近年來,隨著基因測序技術在臨床實踐上的廣泛應用,基因測序市場也迎來快速發展期。不久前,希望組在Github上線了三代測序數據高效糾錯、組裝軟體NextDenovo最新版本V2.0-beta.1,不僅實現了單Contig一條染色體和超大型基因組組裝的突破,同時也解決了現有三代測序數據組裝工具運行時間長、資源佔用大、組裝質量不穩定的瓶頸,推動了基因行業的發展。
目前華為雲基因容器已經率先集成了NextDenovo最新版,用戶可以直接上傳腳本進行數據分析,不僅簡化了使用流程,同時也免除了後續資源、應用維護的煩惱。
據悉,華為雲基因容器服務GCS是華為雲在Kubernetes封裝了一層關於基因測序的抽象,讓基因行業可迅速使用以及或部署容器技術,幫助基因行業的用戶提升運營效率。
針對基因行業普遍存在的工具碎片化、系統維護困難、開發語言多樣等瓶頸,華為雲的基因容器解決方案有「快、省、易、捷」的特點,具體來講:
「快」是指極速測序:GCS支持10萬容器規模,可提供高效任務調度能力,減少等待時間,避免任務死鎖等,進一步提升測序分析效率;
「省」來自於華為雲的高性價比:算力資源按秒、按需計費,可為企業節省運營成本;
「易」在於免運維:基於Severless架構的容器服務,可實現自動化處罰和執行;
「捷」則體現在華為雲帶來的一站式服務:將業務體現在一套流程內,避免多套系統操作帶來的不便。
基於輕量級的容器技術,GCS結合了深度學習算法、大數據,為測序廠商提供了便捷一站式用戶體驗、秒級可伸縮的高可靠資源和靈活可定製的測序流程,讓基因測序數據的計算更快、更省、更輕鬆。
據了解,除希望組外,國內基因行業Top 15的企業中,採用華為雲的服務佔了14家。其中,上海其明信息技術有限公司合作在華為雲容器CCI支持下,協作作出1萬多次基於基因信息的臨床決策,完成了25萬例基因數據分析和挖掘。數據顯示,上海其明將業務部署在華為雲CCI上後,不僅實現了K8S和物理資源免運維,同時成本降低了30%-50%。
華為雲與基因行業的跨界,將幫助基因企業解決技術層面的問題,接下來,華為雲還將持續加大研發投入,全力聚焦業務創新,致力為基因行業提供更多切實可行的方法,以科技賦能企業發展。