實驗室工作中，經常會需要用到純化的DNA，這時我們通常需要使用一個商業的DNA提取試劑盒對目的DNA進行分離純化。市面上有很多類型的提取試劑盒，當使用不太熟悉的樣本類型時，選擇合適的盒子是尤為關鍵的，本文將分享考慮建議以供選擇參考。
一、試劑盒組分
目前大多數DNA提取試劑盒遵循相同的基本步驟: 裂解，柱純化，洗滌雜質，柱洗脫。然而，不同的盒子在完成每個步驟的方式上有很大的不同。
二、使用的樣本類型
不同的DNA來源有不同的試劑盒，從實驗室培養的細胞，到臨床樣本，土壤樣本，甚至指紋，也有許多專門用於某些應用的試劑盒。例如，土壤中的腐殖酸或血液中的血紅蛋白會汙染純化的DNA，從而幹擾下遊的DNA實驗（如PCR）。當然，也有一些試劑盒會在進行純化步驟之前專門去除這些組分。如果想從PCR或瓊脂糖凝膠中純化DNA，有許多方法可以提高瓊脂糖凝膠純化的回收率。
三、基因組 VS 質粒DNA提取
一般來說，質粒DNA分離要比基因組DNA分離溫和。這是因為針對質粒DNA的裂解步驟需要染色體DNA與細胞蛋白片段保持結合，以防止其汙染最終的樣品。兩種類型的DNA回收都有試劑盒，甚至有可以同時純化基因組DNA和總RNA的試劑盒。
四、細胞系 VS 生物體
在選擇DNA提取試劑盒時，最重要的變量可能是你所使用的生物體。
1. 細菌：許多試劑盒都有用於細菌DNA分離的不同成分，這些試劑盒之間的主要區別在於細胞是如何被分解的，因為有些細菌比其他細菌更更有挑戰性。例如，形成生物膜的細菌可能比傳統的基於去垢劑的方法需要更強的裂解技術。
2. 動物組織：用於動物組織DNA分離的試劑盒通常具有更溫和的裂解技術，因為大多數動物細胞不像細菌細胞那樣有細胞壁。然而，動物組織DNA提取的挑戰往往在於選擇合適的組織勻漿方法。此外，許多動物DNA純化試劑盒不使用苯酚/氯仿萃取或乙醇作為沉澱步驟，以減少破壞DNA的風險。
3. 植物：當涉及到植物DNA分離時，必須考慮到其他一些因素，需要注意汙染物的去除。植物在純化過程中通常含有未分離的糖，因此，洗滌劑選擇性地與DNA結合併從溶液中析出，通常是先將洗滌劑溶解在高濃度的鹽溶液中，然後提取DNA。
4. 血液：由於技術上的許多最新進展，血液DNA分離試劑盒中有多種裂解技術和提取方法可供選擇。從血液中分離出的DNA將在很大程度上決定你使用的裂解和提取的類型。無論應用是什麼，一定要選擇一種能夠提供純淨、完整、雙鏈和濃縮DNA的試劑盒，以獲得最佳效果。
五、你需要多少DNA ?
大多數DNA分離試劑盒公司都提供含有類似成分的試劑盒，這種試劑盒可以根據處理樣品的體積進行縮放。如下是一個基於大腸桿菌的DNA分離試劑盒推薦樣本體積的綱要，範圍很廣。對於特殊的應用，當涉及到培養物或組織樣本的數量時，選擇可能較少。
小量製備: >15 mL
中量提取: 15-25 mL大規模製備: 100-200 mL
巨型製備: 500-2,500 mL
甚至高達2.5-5升!
六、時間成本：生產率的考慮
當一次處理超過50個樣本時，不再考慮使用小量柱純化，高通量DNA提取試劑盒是更好的選擇，它可以以96孔的形式運行，以便在需要同時處理多個樣本的DNA的實驗。
DNA提取試劑盒有各種規格和大小，然而，共同的主線是，所選擇的試劑盒能產生乾淨和濃縮的DNA。可以定期評估DNA提取物的數量和質量，以確保試劑盒適合此應用類型。
文章來源：每日生物評論
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