努爾哈赤有兄弟五人，但舒爾哈齊和他卻是一母同胞的親兄弟。在母親離世後，兄弟兩人便離開家，寄居在外祖父王杲門下。
不過好日子沒多久，明朝遼東總兵李成梁率軍破王杲的古勒寨時，兄弟兩人被俘虜了。不過沒有被殺，反而活了下來，在李成梁手下當差，還練就了好身手。
正所謂兄弟同心，其利斷金。在統一女真各部的時候，舒爾哈齊成為了他最得力的助手，英勇善戰，功勞頗大，在建州的影響也很深。
不過也正因為這樣，舒爾哈齊漸漸希望能夠與努爾哈赤平起平坐。
隨後舒爾哈齊去北京進貢，這一下讓他大開眼界，同時明廷也看出他的野心，不斷地挑撥兄弟倆的關係。
回去後，舒爾哈齊開始培植自己的勢力，還通過聯姻加強與其他部落的關係，藉以擴大自己的影響力。
久而久之，兩人出現了嫌隙，努爾哈赤開始打算除去這個潛在的對手。
萬曆三十五年，一支女真部落不滿被臨近的烏拉部欺負，準備依附努爾哈赤。於是努爾哈赤便派了舒爾哈齊以及自己兒子等人領兵去收編。
但是舒爾哈齊和烏拉部是姻親關係，所以他在這件事上非常不配合，一路也是走走停停，在褚英、代善等人與烏拉部作戰的時候，作壁上觀，結果引發了努爾哈赤的不滿。
但又不能把手伸向自己的弟弟，所以就打算將他的下屬處死，其目的也是殺雞儆猴。
結果舒爾哈齊反應強烈，誓不低頭。不過努爾哈赤無奈之下剝奪了舒爾哈齊的指揮軍隊的權利，也把他排擠除了最高領導層。
舒爾哈齊變成了一個有名無實的人物，沒辦法他只能另立門戶與努爾哈赤對抗，還準備投靠明朝，結果努爾哈赤首採取了強硬措施，誅殺了他的兩個兒子和部將。
在萬念俱灰的絕望處境下，舒爾哈齊只能低頭，不過努爾哈赤沒有再給他機會，直接把他囚禁起來了，沒多久舒爾哈齊就在囚禁中死了。