!多糖多酚樣本放心選!作物類樣品更沒問題!全能型選手!
R513-50-果實種子總RNA提取試劑盒(帶gDNA過濾器,免氯仿)——果實、種子、中草藥經費不足的課題組可選這兩款:
R013-50-通用型總RNA提取試劑盒(trizol+吸附柱)——動物組織、細胞、作物類葉片、血液、病毒
R011-100-RNAzol(Trizol)——支持全程操作在室溫下進行。儘量不裂解核膜的配方,使得RNA更純!
北京金百特生物技術有限公司
Beijing GeneBetter Biotech Co.,Ltd.
網址:www.gene-better.cn
地址:北京市昌平區中關村生命科學園北清創意園3-3棟106室編後語:
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