藥 師 寶 懺
嚴淨壇場
欲修懺悔者，當於靜處，隨力所能，莊嚴一室。安置藥師佛寶象及安經法，懸繒幡蓋，求集香花，諸供妙具，以修供養。
淨法界真言：嗡 覽姆 娑哇訶 （21遍）
楊枝淨水 遍灑三千 性空八德利人天 福慧廣增延滅罪除愆 火焰化紅蓮
南無清涼地菩薩摩訶薩（三稱）
迎請三寶諸天
弟子 一心至誠恭請：
東方淨琉璃世界，藥師琉璃光如來、東方藥師七佛如來，惟願應我恭請，普降法筵,居茲蓮座。
弟子 一心至誠恭請：
毗盧遮那佛、本師釋迦牟尼佛、阿彌陀佛、過去毗婆尸佛等七佛如來、當來彌勒尊佛、盡十方遍法界過去一切諸佛、盡十方遍法界現在一切諸佛、盡十方遍法界未來一切諸佛, 惟願應我恭請，雲集而來，普降法筵,居茲蓮座。
弟子 一心至誠恭請：
藥師琉璃光如來本願功德經，東方淨土一切甚深法寶,顯現道場,放淨光明,照觸我身。
弟子 一心至誠恭請：
日光遍照菩薩、月光遍照菩薩、文殊菩薩、普賢菩薩、觀世音菩薩、大勢至菩薩、藥王菩薩、藥上菩薩、無盡意菩薩、寶曇華菩薩、消災障菩薩、增福壽菩薩、樂音樹下三萬六千菩薩等諸大菩薩，藥師海會佛菩薩，惟願應我恭請，雲集而來，普降法筵，居茲蓮座。
佛子 一心至誠恭請：
宮毗羅等十二藥叉大將、梵釋四王，天龍八部，僧伽藍內，護正法者，一切聖眾，隨我請來，降臨道場，參隨蓮座，卻除魔障，示現吉祥。
供 養 禮 敬
我依普賢菩薩大行願力，集此娑婆世界、乃至十方法界，種種上妙七寶、種種上妙飲食、種種鮮美水果、種種鮮花、種種香雲、種種油燈、燭光燈明、種種幢幡、寶蓋傘蓋、種種寶鈴寶瓔珞、種種莊嚴供養之具，全部集集於此，充滿虛空，至誠供養藥師琉璃光佛和諸佛菩薩、諸大阿羅漢、十二藥叉大將和各大尊天護法菩薩。
1、誦廣大摩尼寶咒 （七遍）
嗡 啊摩噶補戛 嘛呢叭德嘛 乏及咧打他噶打 維羅割得三曼打缽喇灑喇吽
（此咒才誦三遍，即於無邊佛土，成就廣大供養。由此獲得無量福聚，世世常生一切如來大集會中。蓮花化身，得五神通，分身百億，拔濟有情，現世受無量果報，當來得生淨土。）
2、誦虛空庫明妃真言 （五遍）
南無薩哇怛他誐多難 薩哇他欠 烏那誐諦薩頗囉細曼誐誐拿劍娑哇訶
(觀想：誦第一遍,遍塵沙寶器滿盛塗香普塗聖眾。誦第二遍,種種花曼普遍壯嚴。誦第三遍,燒種種香普遍供養。誦第四遍，雨諸天中上妙飲食置於寶器普遍供養。誦第五遍，雨諸摩尼以為燈明普遍供養。一切供養中運心為上。)
一心頂禮十方法界常住佛
一心頂禮十方法界常住法
一心頂禮十方法界常住僧
是諸眾等，各各胡跪，嚴持香花，如法供養：
願此香花遍十方，以為微妙光明臺，諸天音樂天寶香，諸天餚膳天寶衣，不可思議妙法塵，一一塵出一切塵，一一塵出一切法，旋轉無礙互莊嚴，遍至十方三寶前，十方法界三寶前，皆有我身修供養，一一皆悉遍法界，彼彼無雜無障礙，盡未來際作佛事，普燻法界諸眾生，蒙燻皆發菩提心。同入無生證佛智。
願此香花雲，遍滿十方界，供養一切佛，尊法諸菩薩，緣覺聲聞眾，及一切天仙，以起光明臺，過於無邊界，無邊佛土中，受用作佛事，普燻諸眾生，皆發菩提心。
容顏甚奇妙，光明照十方，我適曾供養，今復還親覲，
聖主天中王，迦陵頻伽聲，哀愍眾生者，我等今敬禮。
南無寶曇華菩薩摩訶薩（三稱）
香贊 ：爐香乍爇 法界蒙燻 藥師海會悉遙聞
隨處結祥雲 誠意方殷 諸佛現全身
南無香雲蓋菩薩摩訶薩 (三稱)
一切恭敬：
祈請藥師如來證明禮懺，做我懺悔主：
