諾如病毒核酸檢測及病毒基因序列分析

2020-11-30 中國質量新聞網

    宋鋒林 薛 芳 蔡 鵬 高玉峰 吳 剛 樊德海 張洪兵

    (遼寧出入境檢驗檢疫局,大連 116001)

    摘要 〔目的〕通過對國境口岸輸入性感染性腹瀉暴發病例的快速檢測、排查和病原基因序列分析,為病人的診斷、治療和口岸突發疫情的處置提供依據,保障國境口岸的衛生安全。〔方法〕利用分子生物學技術,通過糞便樣本的核酸(RNA)提取、聚合酶鏈反應(RT-PCR)、凝膠電泳分析以及基因序列測定、基因序列分析等過程,對造成群體腹瀉的病原種類進行確認。〔結果〕9份送檢的腹瀉病人糞便樣本中均檢測到諾如病毒特異性核酸片段。經基因序列分析,確認檢測到的諾如病毒基因型屬基因組Ⅰ(GⅠ)。確認造成馬爾他籍船舶「藍海探索」號暴發腹瀉病例的病原為諾如病毒。〔結論〕通過核酸檢測等技術手段,可快速確認傳染病病原種類,為疫情控制、保障國境口岸的衛生安全提供技術支持。

    關鍵詞 諾如病毒;腹瀉;核酸檢測;基因序列

    〔中圖分類號〕 R512.5 〔文獻標識碼〕 B

    Detection on the Nucleic Acid and Analysis onGene Sequencing of Norovirus   Song  Fenglin, XueFang, Cai Peng, Gao Yufeng, Wu Gang, Fan Dehai,Zhang Hongbing.Liaoning Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau,Dalian 116001,China.

    [Abstract]  Objective    To detect, investigate and analyze ongene sequencing of virus on imported cases of infectious diarrheaoutbreak, to provide the direct basis for patient’s  diagnose,treatment and the disposition to pestilence emergencies at thefrontier ports, and to safeguard the health and safety at thefrontier ports.  Method   The nucleicacid(RNA)extraction of the stool samples, reverse transcriptionpolymerase chain reaction(RT-PCR), gel electrophoresis analysis,gene sequencing and the gene sequencing were conducted to confirmthe types of pathogens which caused the collective diarrhea. Result   The specific nucleic acid fragments of thenorovirus (GenomeⅠ, GⅠ)was detected in the nine stool samples, andwhich confirmed the pathogen that caused the outbreak of diarrheacases on the ship named 「AZAMARA QUEST」 from Malta was thenorovirus(GenomeⅠ, GⅠ).   Conclusion  Nucleic aciddetection techniques can quickly identify types of infection forepidemic control, health and safety protection at the frontierports.

    [Key words]   Norovirus; Diarrhea;Nucleic acid detection; Sequence analysis

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