谷歌Deepmind稱解決蛋白質摺疊難題 或加速藥物研發

2020-12-06 極客網FromGeek
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  • 2020-12-01發布
  • 來源:新浪科技

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據報導,Alphabet旗下人工智慧公司DeepMind開發了一款軟體,可以準確預測蛋白質在幾天時間裡會摺疊成什麼樣的結構,從而解決了過去50年的一項「重大挑戰」。這可能為更好地了解疾病和藥物研發鋪平道路。

每個活細胞體內都有成千上萬種不同的蛋白質,這些蛋白質也是細胞生存的基礎。預測蛋白質如何摺疊非常重要,因為這決定了蛋白質的性質。幾乎所有疾病,包括癌症和老年痴呆症,都與蛋白質的功能有關。

歐洲生物信息學研究所的珍妮特·桑頓(Dame Janet Thornton)教授表示:「蛋白質是最美麗的結構。準確預測蛋白質的摺疊非常具有挑戰性,多年來一直困擾著很多人。」

DeepMind的AlphaFold人工智慧系統參加了一項由「結構預測關鍵評估」組織(CASP)舉辦的比賽。該組織的目標是,圍繞如何計算蛋白質分子三維結構的問題,更快地尋找解決方案。

CASP在過去25年中一直在關注這個領域的進展,該組織的評價方式是將參賽者提供的解決方案與「黃金試驗標準」進行對比。本周一,該組織表示,DeepMind的AlphaFold系統在蛋白質結構預測方面表現出了無與倫比的準確性。

CASP主席約翰·墨爾特(John Moult)教授表示:「DeepMind已經取得領先。計算機科學領域長達50年的重大挑戰在很大程度上已得到解決。對於藥物設計,以及蛋白質設計等新興領域,這都將產生重大影響。」

DeepMind大約有1000名員工,但幾乎沒有任何收入。谷歌母公司Alphabet為支持該公司投入了巨額成本。不過,DeepMind已經與Facebook人工智慧實驗室、微軟和OpenAI等實體一起,成為了全球人工智慧競賽的領先者之一。

谷歌CEO桑達爾·皮查伊(Sundar Pichai)在Twitter上為此次突破點讚。DeepMind聯合創始人及CEO德米斯·哈薩比斯(Demis Hassabis)則表示:「DeepMind背後的終極願景一直是構建通用人工智慧,利用通用人工智慧來極大地加速科學發現的步伐,幫助我們更好地了解周圍世界。」

谷歌2014年以6億美元的價格收購了DeepMind。該公司以圍棋人工智慧AlphaGo而聞名。不過該公司一直表示,希望能在科學領域發揮更大的影響力。

哈薩比斯說:「遊戲是很好的試驗平臺,有助於高效地開發和測試通用算法。但我們希望,未來某天這些算法能應用到現實世界,例如去解決科學問題。我們認為,AlphaFold是證明這個邏輯的第一步。這些算法現在正變得足夠成熟和強大,能夠應用於真正具有挑戰性的科學問題。」

DeepMind早在2018年就參加了CASP蛋白質摺疊比賽,取得的結果相當不錯。但AlphaFold負責人約翰·姜普(John Jumper)當時認為,要想產出「真正具有生物學相關性,或在實驗上有競爭力」的成果,還有一段路要走。

今年的比賽對DeepMind來說也並非一帆風順。姜普表示,DeepMind在3個月時間裡毫無進展。「我們坐在那裡,擔心是否已經耗盡了數據。」即使比賽結束日期臨近,姜普及其團隊也還在擔心,他們可能出了錯。他說:「機器學習系統總是會出各種錯誤。」

不過,他們的努力已經獲得了回報。姜普表示:「我們真的認為,我們開發了一個系統,為實驗生物學家提供正確、可操作的信息。你想要尋找這樣的結構是因為,你想要去理解大自然,隨後去提出更多的問題。我們認為,我們開發的系統已經可以真正幫助人們去做到這一點。」

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