弟子____一心至誠祈請慈悲導師，藥師琉璃光如來做我懺悔主。惟願藥師琉璃光如來慈悲於我，攝受於我，為我做懺悔主。我依藥師琉璃光如來大慈大悲之威神力故，得以懺悔除滅無始以來至今的一切罪業，消除宿怨，釋解怨結。我今向藥師琉璃光如來和諸佛如來至誠禮懺，猶如面奉，如子見母，涕泣求哀，歸命祈請，必翼藥師佛攝受護持，得以懺悔除滅一切罪業。一切宿怨，如冰遇火，即刻消融，菩提願海，福慧善業，日漸增長，早日得生西方極樂世界。我既如是。佛必哀憐。祈叩洪慈。冥燻加被。
妄念成生滅真如不變遷總持難思議無住對空宣
仰白十方三寶。藥師如來。剎海天龍。一切聖眾。
願賜慈悲。俯垂證鑑。有疏披宣。伏希慈攝。
贊： 佛面猶如淨滿月 亦如千日放光明
圓光普照於十方 喜舍慈悲皆具足
歸命滿月界 淨妙琉璃尊 法藥救人天 因中十二願 慈悲弘誓廣 願度諸眾生七佛藥師王我今皈命禮 淨琉璃世界 藥師琉璃光 日月常遍照 十二大願王我今申讚揚 志心頭面禮。
藥師如來琉璃光，焰網壯嚴無等倫，
無邊行願利有情，各遂所求皆不退。
誦 ：《藥師琉璃光如來本願功德經》（一卷）
祈請普賢王菩薩 象駕光臨：
有一菩薩，結跏趺坐，名曰普賢。身白玉色，五十種光，光五十種色，以為項光。身諸毛孔，流出金光。其金光端，無量化佛。諸化菩薩 以為眷屬，安詳徐步，雨大寶華。至行者前，其象開口。於象牙上，諸池玉女，鼓樂弦歌。其聲微妙，讚嘆大乘一實之道。行者見已，歡喜敬禮。復更讀誦，甚深經典，遍禮十方，無量諸佛，禮多寶佛塔及釋迦牟尼，並禮普賢，諸大菩薩。發是誓願，若我宿福，應見普賢，願尊者遍吉，示我色身。
啟運藥師道場懺法 今當歸命三世諸佛：（以下各一禮）
南無過去毗婆尸佛
南無尸棄佛
南無毗舍浮佛
南無拘留孫佛
南無拘那含牟尼佛
南無迦葉佛
南無本師釋迦牟尼佛
南無藥師琉璃光如來
南無當來彌勒尊佛
南無藥師海會佛菩薩
開經偈：
無上甚深微妙法 百千萬劫難遭遇 我今見聞得受持 願解如來懺法義
消災延壽藥師佛懺法卷上
主懺舉白：
釋迦慈父。愍念眾生。為說藥師道場懺法。良以眾生垢重。無明暗覆。不諳因果。不勤懺悔。縱貪嗔痴。肆殺盜淫。無量無邊。所作罪垢。無量無邊。所結冤業。不覺不知。日深日厚。以致促長壽而夭枉。黜官位而下賤。削富饒而貪窮。摺子女而孤獨。罹斯九橫。墜墮三塗。紛紛苦果。自作自受。種種惡報。或現或後。纖毫無差。遲速必報。爾時藥師琉璃光如來。慈悲拯濟說是本願功德經。令讀誦者。造彼如來形像七軀。一一像前。各置七燈。一一燈量。大如車輪。燃至四十九日。光明不絕。是惟剎利、居士大家。多饒財寶。倉庫盈溢。之所堪為。而綿力眾生心雖喜樂。不能如法莊嚴。以是因緣。即於本願功德經中。譯出消災延壽懺法。便諸眾生。齋戒沐浴。或於寺院。或在家庭。或延禪侶。或偕善士。灑掃燻修。香花燈燭。隨分供養。依科贊詠。虔誠敬禮。則無求不應。無願不成。經雲。說悔先罪。淨名所尚。改往修來。洗浣身心。斷除眾惡。誓不更造。多劫罪愆。淨盡無餘。隨所樂求。悉令滿足。（某等）志心頂禮。求哀懺悔。
禮 敬 三 寶 ：
南無毗盧遮那佛
南無本師釋迦牟尼佛
南無藥師琉璃光如來
南無藥師七佛如來
南無無量壽佛
南無盡十方遍法界過去一切諸佛
南無盡十方遍法界現在一切諸佛
南無盡十方遍法界未來一切諸佛
南無藥師琉璃光如來本願功德經
南無日光遍照菩薩
南無月光遍照菩薩
南無文殊師利菩薩
南無普賢菩薩
南無觀世音菩薩
南無大勢至菩薩
南無無盡意菩薩
南無寶曇華菩薩
