日本的起源在哪裡？日本人的祖先又是誰呢？對這個問題，不管是史學界還是民間都多有探討，漸漸的有很多證據浮出水面，而且證據都告訴我們影響日本或者說建立日的，很有可能就是徐福。根據《日本書紀》記載，最早日本神武天皇來到日本大陸時，曾率領一支男女各半的船隊，而秦史中也記載過當初徐福求仙問道時也曾率領過一支3000童男童女的船隊東渡，最後這支船隊卻杳無音信。
是在日本的傳世史書《神武本紀》中記載。神武皇帝是於公元前203年出現的。這個神武皇帝就是日本的第一個天皇。而在史書中記載徐福率領船隊出海時，正是公元前210年。210年到203年只用了七年。 而如果以當時秦朝的航行能力沿海岸線航行的話。到達日本的時間也差不多是這個時候。另外，日本的政治制度建設與當時秦朝的政治制度高度相似，稱皇帝為尊，臣子曰命，朝中高官稱為大夫，領兵打仗之人稱為將軍，這稱呼自古就沿襲下來，至今都無法改變。
古代日本文明，曾有兩個派系的痕跡，其中一個派系被稱為繩文式文化，這個文化應該是日本土生土長的原始文化，考古學家在這個文化的遺址處發現了一些原始的石器，以及用火燒過的骨頭，可以證明這支文化在當時已經初步具有了文明的形態。而另一支文化則是彌生式文化，彌生式文化化遺址中，有陶器和銅鐵器，還有一些種子的遺蹟，甚至有大型的墓穴，而繩文式文化和彌生式文化之間，卻沒有任何的過渡時期遺蹟，一個幾乎就是原始文明，而另一個卻是青銅文明，這兩者是如何過渡的呢？還是說青銅文明的出現，滅絕了另一個文明，佔領了這個文明的原始土壤。
這些證據都表明了，日本文明與中國的文明有莫大的關係，而且這其中的淵源十分深厚，不管日本人願不願意承認。