二氧化矽材料直至今日還是高科技產物，所以價格還很昂貴，但它們能夠為實驗室節省很多時間和精力，進而大大提高了成本利用率。由於還有5%~ 10%的DNA依然吸附在介質上，因此二氧化矽柱在用完一次後必須廢棄。
然而，我們可以將柱.上殘留的DNA洗去，使之再生後重新使用，這樣能夠降低成本(如Esser et al. 2005, 2006)。如果把勞動力成本考慮進去的話，這種節約是否能夠提高成本效率並不明確。
不是所有的商業試劑盒都用二氧化矽材質去結合DNA，因為DNA是一-個大的多價陰離子物，在低離子強度作用的緩衝液中能夠與任何陽離子結合，在高離子強度的緩衝液中被洗脫。強電荷基質能夠緊密結合DNA,但是DNA的復性非常慢，尤其是在離心柱上。
一些商業化試劑盒用陽離子柱效果也很好，可有效獲得高純度DNA (如Applied Biosystems公司的PrepMan試劑盒)。選擇哪一種試劑盒呢？目前有很多DNA製備試劑盒已經進入市場。就算實驗經驗匱乏的人也能夠使用這些試劑盒從任何你想到的來源中提取和純化DNA。
生產DNA純化試劑和試劑盒的公司有Applied Biosystems 公司、Brinkmann 公司、Clontech公司、Millipore 公司、Agilent 公司、Life Technologies 公司、Promega 公司及市場領導者QIAGEN公司。
目前並沒有對這些公司試劑盒提取DNA的成本、效率、速度及可重複性進行比較。但這個市場競爭十分激烈，劣質產品不會存在太久。我們建議根據自己的目的來比較這些公司產品(產量、速度、花費等)，然後選擇一個性價比高的產品。