VASP5.4.1及+VTST編譯安裝

VASP採用平面波贗勢（或綴加投影波）方法進行從頭計算分子動力學模擬的軟體包。官網：https://www.vasp.at

VTST是VASP的過渡態工具，下載地址：

http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/index.html

VASP及VTST安裝均無需root權限，普通用戶在自己的目錄下也可以安裝使用。

VASP.5.4.1編譯安裝：

1.解壓縮VASP源碼包：tar xvf vasp.5.4.1.tar.bz2，

解壓縮後的目錄為vasp.5.4.1。

2.進入vasp.5.4.1目錄：cd vasp.5.4.1

3.查看vasp.5.4.1目錄下有何內容：ls -l

請入圖片描述

查看說明：more README

註：

vasp.X.X.X：解壓縮後的根目錄

arch：針對不同架構的Makefile模板，如裡面含有

makefile.include.linux_intelbin：編譯後的可執行程序文件

build：編譯時自動複製

src目錄內源碼後執行編譯的目錄

src：源碼目錄

lib：庫目錄，對應以前的vasp.lib目錄

CUDA：GPU CUDA代碼目錄

4.查看所用的編譯器：

which ifort

如顯示不存在，那麼可以類似下面設置下Intel編譯器環境（具體路徑與你所使用的系統有關）：. /opt/intel/composer_xe_2015.1.133/bin/compilervars.sh intel64

5.查看Intel MKL環境：echo $MKLROOT

如顯示不存在，那麼可以類似下面設置下Intel MKL環境（最好與編譯器版本一致）： . /opt/intel/composer_xe_2015.1.133/mkl/bin/mklvars.sh intel64 6.查看Intel MPI環境（最好與編譯器版本一致）：which mpiifort 如顯示不存在，那麼可以類似下面設置下Intel MPI環境： . /opt/intel/impi/5.0.2.044/bin64/mpivars.sh intel64 查看是否存在/opt/intel/composer_xe_2015.1.133/mkl/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel.a，如沒存在，那麼可以在自己目錄下編譯生成libfftw3xf_intel.a：mkdir -p ~/local/interfaces cp -a /opt/intel/composer_xe_2015.1.133/mkl/interfaces/fftw3xf ~/local/interfaces cd ~/local/interfaces/fftw3xf make libintel64 順利的話，將在此目錄下生成libfftw3xf_intel.a。 7.採用arch/makefile.include.linux_intel做為模板（在vasp.5.4.1目錄下，未考慮CUDA）： cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include 8.修改makefile.include： 必要時修改OBJECTS那，將 $(MKLROOT)/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel.a 修改為（假如使用~/local/interfaces/fftw3xf）：

其它參數，請見VASP官方說明。 9.為防止以前編譯好的.o和.a文件與新修改的編譯配置衝突，建議清除以前編譯文件： make veryclean 10.執行編譯，可以默認編譯或分開編譯： 默認編譯（將編譯生成std、gam和ncl版）：make 分開編譯： 編譯標準std版：make std 編譯gamma-only版：make gam 編譯non-collinear版：make ncl 編譯完成後將在bin目錄下生成對應的版本的可執行程序：vasp_gam、vasp_ncl、vasp_std。 如果有錯，請注意看錯誤信息，然後根據信息進行處理。VASP.5.4.1+VTST編譯安裝： 步驟基本和 VASP編譯安裝步驟一致。在上述第3步和第4步之間加入如下操作： 設置VTST： wget http://theory.cm.utexas.edu/code/vtstcode.tgz tar xvf vtstcode.tgz 下載：解壓縮：之後會生成vtstcode-171目錄，此目錄內包含以下文件：

bbm.Fbdr_changesbfgs.Fcg.Fchain.Fdimer.Fdynamic.Fdynmat.Ffire.Finstanton.Flanczos.Flbfgs.Fmkbdrpro.plneb.Fopt.Fqm.Fsd.Fvasp-5.3.2-main.patchvasp-5.3.2-mpmd.patchvasp-5.4.1-mpmd.patch

根據官方安裝說明http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/installation.html：

需要將這些文件複製到src目錄中： 因為src目錄下存在chain.F，建議先備份chain.F（可選）：cp src/chain.F src/chain.F-org 將vtstcode-171目錄下文件複製到src下：cp vtstcode-171/* src/ 修改src/main.F源碼： 將（第3233行）

CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, & LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6) 變為（注意後兩行）：CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, & TSIF,LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6)! LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6) 修改編譯配置src/.objects，在chain.o前（大概第67行）添加如下內容：bfgs.o dynmat.o instanton.o lbfgs.o sd.o cg.o dimer.o bbm.o fire.o lanczos.o neb.o qm.o opt.o

注意後不能有空格

如果有錯，請注意看錯誤信息，然後根據信息進行處理。