南無藥王菩薩
南無藥上菩薩
南無彌勒菩薩
南無消災障菩薩
南無增福壽菩薩
南無樂音樹下三萬六千菩薩
南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧
南無救脫菩薩
敬禮十二藥叉大將
禮諸佛已，次復懺悔：緣念像法轉時，若諸有情，為欲利益安樂，拔除一切業障，建立殊勝功德者。為欲滿修，諸佛大願，具足受持，諸佛名號，及正法寶藏者。欲得阿耨多羅三藐三菩提，三十二相八十隨形，莊嚴其身者。欲得無量智慧方便，令諸眾生，安立大乘者。為欲修行梵行，得不缺戒，具三聚戒，究竟清淨，無有毀犯者。欲得諸根完具，無諸疾苦，家屬資具，悉皆豐足者。欲得破魔絹網，解脫一切外道纏縛，拔種種惡見稠林者。若有女人，欲轉女成男，具丈夫相者。為欲求男求女，而得男女。求長壽而得長壽者。或當王法所加，欲解脫一切憂苦者。欲得上妙飲食，飽足法味，及種種上妙衣服，一切寶莊嚴具者。欲行惠施，一切所有，悉無貪惜，施來求者。欲得正見精進，善調意樂，多聞聰明，解甚深義，恆求勝法，常遇善友者。欲受持學處，願生西方極樂世界，無量壽佛所，聽聞正法者。若有已毀之戒，而欲還清淨。已盡之命，而欲復救續。乃至國界人眾，種種諸橫，種種諸難，而欲消伏隱沒，順時歡樂者。應當如法莊嚴，歸命藥師琉璃光如來，一心精進，修三摩地。所以者何？彼如來行菩薩道時，所發十二微妙上願，殊勝功德，令諸聞者，業障消除。一切所求，皆得滿願。故是唯一生所系菩薩。為能如實信解，如說修行。應當以身命財，不生吝惜，竭力莊嚴，必獲果遂。是故今日，與現前（眾等），各各志心，皈命頂禮。
禮 敬 三 寶 ：
南無毗盧遮那佛
南無本師釋迦牟尼佛
南無藥師琉璃光如來
南無藥師七佛如來
南無無量壽佛
南無盡十方遍法界過去一切諸佛
南無盡十方遍法界現在一切諸佛
南無盡十方遍法界未來一切諸佛
南無藥師琉璃光如來本願功德經
南無日光遍照菩薩
南無月光遍照菩薩
南無文殊師利菩薩
南無普賢菩薩
南無觀世音菩薩
南無大勢至菩薩
南無無盡意菩薩
南無寶曇華菩薩
南無藥王菩薩
南無藥上菩薩
南無彌勒菩薩
南無消災障菩薩
南無增福壽菩薩
南無樂音樹下三萬六千菩薩
南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧
南無救脫菩薩
敬禮十二藥叉大將
禮諸佛已，志心皈命：惟願諸佛菩薩。同運慈悲。降臨道場。一切天龍八部。藥叉諸將。悉生哀愍。來到道場。是諸聖眾。願悉證明。我於今日。欲為十方一切六道眾生。修行無上菩提。斷除一切業障。同入如來。本大願海。普現色身。於一念中。供養一切十方三寶。於一念中。普度一切六道眾生。令入平等大慧。故於今日。一心精進。如說修行。惟願諸佛菩薩。 藥師如來本願力故。受我懺悔。令我所行。決定破除罪障行願圓成。如經所說。願悉證明南無藥師琉璃光如來。應正等覺。明行圓滿。光明廣大。功德巍巍。身善安住。焰網莊嚴。過於日月。幽冥眾生。悉蒙開曉。隨所樂求。一切皆遂。所有病苦。悉皆消滅。無量菩薩。行無量善巧方便。無量廣大願。我若一劫。若一劫餘。而廣說者。劫可速盡。彼佛行願。善巧方便。無有盡也。是故志心。皈命頂禮。
藥師灌頂真言：（21遍）
南無薄伽伐帝 鞞殺社 窶嚕薜琉璃 缽囉婆喝喇闍也怛他揭多耶 阿囉訶帝 三藐三勃陀耶 怛侄他 唵 鞞殺逝 鞞殺逝 鞞殺社 三沒揭帝莎訶
藥王菩薩真言：（7遍）
