2020年2月23日 08:33:26
本文來自 動脈網。
說起一滴血檢測癌症，很多人可能都會因為Theranos的驚天騙局而對此嗤之以鼻。雖然Theranos的90億估值泡沫破滅，但是一滴血測量疾病這項技術本身的價值不能被磨滅。
在矽谷，還有一家持續看好滴血測癌症的公司：Adaptive Biotechnologies(ADPT.US)。不同於Theranos高調張揚的作風，Adaptive Biotechnologies更加務實低調。根據史丹福大學的一篇統計調查顯示，在醫療領域的諸多獨角獸發表的論文中，23andMe和 Adaptive Biotechnologies發表論文最多，前者發表了 107 篇論文，後者則是 89 篇。兩家公司發表論文的數量之和，撐起了所有醫療領域獨角獸發文數量的半壁江山。
雖然發表了較多論文，但Adaptive不是一家科研機構，Adaptive Biotechnologies是一家美國西雅圖的測序分析平臺研發商，該公司希望創建通用血液測試和開發新的癌症治療方法，以改善患者病情。
總體來看，Adaptive擁有三大產品線，分別是生命科學研究、臨床診斷、藥物發現，這三大管線中，clonoSEQ已經實現商業化。這三大產品線還獲得包括微軟(MSFT.US)、羅氏旗下基因泰克、艾伯維等巨頭的認可，達成了長期合作。在今年6月，Adaptive已經在納斯達克IPO。
Adaptive的CEO Chad Robin表示：「我們有兩種商業產品，以及強大的臨床渠道，可以診斷，監測和治療癌症，自身免疫性疾病和傳染病等疾病。我們的目標是開發和商業化針對每個患者的免疫驅動臨床產品。」
成為一家開發療法的體外診斷公司
Adaptive 成立於2009年，它的目標是開發和商業化針對每個患者的免疫驅動臨床產品。Adaptive擁有專有的T細胞抗原受體(TCR)發現和免疫分析平臺TruTCR。
Apdptive的官網上寫著這樣一段話：「我們認為，適應性免疫系統是自然界中對大多數疾病進行最精細調整的診斷和治療方法，但無法對其進行解碼使醫學界無法充分利用其功能。我們專有的免疫醫學平臺以前所未有的規模，精度和速度揭示並翻譯了適應性免疫系統的大量遺傳學信息，從而開發出了生命科學研究，臨床診斷和藥物發現領域的產品。」
適應性免疫應答( adaptive immune response)是指體內抗原特異性T/B淋巴細胞接受抗原刺激後，自身活化、增殖、分化為效應細胞，產生一系列生物學效應的全過程。
關於Adaptive，它的核心定義是體外診斷公司，但它的業務已經遠遠打破了傳統體外診斷企業的局限。
在診斷方面，Adaptive希望通過基因測序的方式實現早期的癌症發現，同時，adaptive還希望利用診斷測序平臺開發更多免疫腫瘤治療方法。如今，adaptive每年與超過125個生物製藥合作夥伴合作。
本質上，Adaptive Biotechnologies是將把人體免疫系統本身變成診斷的數據源。因為每次免疫系統對疾病做出反應時，T細胞受體(TCR)蛋白就會被表達出來以識別抗原。
根據微軟和Adaptive postulate的方法，通過簡單的血檢來繪製TCRs圖譜，對一系列疾病的早期診斷大有幫助。
我們的免疫系統知道的所有信息都被編碼成免疫細胞的基因，如T細胞和B細胞，它們漂浮在我們的血液中。
簡單來說，T細胞是人體裡的特種兵，可以實現對病毒的精準打擊。B細胞就像人體裡的飛彈庫，在病毒入侵身體不久，B細胞和T細胞跟他進行信息的交換後，B細胞就會趕緊分解自己，在短時間內複製出大量的B細胞，裝了一肚子飛彈的B細胞，那下一步就是發射了，在一秒鐘內一個B細胞大約可以發射2000發飛彈，發射的這些飛彈，被我們稱為抗體。
Adaptive Biotechnologies公司使用稱為下一代測序的技術來讀取這些細胞的基因，並創建了一個由數十億數據點組成的免疫譜。
Adaptive Biotechnologies已經找到對T細胞和B細胞進行測序的方法。對這些受體進行基因組測序是困難的，因為它們的基因會隨著時間重新排列。但Adaptive已經找到了一種方法，利用其強大的ImmunoSEQ平臺，利用計算生物學來對受體進行測序。
Adaptive如何實現廣泛用途
那麼問題來了，Adaptive的TruTCR和ImmunoSEQ主要用於哪些方面?有哪些成功應用的案例呢?
