一、Th9細胞主要效應因子是IL-9
（1）寄生蟲感染。IL-9 在對抗寄生蟲感染中起重要作用。有研究指出，IL-9 可增強機體抵抗鼠鞭蟲感染的能力。IL-9 在針對寄生蟲的免疫應答初期就表達產生，其水平增高使腸內肥大細胞增殖，IgE、IgG水平升高，刺激腸道肌肉的收縮，並促進鞭蟲從腸內排除。目前對於 IL-9具體的作用機制尚不十分清楚，仍需進一步探討。
（2）過敏性疾病。對於過敏性疾病, 尤其是過敏性哮喘, 由Th9細胞分泌的大量的IL-9作用於不同的炎症細胞, 如淋巴細胞、嗜酸性粒細胞、肥大細胞、中性粒細胞, 使得炎症細胞的數量上升並分泌一些炎症介質, 促進炎症的發生。IL-9除了作用於炎症細胞外, 還可以作用於組織細胞, 如平滑肌細胞和氣道上皮細胞, 從而分泌促炎因子並出現大量的杯狀細胞, 分泌大量的黏液, 在氣道高反應性的發生發展中起了一定的作用。過敏性哮喘初步的研究評估了哮喘病人支氣管肺泡灌洗標本中細胞因子的水平，證明IL-9表達水平在變應原激發後有所升高。
二、Th9細胞同時也分泌IL-10
IL-10 被認為是阻止 T 細胞增殖分化，抑制組織炎症的細胞因子，它在細胞免疫反應中有重要作用。IL-10被認為可以促進IL-9的產生, 但是封閉IL-10R並未對IL-9的表達產生負面的影響。IL-10是一種有效的抗炎因子, 並能夠抑制Th1、 Th2、 Th17介導的免疫應答。
三、Th9細胞與炎症的關係
對Th9細胞的功能進行研究，發現IL-9+IL-10+T細胞不但沒有抑制炎症發生的作用, 反而能夠促進組織炎症的發展，至於是IL-9或IL-10, 還是兩者均參與誘導組織炎症尚不清楚。但是在促炎作用中, IL-9絕對是關鍵。同時在其他效應T細胞表面發現了IL-9R, IL-9可作用於效應性T細胞, 作為其他效應T細胞的生長和分化因子, 從而導致更嚴重的組織炎症。而對於以前認為的產生IL-10的T細胞是抑制功能的T細胞的說法應該重新加以認識,是促炎還是抑制T細胞應答取決於T細胞產生IL-10時的具體環境和背景。