阿目佉。摩訶目佉。痤隸。摩訶痤隸。挓翅。摩訶挓翅。常求利。摩訶常求利。烏摩致。摩訶烏摩致。挓翅挓翅。摩訶挓翅。兜帝兜帝。摩訶兜帝。阿榆阿榆。摩訶阿榆。樓遮迦。摩訶樓遮迦。陀賒寐陀賒寐。摩訶陀賒寐。多兜多兜。摩訶多兜。迦留尼迦。陀賒羅莎阿。阿竹丘阿竹丘。摩登祗。波登雌。遮梯。遮樓羅梯。佛馱遮犁。迦留尼迦。莎訶。
藥上菩薩真言（7遍）
難那牟。浮致浮。留浮丘留浮丘。迦留尼迦。螺牟螺牟迦留尼迦。毗梯毗梯。迦留尼迦。阿毗梯他。阿便他阿便他。迦留尼迦。珊遮羅。莎訶。
贊： 藥師如來 世界琉璃 慈悲喜舍悉隨宜 懺法度群迷 稽首皈依 所願滿求祈 藥師佛藥師佛 消災延壽藥師佛
稽首東方滿月界 微妙正覺藥師尊
三祗果滿不思議 十號名稱無等倫
十二大願因地發 百千相好果中圓
慈悲海闊難測量 功德山高贊莫盡
南無東方淨琉璃世界藥師琉璃光如來
稱誦：南無消災延壽藥師佛 (隨意迥向或百聲千聲)
消災延壽藥師懺法卷中
三千界內慈悲主 百億洲中大法王
開蓮慧目鑑凡情 眾生有求皆感應
啟運藥師道場懺法。今當歸命三世諸佛
禮 敬 三 寶 ：
南無毗盧遮那佛
南無本師釋迦牟尼佛
南無藥師琉璃光如來.
南無藥師七佛如來
南無無量壽佛
南無盡十方遍法界過去一切諸佛
南無盡十方遍法界現在一切諸佛
南無盡十方遍法界未來一切諸佛
南無藥師琉璃光如來本願功德經
南無日光遍照菩薩
南無月光遍照菩薩
南無文殊師利菩薩
南無普賢菩薩
南無觀世音菩薩
南無大勢至菩薩
南無無盡意菩薩
南無寶曇華菩薩
南無藥王菩薩
南無藥上菩薩
南無彌勒菩薩
南無消災障菩薩
南無增福壽菩薩
南無樂音樹下三萬六千菩薩
南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧
南無救脫菩薩
敬禮十二藥叉大將
禮諸佛已，次復懺悔：（弟子某）等。普為四恩三有。及法界一切眾生。悉願斷除三障。皈命懺悔。我與眾生。無始來今。由愛見故。內計我人。外因惡友。不隨喜他。一毫之善。惟遍三業。廣作眾罪。事雖不廣。噁心遍布。晝夜相續。無有間斷。覆諱過失。不欲人知。不畏惡道。無慚無愧。撥無因果。如斯罪障。未經懺悔。我於今日。對藥師如來。十方諸佛菩薩。深信因果。生重慚愧。生大怖畏。發露懺悔。斷相續心。發菩提心。斷惡修善。勤策三業。翻昔重過。隨喜凡聖。一毫之善。念藥師佛。有大願力。能救拔我。出二死海。置三德岸。惟願慈悲。哀憐攝授。各各志心。皈命頂禮。
禮 敬 三 寶 ：
南無毗盧遮那佛
南無本師釋迦牟尼佛
南無藥師琉璃光如來
南無藥師七佛如來
南無無量壽佛
南無盡十方遍法界過去一切諸佛
南無盡十方遍法界現在一切諸佛
南無盡十方遍法界未來一切諸佛
南無藥師琉璃光如來本願功德經
南無日光遍照菩薩
南無月光遍照菩薩
南無文殊師利菩薩
南無普賢菩薩
南無觀世音菩薩
南無大勢至菩薩
南無無盡意菩薩
南無寶曇華菩薩
南無藥王菩薩
南無藥上菩薩
南無彌勒菩薩
南無消災障菩薩
南無增福壽菩薩
南無樂音樹下三萬六千菩薩
南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧
南無救脫菩薩
敬禮十二藥叉大將
