因為流程管理（BPM）的興起，如今掀起了一股應用流程管理軟體的熱潮。當然企業實施流程管理（BPM）是離不開軟體的輔助的。但是，很多企業面對各式各樣的流程軟體的時候卻無法做出正確選擇。企業不知道應該如何選擇合適的流程管理軟體。有些企業管理者一味只想找最好的流程軟體，而忽略了不同的企業的經營情況、管理模式、發展方向等方面都有所不同，要知道軟體沒有最好的，只有最適合的。因此，企業選擇流程管理軟體時應先從以下幾個方面去考慮：
第一，企業要確定這個流程軟體是用來做什麼的，是做流程分析、流程層現、IT規劃還是協同優化?這是正確選擇軟體的重中之重，甚至會影響執行流程管理項目的結果。對於沒有建立流程管理體系的企業，最重要的是流程的層現以及過後的協同和優化，企業若是超越了這個階段的水平，則可以考慮選擇能夠進行流程分析的軟體。IT規劃是作為規劃的參考和依據前面的功能的，重點在於你的流程架構水平和能夠把流程呈現到什麼程度。
第二，需要考慮是管理人員、業務員、流程管理專業人員、技術員還是企業全體使用流程軟體。因為流程軟體是給人用的，所以要關注使用群體的需求和特徵。不同的人關注點也有所不同。管理人員會關注流程整體視角；業務員關注軟體的易用和操控性；而流程管理專業人員則關注流程生命周期管理功能；技術人員則是關注系統的集成和擴展；如若是企業全體人員，那麼軟體的功能就比較平衡，可同時關注多用戶的應用感受。
第三，需要考慮這款流程管理軟體是否符合企業現實和發展要求。企業一般都會對流程管理定一個幾年發展規劃，並且在此之前考慮軟體的應用，軟體的功能能否滿足發展需求。但是，要考慮軟體強大功能和易用性就存在難以平衡的矛盾，切勿以為選擇了一種工具後，以後就不用再費力選擇新的軟體了，這是十分錯誤的想法。
最後，還要從其他因素去考慮，例如經濟性原則、管理者的偏好、領導的意圖，還有與IT系統的整合等因素。當通過以上幾方面去考慮選擇流程管理軟體後，其餘的就是要具體情況具體分析了。