近日，中國疾控中心周刊（China CDC Weekly）在最新一期刊登的文章中稱，2020年12月14日，我國海關實驗室監測到一名坐飛機從境外返回的23歲女性新冠感染者，通過檢測發現，該病例感染了新變種的新冠毒株。根據近日多方披露的研究數據，從境外開始流行的這種新病毒株的傳播能力預計比普通病毒株至少要高出50％。儘管目前尚無證據表明這種新的病毒株更加致命或者會引起更嚴重的疾病，但其仍被認為是對中國預控新冠疫情構成巨大的潛在威脅。
據介紹，此次助力發現我國首例境外變種新冠毒株的測序平臺是華大智造自主研發的高通量測序儀——MGISEQ-200。
中國疾控中心周刊
據了解，中國疾控對所有病毒株都進行了系統監測，在檢測到第一株VOC毒株後就已上報，並在中國疾控官方雜誌China CDC Weekly（中國疾控周報）中向全球發布。據披露，疾控中心對該患者的核酸樣本以多重PCR方案建庫，並使用華大智造高通量測序平臺MGISEQ-200對病毒核酸文庫進行深度測序。
通過對MGISEQ-200的測序數據進行生信分析，研究人員發現，該毒株與11月份監測到的毒株不同，顯示32個核苷酸變異位點，通過進一步對比發現，該患者感染的毒株基因序列中包含了10月下旬開始在境外流行的VUI202012/01新病毒株中所有的28個變異點位，其中包括刺突蛋白中的3個胺基酸缺失和7個胺基酸突變。
基於MGISEQ-200的測序數據和流行病學調查結果，國家疾控將此境外輸入性病例定義為中國監測到的首例英國變種VUI202012/01病毒株，並加強了對患者密切接觸的調查和對相關場所的消殺。
（基於MGISEQ-200測序數據組裝的COVID-19全基因組序列系統進化樹。境外變異毒株種系VUI-202012/01變體以深綠色突出顯示，上海首次檢測到的VUI-202012/01變體以紅點表示）
新冠病毒的不斷變異是當前全球面對的一大挑戰，華大智造高通量測序儀以其高深度、高精度的特性，可以對病原全基因組序列進行深度測序，找到病毒突變位點，辨明病毒身份，從而找到病毒來源。
MGISEQ-200是一款小巧靈活且性能強勁的高通量測序儀，它可以完美適配病原檢測、組裝以及溯源等應用，滿足對疾病精準防控的需求。此外，該測序平臺現已推出全新配置，支持更多極端文庫測序，大幅提升測序速度。目前，MGISEQ-200已入駐全球多個國家海關實驗室、疾病預防控制中心，為病毒研究、監測病毒變異提供支持。（記者鑄紫 通訊員麥絲綺）