禮諸佛已，次復懺悔：（弟子某）等。自從無始以來。至於今日。所有貪嗔嫉妒之病。驕慢自傲之病。不識善惡之罪。不信罪福之病。不孝五逆之病。破辱三寶之病。不修齋戒之病。破犯尸羅之病。自贊毀他之病。貪得無厭之病。迷聲逐色之病。貪香愛觸之病。信邪倒見之病。耽淫嗜酒放逸無度之病。設復遇醫授與非藥之病。及餘無量災難陵辱悲愁煎逼身心受若之病。欲令是等。罪苦消除。所求願滿。爾時藥師琉璃光如來入三摩地。名曰除滅一切眾生苦惱。既入定己。於肉髻中。出大光明。光中演說。大陀羅尼曰 —— 藥師灌頂真言：
南無薄伽伐帝 鞞殺社 窶嚕薜琉璃 缽囉婆喝喇闍也 怛他揭多耶 阿囉訶帝 三藐三勃陀耶 怛侄他 唵 鞞殺逝 鞞殺逝鞞殺社 三沒揭帝莎訶
爾時光中，說此咒已。大地震動。放大光明。一切眾生。病若皆除。受安隱樂。是知懺悔之功。諸病心療之靈劑。了生脫死之奇方。有 大醫王。應病設藥。所謂慈悲喜舍是藥。忍辱柔和是藥。正信三寶是藥。勤修福慧是藥。六波羅蜜是藥。飽餐甘露是藥。貪求法味是藥。修真養氣是藥。返本還元是藥。有過能改是藥。善巧方便是藥。不動聲色是藥。清心斷欲是藥。常用如是等藥。搗篩和合。時取服之。眾生若病。應同一病。眾生須藥。應同一藥。若說多法。是名顛倒。若據一乘實相而言。則何增何減。何垢何淨。何善何惡。何罪何福。何病何藥。觀昔方便如夢中人。夢身患病。求醫服藥。而得除愈。及其夢醒。則悟本來無病。無病亦無。而況醫藥。故眾生之病。同一幻病。如來之藥。同一幻藥。故知如來說法。一相一味。所謂解脫相、離相滅相。究竟涅槃。終歸於空。如一雲所雨。而藥樹大小。各得滋茂。我等今者。蒙佛恩力。得聞：
世尊藥師琉璃光如來名號。不復更有病苦之難。乃能究竟無上菩提。是故今日。我等相率。皆同一心。乃至盡形歸佛法僧。今當皈命一切諸佛。
禮 敬 三 寶 ：
南無毗盧遮那佛
南無本師釋迦牟尼佛
南無藥師琉璃光如來
南無藥師七佛如來
南無無量壽佛
南無盡十方遍法界過去一切諸佛
南無盡十方遍法界現在一切諸佛
南無盡十方遍法界未來一切諸佛
南無藥師琉璃光如來本願功德經
南無日光遍照菩薩
南無月光遍照菩薩
南無文殊師利菩薩
南無普賢菩薩
南無觀世音菩薩
南無大勢至菩薩
南無無盡意菩薩
南無寶曇華菩薩
南無藥王菩薩
南無藥上菩薩
南無彌勒菩薩
南無消災障菩薩
南無增福壽菩薩
南無樂音樹下三萬六千菩薩
南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧
南無救脫菩薩
敬禮十二藥叉大將
禮諸佛已，次復懺悔：若有眾生。欲脫病苦。當為其人。七日七夜受持八關齊戒。應以飲食。及餘資具。隨力所辦。供養比丘僧。晝夜六時。禮拜行道。供養彼世尊。藥師琉璃光如來。讀誦尊經。四十九遍。燃四十九燈。乃至四十九日。光明不絕。可得過度。危厄之難。不為諸橫惡鬼所持。是故今日與現前眾等。各各翹勤。燒香、散花、燃燈、造幡放生修福。令度苦厄。不遭眾難。惟願如來證明懺悔。（某）等。又復無始以來。至於今日。凡有所為。皆不稱意。當知悉是。過去已來。惡業遺報所致。是故今當勤求懺悔。懺悔人間。惡夢惡相。諸不吉祥之報。懺悔人間惡病連年。累月不瘥。枕臥床蓆。不能起居之報。懺悔人間冬瘟夏疫。毒癘傷寒之報。懺悔人間水火盜賊。刀兵危險之報。懺悔人間為被獅子虎狼。毒蛇惡蠍蜈蚣蚰蜒害人之報。懺悔人間生老病死。憂愁苦惱之報。懺悔眾生。身語意業。造作增長。種種惡業之報。懺悔眾生。當墮三惡趣中。無量千歲。受諸劇苦之報。懺悔眾生。應以地獄傍生鬼趣。流轉無窮之報。懺悔眾生。不復更生諸餘惡趣之報。懺悔眾生。為人奴婢。受他驅役之報。懺悔眾生。或作牛馬駝驢。恆被鞭撻之報。又常負重。隨路而行。