在(主題篇)S5E31:一文了解RNA甲基化的來龍去脈和(文章篇)S5E33:RNA甲基化,從一篇PNAS到基金課題設計兩篇文章中,我們分別介紹了RNA甲基化涉及到的研究背景、文章和基金,並以PNAS的一篇文章為例,說明了如何以這篇文章為例來設計RNA甲基化的課題,今天我們介紹一個網站,看如何用好這個網站的信息,來設計出RNA甲基化修飾有關的課題。
這個網站就是MeT-DB: a database of transcriptome methylation in mammalian cells.http://compgenomics.utsa.edu/methylation/
我們直接看P53的信息查詢:
那麼,結合RNA甲基化修飾的情況,這些信息怎麼用呢?
P53的mRNA甲基化修飾是否與其表達有關呢?
如果有關,哪些位點以及因素參與到 P53的異常表達呢?
比如:P53的mRNA的3'UTR區的甲基化是否影響microRNA的結合和對其表達的調控?
比如我們上次講過的文章:(文章篇)S5E33:RNA甲基化,從一篇PNAS到基金課題設計
或者:
A majority of m6A residues are in the last exons, allowing the potential for 3' UTRregulation.Genes Dev. 2015 Oct 1;29(19):2037-53.
如何申請基金的話這個題目怎麼樣?
P53 mRNA甲基化修飾在microRNA***促進腸癌轉移中的作用
寫文章的話:
microRNA*** sensitive P53 mRNA m6A modification in the progression of NSCLC
再比如:P53的mRNA的甲基化是否影響RNA結合蛋白與其結合,以及下遊的功能和分子機制?
比如:P53的mRNA的甲基化修飾影響了剪接因子XXXX與其結合,並調控了P53的剪接結果。
或者P53的mRNA的甲基化修飾影響了翻譯因子與其結合,影響其翻譯過程。
關於P53mRNA的RNA結合蛋白,可用資料庫RBPDB預測:
That’s all. Thank you!
請關注「小張聊科研」:搜索微信號「xzlky2015」,或長按二維碼識別關注。
↓↓↓