首先是疾病的早期診斷和個體化的治療。
Adaptive已與Microsoft Healthcare NExT計劃合作，以繪製和解碼人類免疫系統。雙方將一起通過免疫測序、專有計算模型和機器學習將TCR序列映射到它們結合的抗原。
利用這些數據構建一張地圖，將數百萬個T細胞與數百萬個專門針對其攻擊的病原體聯繫起來，從而使疾病的診斷更加有效和準確。最終實現為所有疾病(從癌症到自身免疫性疾病再到傳染性疾病)提供更好的診斷的目的。
和微軟合作主要是獲取微軟的雲計算及機器學習相關業務。從機學習算法的角度來看，Adaptive Biotechnologies與微軟合作的機器學習算法，不同於IBM Waston的自然語言處理和機器學習，也並非是圖像識別相關算法。微軟正在和合作夥伴開發一種應用於醫療保健的獨特方法。
除了用於精準診斷，Adaptive的產品還可以用於細胞療法開發。
2019年1月，Adaptive與羅氏旗下的Genentech達成合作。Adaptive將使用其研究性TCR發現平臺來確定患者體內最佳的T細胞抗原受體，以便能夠最有效針對每位患者的個性化抗原進行治療。而Genentech則將根據Adaptive提供的信息設計和製造個性化的細胞藥物，以便為每位患者提供更好的治療服務。
憑藉在TCR平臺的實力，Adaptive Biotechnologies也是TCR-T療法領域的明星公司。其擁有的TruTCR T細胞受體(TCR)篩查平臺可通過免疫測序和其他技術來鑑定和表徵有效結合靶抗原的TCR。
TCR-T療法是一種過繼免疫細胞治療(Adoptive Cell Transfer Therapy，ACT)。過繼免疫細胞治療是指從腫瘤患者體內分離免疫活性細胞，在體外進行擴增和功能鑑定，然後向患者回輸，從而達到直接殺傷腫瘤或激發機體的免疫應答殺傷腫瘤細胞的目的。
TCR-T療法的基本步驟是：首先鑑定出一種或多種腫瘤抗原作為治療靶點，再獲得特異識別腫瘤抗原的的TCR序列;然後採用基因工程技術，將編碼抗原特異的TCR基因序列導入患者自身T細胞中，從而獲得特異識別腫瘤抗原的TCR-T細胞。這些TCR-T細胞通過體外培養進行大量擴增之後，被回輸到患者體內以殺死腫瘤細胞。
值得一提的是，Adaptive的野心並不是空談，它已經有多個產品獲得FDA批准。FDA通過de novo 審批通道授予clonoSEQ Assay檢測和商業化許可，clonoSEQ Assay可使用骨髓樣本中的DNA檢測和監測多發性骨髓瘤(MM)和B細胞急性淋巴細胞性白血病(ALL)患者的最小殘留疾病(MRD)。
其旗下ClonoSEQ MRD平臺，對血液中的MRD(微小殘留白血病)極敏感，可以檢測到低至1個細胞的水平。
clonoSEQ是第一個也是唯一一個FDA授權的用於MRD測試的體外診斷測定法。同時也是第一個通過免疫測序技術獲得FDA批准的臨床診斷工具。
clonoSEQ利用Adaptive的專有免疫測序平臺來鑑定和定量惡性細胞中發現的特定DNA序列，使臨床醫生可以在治療期間和治療之後評估和監測MRD。
該檢測方法可對MRD進行標準化，準確和靈敏的測量，從而使醫生能夠預測患者的預後，評估隨時間推移對治療的反應，在緩解期間監視患者並檢測潛在的復發。
血液惡性腫瘤的臨床實踐指南認識到，MRD狀態是臨床結果和對治療反應的可靠指標，並且臨床結果與診斷為ALL和MM的患者的clonoSEQ Assay測量的MRD水平密切相關。
Adaptive的clonoSEQ還獲得了藥企AbbVie的青睞，將clonoSEQ用於藥物研發中，clonoSEQ作為一種準確可靠的方法來評估對新療法對於患者生活水平的改善。在2019年12月雙方達成了一項多年期合作。雙方的合作是以支持AbbVie的藥物venetoclax在多發性骨髓瘤這一疾病中的臨床試驗。
眾所周知，精準診斷和個性化醫療是疾病治療的未來趨勢。但繪製一個人的基因圖譜，並考慮他們的表觀遺傳學和他們的生活方式等已經足夠複雜，而這對於疾病診斷和治療還遠遠不夠。
如果TCRs可以被繪製出來，從而可以更快地診斷。但目前還不清楚的是，映射的TCRs是否真的能夠為更多種類的疾病提供必要的診斷線索。
然而，它可能與遺傳學、表觀遺傳學和其他健康數據來源一起，補充診斷工作。
兄弟創業，希望打造免疫診斷領域MRI
Adaptive Biotechnologies由Harlan和 Chad Robin兩兄弟共同創立。2009年9月，Robin和他的兄弟創立了這家公司。Chad負責公司管理，尋找商業夥伴。ChadRobin擁有賓夕法尼亞大學沃頓商學院的MBA學位和康奈爾大學的管理經濟學學士學位。
而哈蘭是首席科學官，他在弗雷德·哈欽森(Fred Hutch)癌症研究中心擔任計算生物學項目負責人長達13年。(哈蘭曾在Adaptive和Fred Hutch擔任雙重職位，直到Adaptive申請IPO時離開Fred Hutch)。
除了兩兄弟，Adaptive的總裁Julie Rubinstein曾在輝瑞公司(Pfizer Inc.)的腫瘤學部門擔任全球商業發展職務，主要致力於癌症免疫療法。
有趣的是， Chad Robin曾在採訪中表示，公司的成功歸功於他母親，因為母親常常會耐心地傾聽，同時調停兩人之間的矛盾。
Adaptive的CEO Chad Robins一次採訪中表示:「最終，這將成為『免疫檢查』或年度體檢的其中一部分，它將對人們的生物系統進行檢查。就像用進行核磁共振或x射線對我們的免疫系統進行檢查一樣普遍。」他認為第一次基於免疫系統的檢測將在未來兩年內進行。
（編輯：郭璇）