饑渴逼惱之報。懺悔人間。厭魅蠱毒。飛屍邪鬼。偽作妖異之報。如是現在未來人天之中。無量禍橫。災疫死難。衰惱之報。眾等今日至誠。向藥師佛。海會聖眾。求哀懺悔。願皆消滅。前已究竟。是病是藥。同歸一幻。惡業所致。一切報障。今當次笫。發願回向。（某）等。願以此懺悔三障。所生功德。悉皆迥向。施與一切眾生。俱同懺悔。願與一切眾生。從今以去。乃至菩提。念生死苦。發菩提心。改惡修善。返邪歸正。身心安樂。妙算無窮。衣食豐饒。家屬資具。倉庫盈溢。形相端正。聰明智慧。勇健威猛。諸將擁護。佛聖匡扶。凡所施為。悉希慈蔭。弟子某等。又願從今以去。速證菩提。相好光明。莊嚴殊勝。願諸眾生。蒙光開曉。隨意所趣。作諸事業。願諸眾生。皆得無盡。所受用物。無所乏少。願諸眾生。建立大乘。悉令安住菩提道中。願諸眾生得不缺戒。設有毀犯。還得清淨。願諸眾生。端正黠慧。諸根完具。無諸疾苦。願諸眾生。眾病悉除。家屬資具。悉皆豐足。願諸眾生。轉女成男。具丈夫相。乃至菩提。願諸眾生。出魔羅網。解脫一切外道纏縛。願諸眾生。王法所加。悲愁煎逼。皆得解脫。願諸眾生飲食飽足。後以法味。畢竟安樂。願諸眾生。如其所好。種種衣服。隨心滿足。願諸眾生。長壽富饒。官位男女。凡有所求。一切皆遂。令諸世界。百怪九橫。八難三災。他國侵擾。盜賊反亂。一切惡難。盡皆消滅。國界安隱。風雨順時谷稼成熟。一切有情。無病歡樂。菩提行願念念增明。救苦眾生。常如己想。又願生生世世。在在處處不墮邊鄙。生正信家。相貌端嚴。智慧辯才。遠離惡法。親近善友。堅持律行。安立大乘。又願生生世世。在在處處。興顯佛法。破諸魔網。奮志滿修。六波羅蜜。廣修供養。福慧莊嚴。忍辱精進。證菩提道。我等今日。應當念報 ：
藥師琉璃光如來恩德。常應如是利益安樂。一切有情。是故志心。歸命頂禮。
藥師灌頂真言：（21遍）
南無薄伽伐帝 鞞殺社 窶嚕薜琉璃 缽囉婆喝喇闍也怛他揭多耶 阿囉訶帝 三藐三勃陀耶 怛侄他 唵 鞞殺逝 鞞殺逝 鞞殺社 三沒揭帝莎訶
藥王菩薩真言：（7遍）
阿目佉。摩訶目佉。痤隸。摩訶痤隸。挓翅。摩訶挓翅。常求利。摩訶常求利。烏摩致。摩訶烏摩致。挓翅挓翅。摩訶挓翅。兜帝兜帝。摩訶兜帝。阿榆阿榆。摩訶阿榆。樓遮迦。摩訶樓遮迦。陀賒寐陀賒寐。摩訶陀賒寐。多兜多兜。摩訶多兜。迦留尼迦。陀賒羅莎阿。阿竹丘阿竹丘。摩登祗。波登雌。遮梯。遮樓羅梯。佛馱遮犁。迦留尼迦。莎訶。
藥上菩薩真言（7遍）
難那牟。浮致浮。留浮丘留浮丘。迦留尼迦。螺牟螺牟迦留尼迦。毗梯毗梯。迦留尼迦。阿毗梯他。阿便他阿便他。迦留尼迦。珊遮羅。莎訶。
贊： 東方端坐 無上醫王 十二大願妙難量 滅罪殄災殃 降福垂祥 增益壽綿長 藥師佛藥師佛 消災延壽藥師佛
稱誦：南無消災延壽藥師佛 (隨意迥向或百聲千聲)
消災延壽藥師懺法卷下
佛身充滿於法界 普現一切眾生前
隨緣赴感靡不周 而恆處此菩提座
啟運藥師道場懺法。今當歸命三世諸佛
禮 敬 三 寶 ：
南無毗盧遮那佛
南無本師釋迦牟尼佛
南無藥師琉璃光如來
南無藥師七佛如來
南無無量壽佛
南無盡十方遍法界過去一切諸佛
南無盡十方遍法界現在一切諸佛
南無盡十方遍法界未來一切諸佛
南無藥師琉璃光如來本願功德經
南無日光遍照菩薩
南無月光遍照菩薩
南無文殊師利菩薩
南無普賢菩薩
南無觀世音菩薩
南無大勢至菩薩
南無無盡意菩薩
南無寶曇華菩薩
南無藥王菩薩
南無藥上菩薩
南無彌勒菩薩
南無消災障菩薩
南無增福壽菩薩
南無樂音樹下三萬六千菩薩
南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧
南無救脫菩薩
敬禮十二藥叉大將
禮諸佛已，次復懺悔：弟子某等。上來既懺悔已。應生無垢濁心。無怒害心。於一切有情。起利益安樂。慈悲喜舍等之心於是斂念正觀。不斷結使。不住使海。觀一切法空如實相。云何名觀一切法空。行者諦觀。現在一心。妄心隨所緣起。如此之心為因心故。心為不因心故。心為亦因心。亦不因心故心為非因心。非不因心故。心為在三世。為在內外中間。有何足跡。在何方所。如是等。種種因緣中。求心畢竟不可得。如夢如幻。無名無相。爾時行者。尚不見心是生死。豈見心是涅槃。既不得所觀。亦不得能觀。不取不舍。不依不著。亦不住寂然。言語道斷。不可宣說。觀心無心。則罪福無主。罪福性空。則一切法皆空。心無所心。法不住法。作是懺悔。名大懺悔。名破壞心。識懺悔。以是因緣。心心寂滅。念念無住。如太虛空。虛空亦不可得。究竟不可得亦不可得。自然超諸三昧。光明照耀。萬法顯現。通達無礙。廣大如法性。究竟如虛空。惟願得如所願。滿菩提願。眾等各各運心。歸命頂禮。
禮 敬 三 寶 ：
南無毗盧遮那佛
南無本師釋迦牟尼佛
南無藥師琉璃光如來
南無藥師七佛如來
南無無量壽佛
南無盡十方遍法界過去一切諸佛
南無盡十方遍法界現在一切諸佛
南無盡十方遍法界未來一切諸佛
南無藥師琉璃光如來本願功德經
南無日光遍照菩薩
南無月光遍照菩薩
南無文殊師利菩薩
南無普賢菩薩
南無觀世音菩薩
南無大勢至菩薩
南無無盡意菩薩
南無寶曇華菩薩
南無藥王菩薩
南無藥上菩薩
南無彌勒菩薩
南無消災障菩薩
南無增福壽菩薩
南無樂音樹下三萬六千菩薩
南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧
南無救脫菩薩
敬禮十二藥叉大將
禮諸佛已，複次觀心實相：於一一時。行一一法。若行若坐。若出入大小便利。灑掃洗浣。運為舉動。俯仰視聽。應當一心存念三寶。觀心性空。不得於剎那頃。憶念五欲世事。生邪念心。及與外人言語議論。放逸戲笑。視色聽聲。著諸塵境。起不善業。無記煩惱雜念。不能如法修行。若果心心相續。不離實相。不惜身命。為一切眾生。行懺悔法。是名真實。一心精進。以法莊嚴。是故眾等。重複至誠。五體投地。歸命頂禮。
禮 敬 三 寶 ：
南無毗盧遮那佛
南無本師釋迦牟尼佛
南無藥師琉璃光如來
南無藥師七佛如來
南無無量壽佛
南無盡十方遍法界過去一切諸佛
南無盡十方遍法界現在一切諸佛
南無盡十方遍法界未來一切諸佛
南無藥師琉璃光如來本願功德經
南無日光遍照菩薩
南無月光遍照菩薩
南無文殊師利菩薩
南無普賢菩薩
南無觀世音菩薩
南無大勢至菩薩
南無無盡意菩薩
南無寶曇華菩薩
南無藥王菩薩
南無藥上菩薩
南無彌勒菩薩
南無消災障菩薩
南無增福壽菩薩
南無樂音樹下三萬六千菩薩
南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧
南無救脫菩薩
敬禮十二藥叉大將
禮諸佛已，至心懺悔：弟子某等。與法界一切眾生。從無始來。三障所纏。覆蔽心故。於諸境緣。妄生貪著。愚痴無智。缺於信根。以身口意。造種種業。乃至嫌謗正法。破犯尸羅。展轉常為不饒益事。或住淨地。聖果未圓。流注細微。三味難就。今遇：
藥師琉璃光如來。速除罪障。令成妙覺。故我至心歸向。稽顙投誠。發露眾罪。乞求懺悔。惟願：
大慈願海。平等攝授。使我與法界一切眾生。宿障自除。眾難解脫。破無明殼。竭煩惱河。正見開悟。妙心明澈安住菩提。常光現前。無病安樂。如所樂求。一切莊嚴。隨心具足。諸根聰利。多聞解了。精持梵行。入三摩地。以無量無邊。智慧方便。令諸有情。得受用物無所乏少。善修種種諸菩薩行。速證無上正等菩提。至於臨欲命終分明安豫。決往西方。無量壽佛。極樂世界。八大菩薩。示其道路。於寶華中。自然化生。承佛授記。獲證無量。陀羅尼門。一切功德。皆悉成就。然後分身無數。遍十方剎。於一念中。供養法界。一切諸佛。於一念中。現種種神力。度脫法界。一切眾生。成等正覺。虛空有盡。我願無窮。懺悔發願已。歸命禮常住三寶。
藥師灌頂真言：（7遍）
南無薄伽伐帝 鞞殺社 窶嚕薜琉璃 缽囉婆喝喇闍也怛他揭多耶 阿囉訶帝 三藐三勃陀耶 怛侄他 唵 鞞殺逝 鞞殺逝 鞞殺社 三沒揭帝莎訶
藥王菩薩真言：（7遍）
阿目佉。摩訶目佉。痤隸。摩訶痤隸。挓翅。摩訶挓翅。常求利。摩訶常求利。烏摩致。摩訶烏摩致。挓翅挓翅。摩訶挓翅。兜帝兜帝。摩訶兜帝。阿榆阿榆。摩訶阿榆。樓遮迦。摩訶樓遮迦。陀賒寐陀賒寐。摩訶陀賒寐。多兜多兜。摩訶多兜。迦留尼迦。陀賒羅莎阿。阿竹丘阿竹丘。摩登祗。波登雌。遮梯。遮樓羅梯。佛馱遮犁。迦留尼迦。莎訶。
藥上菩薩真言（7遍）
難那牟。浮致浮。留浮丘留浮丘。迦留尼迦。螺牟螺牟迦留尼迦。毗梯毗梯。迦留尼迦。阿毗梯他。阿便他阿便他。迦留尼迦。珊遮羅。莎訶。 贊 偈 ： 藥師海會 熾盛光王 八大菩薩降吉祥 七佛助宣揚
日月回光 福壽永安康 藥師佛藥師佛 消災延壽藥師佛
稱誦：南無消災延壽藥師佛 (隨意迥向或百聲千聲)
念佛畢對佛跪諷怡山發願文回向：
歸命十方調御師 演揚清淨微妙法
三乘四果解脫僧 願賜慈悲哀攝受
弟子——。自違真性。枉入迷流。隨生死以飄沉。逐色聲而貪染。十纏十使。積成有漏之因。六根六塵。妄作無邊之罪。迷淪苦海。深溺邪途。著我耽人。舉枉措直。累生業障。一切愆尤。仰三寶以慈悲。瀝一心而懺悔。所願能仁拯拔。善友提攜。出煩惱之深淵。到菩提之彼岸此世福基命位。各願昌隆。來生智種靈苗。同希增秀。生逢中國。長遇明師。正信出家。童真入道。六根通利。三業純和。不染世緣。常修梵行。執持禁戒。塵業不侵。嚴護威儀蜎飛無損。不逢八難。不缺四緣。般若智以現前。菩提心而不退。修習正法。了悟大乘。開六度之行門。越三祗之劫海。建法幢於處處。破疑網於重重。降伏眾魔。紹隆三寶。承事十方諸佛無有疲勞。修學一切法門。悉皆通達。廣作福慧。普利塵沙。得六種之神通。圓一生之佛果。然後不舍法界。遍入塵勞。等觀音之慈心。行普賢之願海。他方此界。逐類隨形。應現色身。演揚妙法。泥犁苦趣。餓鬼道中。或放大光明。或現諸神變。其有見我相。乃至聞我名。皆發菩提心。永出輪迴苦。火鑊冰河之地。變作香林。飲銅食鐵之徒。化生淨土。披毛戴角。負債含怨。盡罷辛酸。鹹沾利樂。疾疫世而現為藥草。救療沉痾。饑饉時而化作稻粱濟諸貪餒。但有利益。無不興崇。次期界世冤親。現存眷屬。出四生之汩沒。舍萬劫之愛纏。等與含生。齊成佛道。虛空有盡。我願無窮。情與無情同圓種智。
結 壇 ：
禮懺功德殊勝行 無邊勝福皆回向
普願沈溺諸眾生 速往無量光佛剎
自皈依佛 當願眾生 體解大道 發無上心
自皈依法 當願眾生 深入經藏 智慧如海
自皈依僧 當願眾生 統理大眾 一切無礙和南聖眾